GENEL TANIM / GENERAL DESCRIPTION

(1)

2021 - 2022 / 9105016152014 - The Use of The PCR -DNA Sequencing Method in Disease Diagnosis / The Use of The PCR -DNA Sequencing Method in Disease Diagnosis

GENEL TANIM / GENERAL DESCRIPTION

Ders Adı / Course Name The Use of The PCR -DNA Sequencing Method in Disease Diagnosis / The Use of The PCR -DNA Sequencing Method in Disease Diagnosis Ders Kodu / Course Code 9105016152014

Ders Türü / Course Type

Ders Seviyesi / Course Level Third Cycle / Third Cycle

Ders Akts Kredi / ECTS 9.00

Haftalık Ders Saati (Kuramsal) / Course Hours For Week (Theoretical)

2.00

Haftalık Uygulama Saati / Course

Hours For Week (Objected) 2.00 Haftalık Laboratuar Saati / Course

Hours For Week (Laboratory) 0.00 Dersin Verildiği Yıl / Year 1

Öğretim Sistemi / Teaching System Face to Face / Face to Face Eğitim Dili / Education Language Turkish / Turkish

Ön Koşulu Olan Ders(ler) /

Precondition Courses Lisans mezunu olması, hücre moleküler biyolojisi ve moleküler genetik konusunda dersleri

alması tavsiye edilir. First cycle graduates must be. It is recommended to take courses about cell and

molecular biology, molecular genetics Amacı / Purpose Bu dersin amacı öğrencilerin; DNA analiz yöntemlerini, DNA dizileme sistemlerini ve

uygulama alanlarını, rutin tanıda ve araştırma çalışmalarında nasıl kullanılması, sonuçların nasıl değerlendirilmesi ve yorumlamasını öğretmektir.

The aim of this course is to teach students DNA analysis methods, DNA sequencing systems as well as their application areas and use in routine and research studies, evaluation and interpretation of results.

İçeriği / Content Yöntemin tarihçesi, farklı teknolojik uygulamaları, uygulama alanları, yorumlanması ve tanı

ve ya araştırmadaki yerini içermektedir. It includes history of the method, its different technological applications, application areas, interpretation and its role in diagnosis or research

Önerilen Diğer Hususlar / Recommended Other Considerations

Yok None

Staj Durumu / Internship Status Yok None

Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar / Books / Materials / Recommended Reading

1. Molecular genetics of drug resistance,Hayes,John D,Wolf,C.Roland

2. The World of the Cell, 7th Edition Wayne M. Becker, Lewis J. Kleinsmith, Jeff Hardin, and Gregory Paul Bertoni

3. Human Molecular Genetics by Tom Strachan and Andrew Read 4. Molecular Biology of the Cell:

Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, and Martin Raff 5.Basic techniques in molecular biology:Surzycki,Stefan Öğretim Üyesi (Üyeleri) / Faculty Prof.Dr. Afig BERDELİ

(2)

ÖĞRENME ÇIKTILARI / LEARNING OUTCOMES

1 DNA molekülü DNA molecules

2 DNA eldesi ve analiz yöntemleri DNA extraction and analysis methods

3 DNA sekansı nedir What is the DNA sequence?

4 DNA sekans analizinin kullanım alanları Research for DNA sequence analysis

5 Araştırma amaçlı DNA sekans analizi Routine diagnosis analysis implementation of DNA sequence

6 Rutin tanıda DNA sekans analizinin uygulanması Determination of DNA sequence analysis, and variants

7 DNA sekans analizi ve varyantların belirlenmesi DNA sequence analysis and identification of variant

8 DNA sekans analizinin yorumlanması ve ya protein yapısına etkisinin belirlenmesi Interpretation of the effect of DNA sequence analysis and determination of protein structure

HAFTALIK DERS İÇERİĞİ / DETAILED COURSE OUTLINE

(3)

Hafta / Week

1

Teorik Dersler / Theoretical Öğretim Yöntem ve

Teknikleri/Teaching Methods Techniques

Ön Hazırlık / Preliminary

Uygulama Lab

Sanger Yöntemi Tarihçesi History of the sanger method

2

Farklı DNA dizileme sistemleri Different DNA sequencing systems

3

Sekans analizinin kullanım alanları Uses of sequence analysis

4

DNA sekans için gereken kimyasallar Chemicals required for DNA sequence

5

DNA dizi analizinin tanıda kullanımı The diagnostic use of DNA sequencing

(4)

6

DNA dizi analizinin gen haritalanmasında kullanımı DNA sequence analysis using the mapped gene

7

Sekans analizinin temel prensipleri The basic principles of sequence analysis

8

Arasınav Midterm Exam

9

Yeni Nesil Sekans yöntemleri New Generation Sequence methods

10

Prenatal tanıda kullanımı

The use of prenatal diagnosis

(5)

12

Böbrek hastalıklarında DNA dizi analizi kullanımı DNA sequence analysis using the renal disease

13

Farklı hastalıklarda yeni nesil DNA dizi analizi kullanımı DNA sequence analysis using the new generation of various diseases

14

Nörodejeneratif hastalıklarda DNA dizi analizi kullanımı DNA sequence analysis use in neurodegenerative diseases

15

Kan hastalıklarında DNA dizi analizi kullanımı DNA sequence analysis of the use of blood diseases

16

Final sınavı Final Exam

(6)

DEĞERLENDİRME / EVALUATION

Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri / Term (or Year) Learning Activities Sayı /

Number

Katkı Yüzdesi / Percentage of Contribution (%)

100 1

Ara Sınav / Midterm Examination

Toplam / Total: 1 100

Başarı Notuna Katkı Yüzdesi / Contribution to Success Grade(%): 40

Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri / End Of Term (or Year) Learning Activities Sayı /

Number

Katkı Yüzdesi / Percentage of Contribution (%)

100 1

Final Sınavı / Final Examination

Toplam / Total: 1 100

Başarı Notuna Katkı Yüzdesi / Contribution to Success Grade(%): 60

Etkinliklerinin Başarı Notuna Katkı Yüzdesi(%) Toplamı / Total Percentage of Contribution (%) to Success Grade: 100

Değerlendirme Tipi / Evaluation Type:

(7)

İŞ YÜKÜ / WORKLOADS

Ara Sınav / Midterm Examination 1 3.00 3.00

Final Sınavı / Final Examination 1 3.00 3.00

Quiz / Quiz 1 3.00 3.00

Derse Katılım / Attending Lectures 14 4.00 56.00

Soru-Yanıt / Question-Answer 5 7.00 35.00

Beyin Fırtınası / Brain Storming 5 7.00 35.00

Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma / Individual Study for Mid term Examination 1 55.00 55.00

Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma / Individual Study for Final Examination 1 80.00 80.00

Sayı / Number

Süresi (Saat) / Duration

(Hours)

Toplam İş Yükü (Saat) / Total

Work Load (Hour) Etkinlikler / Workloads

Toplam / Total: 29 162.00 270.00

Dersin AKTS Kredisi = Toplam İş Yükü (Saat) / 30.00 (Saat/AKTS) = 270.00/30.00 = 9.00 ~ 9.00 / Course ECTS Credit = Total Workload (Hour) / 30.00 (Hour / ECTS) = 270.00 / 30.00 = 9.00 ~ 9.00

(8)

PROGRAM VE ÖĞRENME ÇIKTISI / PROGRAM LEARNING OUTCOMES

Öğrenme Çıktıları / Learning Outcomes Program Çıktıları / Program

1.1.1 1.1.2 1.1.3 1.1.4 1.1.5 1.1.6

1.DNA molekülü / DNA molecules 5 4 4 5 4 5

2.DNA eldesi ve analiz yöntemleri / DNA extraction and analysis

methods 4 5 4 5 4 5

3.DNA sekansı nedir / What is the DNA sequence? 4 5 4 5 3 5

4.DNA sekans analizinin kullanım alanları / Research for DNA

sequence analysis 4 4 4 5 4 4

5.Araştırma amaçlı DNA sekans analizi / Routine diagnosis

analysis implementation of DNA sequence 4 4 4 5 4 4

6.Rutin tanıda DNA sekans analizinin uygulanması / Determination

of DNA sequence analysis, and variants 4 5 4 5 5 5

7.DNA sekans analizi ve varyantların belirlenmesi / DNA sequence

analysis and identification of variant 4 5 4 5 5 4

8. DNA sekans analizinin yorumlanması ve ya protein yapısına etkisinin belirlenmesi / Interpretation of the effect of DNA sequence

analysis and determination of protein structure 5 5 4 5 5 4

Katkı Düzeyi / Contribution Level : 1-Çok Düşük / Very low, 2-Düşük / Low, 3-Orta / Moderate, 4-Yüksek / High, 5-Çok Yüksek / Very high