HETEROSİKLİKLER
Yapıları/Sınıflandırılmaları/İsimlendirilmeleri
• Heterosiklik bileşikler halka yapılarında C atomları yanında bir ya da birden çok
heteroatomlar içerirler. Yapıya katılan heteroatomların türlerine göre
heterosiklikler;
• N-heterosiklikler (azot içerenler)
• O- heterosiklikler (Oksijen içerenler)
• S-heterosiklikler (Kükürt içerenler)
olmak üzere sınıflandırılabilirler.
Biyokimyasal açıdan önemli heterosikliklerin iskeletleri
• 5’li halka:
• pirol
N H
• Hem’i oluşturan porfirin halkasında
• Bilirubin
• Alkaloid
• İmidazol
N N
H
• Bazik
• Histidin
Tiazol
• N
S
• B1 vitamini
• İmidazol ve Tiazol sentetik ilaçların
(metramidazol, sülfotiyazol) yapısında bulunurlar.
6’lı halka
• Piridin
N
• Bazik
• B6 vitamini, nikotinamid
• Tüberküloz ilacı (izonikotinik asit hidrazit)
Pirimidin (1,3 diazin)
• N
N
• Bazik
• Nükleik asit bazı
• B grubu vitaminleri (tiamin, riboflavin, folik asit)
• alkaloid
• İndol halkası
N H
Triptofan aminoasidinin yapısında
Pürin= pirimidin+imidazol
• Nükleik asit bazı
Porfirinler
porfirin halka sistemi içeren renkli maddelerdir.
Porfirin halka sisteminin en basit temel maddesi pirol halkasıdır.
Porfirin halka sistemindeki pirol halkalarının N
atomlarına Fe, Mg, Co, Zn, Ni, Cu gibi metallerin
iyonlarının bağlanmasıyla
metaloporfirinler diye
tanımlanan çeşitli porfirin
bileşikleri oluşur.
• Hemoglobinin yapısında rol oynarlar.
• Kofaktörlerin yapısında da bu iskelet
görülür.
Aminler
Aminin kimyasal yapısı
Aminler( ana atom olarak azota sahip olan organik bileşikler ve fonksiyonel gruplardır.
Yapısal olarak aminler amonyağa benzerler.N atomlarına bağlanmış organik R örneklerinin sayılarına göre;
Primer (1xR) RNH
2Sekonder (2xR) R
2NH Tersiyer (3xR) R
3N
Kuarter (4xR) R
4N
+amonyum bileşiklerine ayrılırlar.
• Aminler
• Canlı sistemlerde en çok rastlanılan üç element C, H ve O’dir, Azot hem bitkisel hem de hayvansal kökenli doğal
bileşiklerin birçoğunda olduğu gibi, proteinlerde ve nükleik asitlerde de bulunur.
• Aminlerin birçoğu fizyolojik etkinlik
gösterirler. Örneğin, insan vücudunun
sempatik sinir sisteminin iki doğal uyarısı, norepinefrin ve epinefrin (adrenalin)’dir.
Her ikisi de β-feniletilamin’dir.
• Aminlerin isimlendirilmesinde organik örneğin isminin sonuna amin sonekinin getirilmesi kullanılır. Fakat bazı aminler trival isimler de taşırlar.
• CH
3-NH
2metil amin
• (CH
3)
2NH dimetil amin CH
3CH
3-NH
• (CH
3)
3N trimetil amin CH
3CH
3-N
CH
3• Anilin
NH
2Aminlerin özellikleri
• Polar olmaları nedeniyle, düşük karbon sayılı aminler suda iyi çözünürler.
• Azot atomlarındaki serbest elektron çiftleri
ile bir proton alabilirler (Örn: amonyak)
• NaOH gibi kuvvetli bazların ilavesinde serbest aminler tekrar oluşurlar. (H aldıkları için bazik bir özellik gösterirler).
• CH
3gibi elektron itici substituentler NH
3karşısındaki bazikliği yükseltirken, elektron alıcı substituentler bazikliği zayıflatırlar.
• Karbonamidler ve sulfonamidler suda bazik değildirler.
• Aminler ve aminlerin amonyum tuzlarından
oluşan karışımlar tampon niteliği gösterirler. Bu
nedenle bu tür karışımların çözeltilerinde tampon
denklemi kullanılabilir.
• Primer aminler aldehitlerle, bir mol su
çıkararak birleşirler ve azometinler (schiff bazları) oluşur. Reaksiyon reverzibldir.
• RNH 2 +O=CH-R R-N=CH-R+H 2 O (primer amin+aldehit Azometin+su) Bir azometinin hidrolizi tekrar amin ve
aldehiti oluşturur.
• Aminoasitlerden CO
2koparılması
(dekarboksilasyon) ile oluşan aminlere biojen aminler adı verilir.
• Biojen aminlerin çoğu kuvvetli farmakolojik etkilere sahiptir. Geri kalan kısmı da;
• Hormonların ön maddeleri,
• Koenzimlerin yapıtaşları ve
• Başka biyolojik substanslar olarak da büyük önem taşırlar.
• Özellikle aromatik aminoasitlerden oluşan
• Biojen aminler farmakolojik ve fizyolojik açıdan
önemlidirler.
MERKAPTANLAR (TİOLLER) / DİSÜLFİTLER/ SÜLFONİK ASİTLER
• Tioller (merkaptanlar) R-SH
• H
2S’ün monosubstitüsyon ürünleridir.
• SH- grubu içerirler
• İsimlendirme C iskeletinin isminin sonuna
merkaptan ya da tiol son ekinin ilavesi ile yapılır.
• R-SH
• CH
3-CH
2-SH Etilmerkaptan / Etantiyol
Disülfitler (R-S-S-R)
• S-S köprüsü (disülfit bağı) üzerinden iki organik örneğin birleşmesiyle oluşur.
• (R-S-S-R)
• CH
3-CH
2-S-S-CH
2-CH
3Dietildisülfit
Sülfonik asitler (R-SO 3 H)
• Bir alkil örneğine bağlanmış halde SO
2(OH)- (Sülfonil, SO
3H-) grubu içerirler.
• (R-SO
3H)
• C
6H
5-SO
3H (Benzolsülfonik asit)
• C
6H
5-SO
2NH
2(Benzolsülfonamid)
Özellikleri
• Merkaptanlar kötü kokulu maddelerdir ve asiditeleri nedeniyle sulu bazlarda çok iyi çözünürler.
• Ağır metal tuzlar ile güç çözünen merkaptidleri oluştururlar.
• Reverzibl bir reaksiyonla ve hafif dereceli bir
oksidasyonla uygun disülfidleri oluştururlar.
• Kuvvetli bir oksidasyonla ise sülfonik asitleri verirler.
• Aromatik sülfonik asitler, bir aromatiğin sülfonizasyonu ile elde edilir.
• Sülfonik asitlerden de sülfonamidler elde edilir.
• Biyokimyada SH- grubu içeren aminoasitlerin
oksidatif olarak birbirlerine bağlanmaları ile
oluşan disülfit köprüleri önemlidir. Sülfonamidler
ise kemoterapotikler olarak kullanılır.
ALKOLLER
• Alkoller, sp
3melezleşmesi yapmış bir karbona bir
hidroksil grubunun bağlanmasıyla oluşmuş bileşiklerdir.
– Etanol; içkilerde kullanılır.
– Propanol; antibakteriyel olarak kullanılır.
– Metanol; otomobillerde antifiriz olarak kullanılır.
• Alkoller bir veya birden fazla OH grubunu alifatik iskelette içerirler.
• Bu iskelet OH grupları yanında H atomu veya C
grupları substituentleri içerirler. Normalde bir C
atomunda en fazla bir OH grubu bulunur.
• Hidroksil grubunun bağlandığı C atomundaki
substituentlerin sayılarına göre alkoller primer,
sekonder, ve tersiyer alkoller olarak
isimlendirilirler.
Alkollerin Sınıflandırılması
• Alkoller,
– Metil – Birincil – İkincil – Üçüncül – Allilik
– Benzilik
alkoller olarak sınıflandırılırlar.
• Alkol molekülünde yer alan OH gruplarının sayılarına göre de tek ya da çok değerlikli alkoller olarak sınıflandırılırlar.
• Primer (birincil) alkoller: -OH grubu bir uçtaki karbona bağlı olup bu karbona en az iki H atomu bağlı olur.
• CH3 -CH2-OH gibi.
• R-CH2OH (Primer alkol)
• Sekonder (ikincil) alkoller: -OH grubu aradaki herhangi bir karbona bağlı olan alkollerdir. -OH grubunun bağlı olduğu karbona bir H atomu bağlı olur.
• CH3-CHOH-CH3 gibi.
R
• R-CH-OH (sekunder alkol)
• Tersiyer (üçüncül) alkoller: -OH grubu H’sı olmayan karbona bağlıdır.
• (CH3)3COH gibi.
R
R-C-OH (Tersiyer alkol)
R
R
R-C-OH (tek değerlikli) R
R
R-C-OH
R-C-OH (iki değerlikli)
R
R-C-OH R-C-OH
R-C-OH (üç değerlikli)
• İsimlendirmede kökü oluşturan hidrokarbonun
isminin sonuna –ol son ekinin ilavesi kullanılır.
• Çok değerlikli alkol örnekleri CH2-OH
CH2-OH
GLİKOL
CH2-OH
CH2-OH
CH2-OH
GLİSERİN
Fiziksel Özellikleri
• Alkollerin erime ve kaynama noktaları yapılarındaki C sayılarının artışı ile yükselir.
Fakat kaynama ve erime noktaları aynı sayıdaki
C içeren alkanlardan daha yüksektir. Bunun
nedeni, alkanlarda saptanamayan büyük bir
buharlaşma ısısı oluşturan H köprüleri oluşumu
sayesinde alkol moleküllerinin dissosiasyonudur.
• Alkollerin suda çözünürlüğü de –OH grupları
tarafından etkilenir. Hidroksil grupları moleküle
ne kadar hidrofilik karakter kazandırırlarsa suda
çözünürlük de o derecede artar.
ÖR / Düşük C sayısına sahip olanlar suda daha çok çözünürler. Karbon sayısının artması ile birlikte alkil örneklerindeki hidrofob etkileşim kuvvetlenir ve suda çözünürlükleri de daha azdır ve sadece organik çözücülerde çözünürler.
Metanol, etanol, propanol hem suda hem de
organik çözücülerde çok iyi çözünürler.
Kimyasal özellikleri
• Alkoller suda asidite göstermezler.
• Alkoller alkali metallerle (su varlığında) tuz içeren alkolatlar oluştururlar.
• Alkollerden molekül içi su ayrılması ile alkenler
oluşur.
• Primer alkoller I. aldehit II. k. asite oksitlenirler.
R-CH
2-OH R-CH=O+2H
++2e
-asit
• Sekonder alkollerin oksitlenmesi ile ketonlar oluşur.
R
2-CH-OH R
2C=O+2H
++2e
-• Tersiyer alkoller C-C bağları koparılmadan oksitlenemezler.
R
3C-OH
Alkollerin Esterleşmesi
• A.Karboksilli asitlerle esterler
• Alkoller, karboksilli asitler ve karboksilik asit türevleriyle tepkime vererek karboksilik asit esterlerini oluştururlar.
• B. İnorganik esterler
• Alkollerin İnorganik Esterleri: Alkollerin, mineral asitleri veya mineral asidi halojenürleri verdikleri bileşiklerdir.
• Nitrat esterleri (RONO
2): Nitrogliserit (gliserit trinitrat) patlayıcıdır. Patlama sırasında hızlı bir
indirgenme yükseltgenme tepkimesi olur ve çok fazla N
2, CO
2, H
2, O
2oluşur.
Organik nitratlar ve nitritler, bazı kalp hastalıklarının
sağaltımında damar genişletici (vazodilatör) olarak
kullanılır.
• Fosfat esterleri: Fosforik asit ve anhidritlerinin fosfat esterleri biyokimyada çok önemlidir.
Canlılarda meydana gelen yer değiştirme
tepkimelerinde ayrılan grup difosfat grubudur.
• Sülfatlar: Derişik sülfürik asidin alkollerle
tepkimeye girmesi monoalkil ve dialkil sülfat esterlerini oluşturur.
• Sülfonatlar: Genel formülü RSO
2OR olan organik esterlerdir. Sülfonatta alkil yada aril grubu
doğrudan doğruya S atomuna bağlanır. Bu
bileşiklere tosilatlar denir.
Alkollerin Yükseltgenmesi
• Yükseltgenme; bir atomdan elektron çıkarılması,
• İndirgenme; bir atoma elektron eklenmesi olayıdır.
• Organik tepkimelerde, eğer molekül oksijen kazanırsa veya hidrojen kaybederse
yükseltgenir.
Eğer molekül oksijen kaybeder yada hidrojen
kazanırsa indirgenir.
• Alkoller,
– Ketonlara – Aldehitlere
– Karboksilli asitlere yükseltgenebilir.
Bu yükseltgenmeler biyolojik sistemlerde
de meydana gelir.
Alkollerin Sentezlerde Kullanılması
• Alkoller
– Alkil halojenürlerin – Alkenlerin
– Karbonil bileşiklerinin – Esterlerin
sentezi için uygun başlangıç maddeleridir.
FENOLLER
• Direkt olarak benzol çekirdeğine bağlanmış OH grubu içeren aromatik hidroksilli bileşiklerdir.
OH
OH
OH
1,2 dihidroksibenzol
O-dihidroksibenzol
OH
OH
• Hidrokinon, p-dihidroksibenzol
Kinonlar
• Altılı halkada iki tane çift bağlı oksijen atomu içerirler.
• Genel olarak bağların bu şekilde
düzenlenmelerine kinoid sistem adı verilir.
O
O 1,2 benzokinon
Hidrokinon/kinon dengesi organizmanın redoks
çiftlerinde rol oynar. Kinonlar alkollerin
dehidrojenizasyonları sırasında ya da SH-
gruplarından alınması gereken hidrojenler için
temel akzeptörü oluştururlar.
• Organik kimyada en önemli fonksiyonel gruplardan biri de
"karbonil grubudur".
• Karbon ile oksijen arasında çift bağlanmanın sözkonusu olduğu fonksiyonel grup "karbonil grubu" olarak adlandırılır.
• Karbonil grubu, aldehitlerin, ketonların, karboksilik asitlerin ve karboksilik asit türevlerinin yapısında yer alır.
• Ancak bu bileşikler arasında sadece aldehitler ve ketonlar
"karbonil bileşikleri" olarak anılırlar.
C= O
Karbonil grubu
O R C H
Aldehit (R Alifatik veya Aromatik) R C R'
O
Keton (R ve R' Alifatik veya Aromatik) R C OH
O
Karboksilik Asit (R Alifatik veya Aromatik)
O
R – C – L
karboksilik asit türevleri (R alifatik veya aromatik)
L=-OR, -NH2, X
Aldehitler, primer alkollerin oksitlenmesiyle elde
edilirler.
Ketonlar, sekonder alkollerin oksitlenmesiyle elde
edilirler.
Aldehitler ve ketonlar polar olmakla birlikte molekülleri arasında hidrojen bağları meydana gelmez;
bu nedenle kaynama noktaları alkollerinkinden daha
düşüktür.
Aldehitlerin ve ketonların küçük moleküllü olanları suda çözünürler; çünkü su molekülleriyle hidrojen bağları
yapabilirler. Molekül büyüdükçe hidrofob etkiden dolayı
suda çözünürlükleri azalır.
Aldehitler ve ketonlar, reaksiyon yeteneği fazla olan
bileşiklerdir; katılma, yükseltgenme, indirgenme,
kondensasyon reaksiyonları verebilirler.
Triklorasetaldehite (kloral) su katılmasıyla uyku ilacı (hipnotik)
olarak kullanılan kloral hidrat Cl
3CCH(OH)
2 oluşur.
Aldehitler ve ketonlara alkol katılmasıyla yarı-asetaller
oluşur.
Basit şekerlerin pek çoğu başlıca halkalı yarı-asetal
yapısında bulunur.
Aldehitler ve ketonlar tiyollerle tepkimeye girerek
tiyoasetalleri oluştururlar.
Aldehitler, güçlü yükseltgenlerle karboksilik asitlere yükseltgenirler.
Ketonlar, güçlü yükseltgenlerle normal koşullarda
reaksiyon vermezler.
Aldehitler yükseltgenirken yükseltgen maddeyi
indirgerler.
Aldehitlere yükseltgenlerin etkisi, aldehitleri tanıma reaksiyonları bakımından önemlidir. Tollens
belirteci, aldehitlerle sıcakta gümüş aynası verir.
Fehling belirteci, aldehitlerle sıcakta kiremit
kırmızısı Cu
2O çökeltisi verir.
Farklı indirgenler, aldehitleri primer alkollere indirgerler.
Farklı indirgenler, ketonları sekonder alkollere indirgerler.
Aldehitlerin ve ketonların önemli bir reaksiyonu,
enolleşme reaksiyonudur.
Karbonil bileşiklerinin keto ve enol şekilleri, özel tipte
yapı izomerleridir.
Birbirine dönüşebilen keto ve enol hallerine
tautomerler denir ve onların birbirine dönüşümüne
tautomerleşme adı verilir.
Karbonil bileşiklerinin aldol kondensasyon reaksiyonu da
önemlidir.
Formaldehit (HCHO), normal şartlarda gaz halde,
karakteristik kokulu bir maddedir; endüstride metanolden
elde edilir.
Formaldehit, proteinleri denatüre eder; bu nedenle
tahriş edicidir; gaz ve çözelti halinde ellere, yüze
ve göze değmesinden sakınılmalıdır.
%40’lık formaldehit çözeltisi, formol veya formalin
diye bilinir. Formolde halâ %10-15 metanol
bulunur. Formol, kuvvetli bir dezenfeksiyon
maddesidir; anatomik dokuların, organların
saklanmasında kullanılır.
Asetaldehit (CH
3CHO), renksiz, kaynama noktası 21
oC
olan, bayıltıcı kokuda bir maddedir.
Asetaldehit, asetik aside yükseltgenebilir veya etanole
indirgenebilir.
Asetaldehit, sulu asitli ortamda kolaylıkla paraldehit adında halkalı bir trimer verir.
Paraldehit özel kokulu bir sıvıdır; bir zamanlar uyku ilacı olarak kullanılmıştır; nefeste kötü bir koku
oluşturur.
Aseton (CH
3COCH
3), kaynama noktası 56
oC ve kendine has kokusu olan bir sıvıdır.
Asetonun organik bileşikleri çözme gücü yüksektir;
genellikle çözücü olarak kullanılır.
Aseton; su, etanol ve eterle kolayca karışır.
Aseton, diabetes mellituslu hastaların vücudunda
patolojik olarak fazla miktarda oluşur; idrarla ve
solunumla atılır.
Karboksilli asitler
Karboksilli asitler, genel formülleri RCOOH şeklinde
olan organik bileşiklerdir.
Formik asit, asetik asit, propiyonik asit ve butirik
asitler suda çözünürler. Daha fazla karbonlu
karboksilli asitlerde R grubunun hidrofob etkisi
ortaya çıkar ve çözünürlük gittikçe azalır.
Karboksilli asitler, primer alkol ve aldehitlerin
yükseltgenmeleriyle, nitrillerin hidroliziyle elde
edilebilirler.
Karboksilik asitler zayıf asitler olmakla birlikte alkali
ve toprak alkali hidroksitleri, karbonatları ve
bikarbonatlarıyla tuz oluşturabilirler; amonyak ve
aminlerle de amonyum asetat (CH
3COONH
4) ve
metil amonyum asetat (CH
3COOH
3NCH
3) gibi
tuzlar oluşturabilirler.
Karboksilli asitler alkollere indirgenebilirler.
Karboksilli asitlerin dekarboksilasyonu ile alkanlar
oluşur.
Karboksilli asitlerin -hidrojeninin (veya
hidrojenlerinin) yerine, fosforun katalitik etkisiyle,
halojen geçmesi sonucu -Halojen karboksilli asitler
oluşur.
-Halojen karboksilli asitlerin halojenleri yerine çeşitli nükleofillerin girmesiyle karboksilli asitlerin çok sayıda türevleri yapılabilir.
nükleofiller, üzerinde elektron çifti bulunan atom veya
atom gruplarıdır. Nükleofiller, yüksüz veya anyon
şeklinde olabilirler.
Karboksilik asitlerin katıldığı reaksiyonlarda,
karboksilik asidin karboksil (COOH) grubundaki H
yerine metal veya alkil grupları geçebilir. Böylece
sodyum asetat (CH
3COONa) ve etil asetat
(CH
3COOC
2H
5) gibi maddeler meydana gelir.
Karboksilik asitlerin katıldığı reaksiyonlarda,
karboksilik asidin karboksil (COOH) grubundaki -OH
yerine halojen, azot, kükürt gibi heteroatomlu gruplar
geçebilir. Böylece karboksilik asidin türevleri meydana
gelir.
Asit klorürleri (RCOCl), karboksilik asidin -OH
grubu yerine Cl geçmesiyle oluşurlar.
Asit klorürleri, genellikle uçucu sıvılardır ve su
ile kolay hidroliz olurlar; asit klorür şişesinin
kapağı açıldığında, hava nemiyle hidrolizden
dolayı duman çıktığı gözlenir.
Asit klorürleri (RCOCl), karboksilik asitlerin diğer türevlerini elde etmek için anahtar bileşiklerdir.
Asit klorürleri (RCOCl), bazı bileşiklerin sentezinde ve
alkollerin, aminlerin, türevlerini yaparak tanıma
reaksiyonlarında sık kullanılan bileşiklerdir.
Karboksilik asit anhidritleri (RCOOOCR),
karboksilik asitlerin ısıtılmasıyla oluşurlar.
Esterler, karboksilik asitler ile alkollerden oluşurlar.
Esterlerin değişik kullanım alanları vardır.
Etil asetat, metil asetat, etil format gibi küçük moleküllü
esterler, ekstraksiyon çözücüsü ve boya seyreltme
çözücüsü (tiner) olarak çok kullanılırlar.
Butirik asit, valerik asit gibi karboksilik asitlerin bazı
esterleri elma, armut, muz gibi meyve kokusunda
olduğundan yiyecek ve içeceklere yapay koku vermek
için kullanılırlar.
Aromatik esterler parfüm olarak kullanılırlar.
Gliserinin yağ asidi triesterleri, hayvansal ve bitkisel
yağları oluşturan trigliseridlerdir.
Trigliseridlerin baz (örneğin NaOH) katalizli
hidrolizleri, yağ asitlerinin sodyum tuzları karışımını
verir. Olay sabunlaşma (saponifikasyon) olarak
adlandırılır, oluşan madde sabun olarak adlandırılır.
Tioesterler, yüksek enerjili bileşiklerdir; organizmada
sentez reaksiyonlarında önemlidirler.
Amidler, monoaçil amonyak yapısındadırlar.
Amidlerin en belirgin
özellikleri, oldukça polar
bileşikler olmalarıdır.
Diaçil amonyak türevlerine imidler denir.
GLİSERİN VE KARBOKSİLLİ ASİT TÜREVLERİ
• Katı ve sıvı yağlar
• Uzun zincirli yağ asitlerinin gliserin esterleridir. Genelde hayvansal yağlar içinde palmitik-, stearik- ve oleik asidin esterleri yer alır.
• Yağlar, oleik asitte olduğu gibi yapısında çift bağları
içeren yağ asitleri gliserin esterlerinden oluşmuşlarsa
oda ısısında sıvı haldedirler (sıvı yağlar).
• Sıvı yağlardaki çift bağların sayısı çift bağlara iyot additisyonu ile belirlenebilir ve 100 gram yağın bağlayabildiği iyodun gram cinsinden değerine iyot sayısı adı verilir.
• Yağların alkalilerle hidrolizi gliserin yanında uzun zincirli
yağ asitlerinin tuzlarını verir. Bu uzun zincirli yağ
asitlerinin tuzlarına sabun, olaya da sabunlaşma adı
verilir.
• Karboksilli asitlerden biyokimyasal açıdan
önemli türevler oluşur. İnsan ve memelilerin
protein metabolizması son ürünü olan üre
karboksilli asitlerin diamidi’dir.
POLİFONKSİYONEL MOLEKÜLLERİN STEREOİZOMERLERİ
• Birden fazla fonksiyonel grup içeren molekülller, bir başka değişik
polifonksiyonel moleküllerde çoğu kez 4 ayrı substituentin bağlandığı karbon
atomları bulunur. BU tür karbon atomlarına asimetrik karbon atomu adı verilir ve bu
karbon atomları asimetri merkezini
oluştururlar.
• Asimetrik C atomunda yer alan substituentlerin boşluktaki konumlarının ( konfigürasyonlarının) belirlenmesinde R/S ve D/L isimlendirilmesi
prensibi kullanılır.
• Bu tanımlamada iki kriter gözönüne alınır:
1- Önce asimetrik karbon atomuna bağlı
substituentler azalan elektronegativitelerine göre sıralanırlar.
2-Elektronegativitesi en düşük olan substituent
çoğunlukla H, gözlemcinin en uzağında duracak şekilde yerleştirilir. Diğer substituentler
gözlemcinin karşısına yerleştirilir.
• Birbiri ardına dizilen bu üç substituent
elektronegativitelerine göre soldan sağa doğru bir diziliş gösteriyorlarsa moleküle R (D)- formu, sağdan sola doğru bir diziliş gösteriyorlarsa
moleküle S (L)- formu adı verilir. (Dizilişin elektronegativitesi yüksekten düşüğe doğru gözleneceği unutulmamalıdır).
• Asimetrik C atomunda yer alan diğer iki
substituentten heteroatom içereni sağda ise D-
form, solda ise L- form sözkonusudur.
• Bir molekül iki asimetri merkezine sahipse bu molekülün 4 ayrı stereoizomerinin
varlığı düşünülür ve iki çift optik izomeri kurulabilir.
• Cl>SH>OR>OH>NH2>COOH>CHO>CH2
OH>CH3>H (elektronegativite yüksekten
düşüğe doğru)
COOH
OH CH3 R-laktik asit COOH
H3C OH S-laktik asit
COOH
H C OH
CH3 D-laktik asit COOH
HO C H
CH3 L-laktik asit
Hidroksi- ve Ketokarboksilli asitler
• Hidroksi- ve ketokarboksilli asitler
karboksil grupları yanında ilave olarak hidroksi- veya karbonil grupları içerirler.
• Alifatik örneklerinde OH grup ya da
gruplarının yerleri α, β..γ gibi harflerle ya da 2,3.. gibi rakamlarla belirtilir. Aynı
durum keto asitler için de geçerlidir.
• Birçok α-hidroksi- ve ketoasitler için trival
isimler kullanılmaktadır.
Hidroksi asitler
COOH CHOH
CH3 LAKTİK ASİT, α-hidroksi propiyonikasit COOH
CH2 CHOH
CH3 β-hidroksibütirik asit
COOH CHOH
CH2OH Gliserik asit, 2,3 dihidroksi propiyonikasit COOH
CHOH CHOH
COOH Tartarik asit, α,β dihidroksitartarik asit, şarap asidi
Ketoasitler (Aminoasitlerin biyosentezi için önemlidir)
COOH C=O
CH3 Pirüvik asit, α-ketopropiyonik asit COOH
C=O CH2
COOH Okzalasetik asit, α-ketosüksinik asit
COOH C=O CH2 CH2
COOH α-ketoglutarik asit COOH
CH2 C=O
CH3 Asetoasetik asit, β-ketobütirik asit
Özellikleri
• Hidroksi- ve ketoasitler fonksiyonel gruplarının niteliklerini gösterirler.
• Suda iyi çözünürler.
• Birbirlerine dönüşebilirler (redoks reak.)
• α- ve β-hidroksiasitler kolaylıkla molekül içi esterler oluşturabilirler.
• Hidroksi asitler oksidasyonla ketoasitlere
dönüşürlerken, redüksiyonu tekrar hidroksi
asitleri verir.
COOH COOH
CHOH C=O + 2H + + 2 e - CH3 CH3
• α- ve β-hidroksiasitler kolaylıkla molekül içi esterler oluştururlar.
• Ketoasitler oda ısısında bile dekarboksile olurlar ve ketonlar oluşur. Ör/
asetoasetikasitten aseton meydana gelir.
CH3-C-CH2-COOH CH3-C-CH3 + CO2 O O
Asetoasetik asit aseton
AMİNOASİTLER VE PEPTİDLER
• Aminoasitler proteinlerin yapıtaşlarıdır ve
doğadaki proteinlerin yapılarında α-aminoasitler yer alır. Fakat doğada çok az miktarlarda β- ve D- aminoasitler de bulunur.
• Aminoasitler αkarbona tomlarına bağlı R- yan zincirlerine göre birbirlerinden ayrılırlar.
• R- örneği ikinci bir –COOH grubu, ya da ikinci bir bazik merkez (NH2- grubu ya da bazik bir
heterosiklik) veya bir SH –grubu içerebilir.
• Aminoasitler yapılarında bulunan karboksil ve amino gruplarının sayılarına göre
sınıflandırılabilir.
Mono-amino mono-karboksilik asitler Mono-amino di-karboksilik asitler
Di-amino mono-karboksilik asitler
Di-amino di-karboksilik asitler
• Glisin hariç tüm amino asitler asimetrik α- karbon atomuna sahiptirler ve enantiomer D ve L-şekilleri vardır. Fakat doğadaki
proteinlerin yapılarına katılan hemen tüm aminoasitler L-aminoasitlerdir.
• Asimetrik karbon atomuna sahip olmaları nedeniyle aminoasitlerin çözeltileri optikçe aktiftirler ve bazıları ışığın salınım
düzlemini sağa (+) çevirilerken, bazıları
sola (-) çevirir.
D veya L tanımı amino asit ‘in R grubuna D veya L tanımı amino asit ‘in R grubuna
en uzakta bulunan asimetrik karbon’un en uzakta bulunan asimetrik karbon’un
Heteroatomunun (NH
Heteroatomunun (NH
22) sağda veya solda ) sağda veya solda olmasına göre tanımlanır.
olmasına göre tanımlanır.
L-Amino asit
NH2
D-Amino asit
• Kuvvetli asit ortamda aminoasitler katyon formundadırlar ve elektriksel bir alan
yerleştirilirse katoda doğru göçerler.
• Kuvvetli alkali ortamlarda ise, aminoasitler
anyonlar olarak bulunurlar, elektriksel alanda anoda göçerler.
• Zwitteriyon formunun maksimale ulaştığı bir pH noktasında ise aminoasitler elektriksel alanda hareket etmezler ve bu pH noktasına izoelektrik pH adı verilir. Bu pH değerinde zwitteriyonlar eşit sayıda (+) ve (-) yüke sahiptirler.
• Zwitteriyonik yapı aminoasitlerin suda kolay
çözünmelerinin nedenini açıklar.
İzoelektik noktalarında ise , H iyonları, COOH grubundan, NH
2grubuna geçerler. Yani bir amino asit molekülünde, COOH grubu H iyonunu verdiği için negatif yük taşıyan bir COO
-grubu, bu H’i aldığı için yükü pozitif olan NH
3grubu ile yan yana bulunur Hem pozitif hem de negatif yük taşıyan iyonlara
zwitterion denir.
Zwitterion oluşturabilen maddelere de amfolit adı
verilir.
PEPTİT BAĞLARI
Peptid bağları kurulurken,
Amino asitlerden birinin karboksil grubu ile diğerinin amino grubu yan yana gelirler ve aralarından bir molekül su vererek
peptid bağını kurarlar.
•birçok a.a. Peptid bağı ile bağlanırsa sırasıyla di, tri, tetra, penta vb peptidler oluşur.
•10’dan az a.a. Birbiriyle bağlanırsa oluşan peptide genel olarak oligopeptid adı verilir.
•10’dan fazla a.a. İçeren peptidlere polipeptidler, 1002den fazla a.a. Kapsayan peptidlere makropeptidler adı verilir.
•İsimlendirme karboksil grubu peptid bağına
katılan a.a.in ismini sonuna –il eki getirilir.
Peptid sentezi
•Oldukça basit yapıda peptidlerin hormon ya da doku hormonları olarak önemli rol oynamaları ve ilaç endüstrisinde büyük ilgi görmeleri nedeniyle peptidlerin saf kimyasal sentezleri büyük ilgi toplamaktadır.
•Peptid sentezinde temel ilke, karboksil
grubunun bir türevi ile bir a.a.in amino
grubunun reaksiyonuna sokulmasıdır.
Protein Molekülünün Yapısı
•Primer Yapı (Amino asit sekansı)
•İkincil yapı (Zincir konformasyonu)
•Üçüncül yapı (tersiyer yapı)
•Dördüncül yapı (kuarterner yapı)
PRİMER YAPI
Amino asitlerin molekül içindeki dizilim sıraları
-Molekül başlangıcında yer alan amino asit serbest bir amino
zincir sonunda yer alan amino asitte serbest karboksil grubuna
sahiptir.
SEKONDER YAPI
Alfa heliks yapısı:
Peptid zincirinin bir eksen etrafında helezon şeklinde kıvrılmasıyla meydana Gelir.
Beta-heliks yapısı:
İki veya daha fazla sayıda
polipeptid zincirinin H
bağları ile birbirine bir-
leşmesiyle meydana gelen
yapı.
TERSİYER YAPI
•Hidrojen köprüsü bağları
•Disülfid bağları
•İyonik ilşkiler
•Hidrofob bağlar
Üçüncül yapı bu tür bağlar aracılığı ile oluşturulan
protein molekülünün üç boyutlu asimetrik yapısıdır
Bu bağlar sayesinde protein molekülü kendi etrafında katlanır,
Kıvrılır ve elipsoid ya da globüler bir yapı kazanır.
Üçüncül yapı özellikle proteinlerin fonksiyonel niteliklerini
yerine getirebilmeleri açısından büyük önem taşır.
Primer- sekunder-tersiyer
Globuler protein şeklinde katlanmış peptid zincirleri sık sık
daha büyük yapılı agregatlar halinde bir araya gelirler. Bir
araya gelmiş bu toplu yapıya dördüncül yapı denir.
Primer-sekonder-tersiyer-quarter yapı
DENATÜRASYON
Bir proteinin çözünür formdan çözünmez forma geçişi denatürasyon olayı ile bağlantılıdır.
Denatürasyonda proteinin düzenli yapısı (2.il ve 3.ül) değişir ya da tümüyle ortadan kalkar.
Çözünürlük yanında protein kristalize olma yeteneğini ve aktivitesini kaybeder.
Denatüre olmuş proteinler proteolitik enzimler tarafından kolaylıkla
parçalanabilirler.
Denatürasyon doğal yapının bozulmasıdır. Doğal yapının
bozulması için de protein molekülünün birtakım etkenlere
maruz kalması gerekmektedir. Denatürasyon olayının olması
için peptid bağlarının çözülmesi şart değildir. Protein
molekülünün, katlarının açılması ve değişik bir biçimde tekrar
katlanması yani 2. ve 3. yapılardaki değişiklikler de protein
molekülünün niteliklerini değiştirir. 3. yapının bozulması geri
dönebilir bir denatürasyon olduğu halde, 2. yapının bozulduğu
durumlarda oluşan denatürasyonun geriye dönüşü yoktur.
Proteinlerin doğal yapısının bozulmasıdır.
Denatürasyon nedenleri:
•Asit de bekletme (pH:4 )
•Alkali’de bekletme(pH:10
•Etonolde çözme
•Isı (50-60ºC )
•Konsantre üre çözeltisi
•UV ışınları
•X ışınları
•Kuvvetli çalkalama
•Dondurup çözmr
•Yüksek basınç
)
KARBONHİDRATLAR
Polihidroksi aldehitler, ketonlar veya bunların türevleri olarak tanımlanan
karbonhidratlar biyolojik moleküllerin üçüncü büyük kısmını oluştururlar.
Şekerler veya sakkaritler olarak da isimlendirilen bu grup bileşikler,
(CH
2O)
ngenel formülü ile gösterilir. Ancak genel formüle uyduğu
halde karbonhidrat olmayan (Laktik asit (C
3H
6O
3), asetik asit
(C
2H
4O
2)), genel formüle uymadığı halde karbonhidrat olan
(Ramnoz (C
6H
12O
5)bileşikler de vardır.
SINIFLANDIRMA
Karbonhidratlar; karbon atomu sayısına, basit şeker sayısına,
taşıdığı aldehit ve keton grubuna
göre üç ayrı şekilde sınıflandırılır.
1. Karbon atomu sayısına göre
a. İki karbonlu şekerlere diozlar adı verilir ve örnek olarak glikol aldehit gösterilir.
% ChemDraw Laser Prep
% CopyRight 1986, 1987, Cambridge Scientific Computing, Inc.
userdict/chemdict 145 dict put chemdict begin/version 24 def/b{bind def}bind def/L{load def}b/d/def L/a/add L/al/aload L/at/atan L/cp/closepath L/cv/curveto L/cw/currentlinewidth L/cpt/currentpoint L/dv/div L/dp/dup L/e/exch L/g/get L/gi/getinterval L/gr/grestore L/gs/gsave L/ie/ifelse L/ix/index L/l/lineto L/mt/matrix L/mv/moveto L/m/mul L/n/neg L/np/newpath L/pp/pop L/r/roll L/ro/rotate L/sc/scale L/sg/setgray L/sl/setlinewidth L/sm/setmatrix L/st/stroke L/sp/strokepath L/s/sub
L/tr/transform L/xl/translate L/S{sf m}b/dA{[3 S]}b/dL{dA dp 0 3 lW m put 0 setdash}d/cR 12 d/wF 1.5 d/aF 10 d/aR 0.25 d/aA 45 d/nH 6 d/o{1 ix}b/rot{3 -1 r}b/x{e d}b/cm mt currentmatrix d/p{tr round e round e itransform}b/Ha{gs np 3 1 r
xl dp sc -.6 1.2 p mv 0.6 1.2 p l -.6 2.2 p mv 0.6 2.2 p l cm sm st gr}b/OB{/bS x 3 ix 3 ix xl 3 -1 r s 3 1 r e s o o at ro dp m e dp m a sqrt dp bS dv dp lW 2 m lt{pp lW 2 m}if/bd x}b/DA{np 0 0 mv aL 0 aR aL m 180 aA s 180 aA a arc cp fill}b/OA{np 0 cw -2 dv mv aL 0 aR aL m 180 aA s 180 arc 0 cw -2 dv rlineto cp fill}b/SA{aF m lW m/aL x aL 1 aR s m np 0 p mv rad 0 p l gs cm sm st gr}b/CA{aF lW m/aL x aL 1 aR s m 2 dv rad dp m o dp m s dp 0 le{pp
pp pp}{sqrt at 2 m np rad 0 rad 180 6 -1 r s 180 6 -1 r s arc gs cm sm st gr cpt e at ro}ie}b/AA{np rad 0 rad 180 180 6 -1 r a arc gs cm sm st gr}b/RA{lW m/w x np rad w p mv w w p l rad w n p mv w w n p l w 2 m dp p mv 0 0 p
l w 2 m dp n p l st}b/HA{lW m/w x np 0 0 p mv w 2 m dp p l w 2 m w p l rad w p l rad w n p l w 2 m w n p l w 2 m dp n p l cp st}b/Ar1{gs 5 1 r 3 ix 3 ix xl 3 -1 r s 3 1 r e s o o at ro dp m e dp m a sqrt/rad x[{2.25 SA DA}{1.5 SA DA}{1 SA DA}{cw 5 m sl 3.375 SA DA}{cw 5 m sl 2.25 SA DA}{cw 5 m sl 1.5 SA DA}{270 CA DA}{180 CA DA}{120 CA DA}{90 CA DA}{3 RA}{3 HA}{1 -1 sc 270 CA DA}{1 -1 sc 180 CA DA}{1 -1 sc 120 CA DA}{1 -1 sc 90 CA DA}{6
RA}{6 HA}{dL 2.25 SA DA}{dL 1.5 SA DA}{dL 1 SA DA}{2.25 SA OA}{1.5 SA OA}{1 SA OA}{1 -1 sc 2.25 SA OA}{1 -1 sc 1.5 SA OA}{1 -1 sc 1 SA OA}{270 CA OA}{180 CA OA}{120 CA OA}{90 CA OA}{1 -1 sc 270 CA OA}{1
-1 sc 180 CA OA}{1 -1 sc 120 CA OA}{1 -1 sc 90 CA OA}{1 -1 sc 270 AA}{1 -1 sc 180 AA}{1 -1 sc 120 AA}{1 -1 sc 90 AA}]e g exec gr}b/ac{arcto 4{pp}repeat}b/pA 32 d/rO{4 lW m}b/Ac{0 0 px dp m py dp m a sqrt 0 360 arc cm sm gs sg fill gr st}b/OrA{py px at ro px dp m py dp m a sqrt dp rev{neg}if sc}b/Ov{OrA 1 0.4 sc 0 0 1 0 360 arc cm sm gs sg fill gr st}b/Asc{OrA 1 27 dv dp sc}b/LB{9 -6 mv 21 -10 27 -8 27 0 cv 27 8 21 10 9 6 cv -3 2 -3 -2 9 -6 cv cp}b/DLB{0 0 mv -4.8 4.8 l
-8 8 -9.6 12 -9.6 16.8 cv -9.6 21.6 -8 24.6 -4.8 25.8 cv -1.6 27 1.6 27 4.8 25.8 cv 8 24.6 9.6 21.6 9.6 16.8 cv 9.6 12 8 8 4.8 4.8 cv cp}b/ZLB{LB}b/Ar{dp 39 lt{Ar1}{gs 5 1 r o o xl 3 -1 r e s 3 1 r s e o 0 lt o 0 lt ne/rev x
dp 0 lt{1 -1 sc neg}if/py x dp 0 lt{-1 1 sc neg}if/px x np[{py 16 div dup 2 S lt{pp 2 S}if/lp x lp 0 p mv 0 0 p l 0 py p l lp py p l px lp s 0 p mv px 0 p l px py p l px lp s py p l cm sm st}{py 16 div dup 2 S lt{pp 2 S}if/lp x lp 0 p mv 0 0 0 py lp ac 0 py 2 dv lp neg o lp ac 0 py 2 dv 0 py lp ac 0 py lp py lp ac px lp s 0 p mv px 0 px py lp ac px py 2 dv px lp a o lp ac px py 2 dv px py lp ac px py px lp s py lp ac cm sm st}{py dp 2 dv py 180 pA s 180 pA a arc st np px py s py 2 dv
py pA dp neg arcn st}{0 0 p mv 0 py p l px py p l px 0 p l cp cm sm st}{px lW 2 dv a lW -2 dv p mv rO dp rlineto px lW 2 dv a rO a py lW 2 dv a rO a p l rO lW -2 dv a py lW 2 dv a rO a p l lW -2 dv py lW 2 dv a p l 0 py p l px py p l px 0 p l cp fill 0 0 p mv 0 py p l px py p l px 0 p l cp cm sm st}{0 rO p mv 0 py px py rO ac px py px 0 rO ac px 0 0 0 rO ac 0 0 0 py rO ac cp cm sm st}{rO py p mv rO rO xl 0 py px py rO ac px py px 0 rO ac px 0 0 0 rO ac rO neg dp xl px py 0 py rO ac
cp fill 0 rO p mv 0 py px py rO ac px py px 0 rO ac px 0 0 0 rO ac 0 0 0 py rO ac cp st}{1.0 Ac}{0.5 Ac}{1.0 Ov}{0.5 Ov}{Asc LB gs 1 sg fill gr cm sm st}{Asc LB gs 0.5 sg fill gr cm sm st}{Asc LB gs 0.5 sg fill gr gs cm sm st gr
np -1 -1 sc LB gs 1 sg fill gr cm sm st}{Asc LB gs 0.5 sg fill gr gs cm sm st gr np -0.4 -0.4 sc LB gs 1 sg fill gr cm sm st}{Asc LB gs 1 sg fill gr gs cm sm st gr np -0.4 -0.4 dp sc LB gs 0.5 sg fill gr cm sm st}{Asc DLB -1 -1 sc DLB gs 1 sg fill gr gs cm sm st gr np 90 ro DLB -1 -1 sc DLB gs 0.5 sg fill gr cm sm st}{Asc gs -1 -1 sc ZLB gs 1 sg fill gr cm sm st gr gs 0.3 1 sc 0 0 12 0 360 arc gs 0.5 sg fill gr cm sm st gr ZLB gs 1 sg fill gr cm sm st}{Asc gs -1 -1 sc ZLB gs 0.5 sg
fill gr cm sm st gr gs 0.3 1 sc 0 0 12 0 360 arc gs 1 sg fill gr cm sm st gr ZLB gs 0.5 sg fill gr cm sm st}{0 0 p mv px py p l cm sm st}{gs bW 0 ne{bW}{5 lW m}ie sl 0 0 p mv px py p l cm sm st gr}{gs dL 0 0 p mv px py p l cm sm st gr}{OrA 1 16 dv dp sc 0 1 p mv 0 0 1 0 1 ac 8 0 8 -1 1 ac 8 0 16 0 1 ac 16 0 16 1 1 ac cm sm st}]e 39 s g exec gr}ie}b/Cr{0 360 np arc st}b/DS{np p mv p l st}b/DD{gs dL DS gr}b/DB{gs 12 OB bW 0 ne{bW}{2 bd m}ie sl np 0 0 p mv 0 p l st gr}b/ap{e 3 ix a
e 2 ix a}b/PT{8 OB 1 sc 0 bd p 0 0 p 3 -1 r s 3 1 r e s e 0 0 p mv 1 0 p l 0 0 p ap mv 1 0 p ap l e n e n 0 0 p ap mv 1 0 p ap l pp pp}b/DT{gs np PT cm sm st gr}b/Bd{[{pp}{[{DS}{DD}{gs 12 OB np bW 0 ne{bW 2 dv/bd x}if dp nH dv dp 3 -1 r o 2 dv s{dp bd p mv bd n p l}for st gr}{gs 12 OB 1 sc np bW 0 ne{bW 2 dv/bd x}if 1 1 nH 1 s{nH dv dp bd m wF m o o p mv n p l}for cm sm st gr}{pp}{DB}{gs 12 OB np 0 lW 2 dv o o n p mv p l bW 0 ne{bW 2 dv}{bd}ie wF m o o p l n p l
cp fill gr}{pp}{gs 12 OB/bL x bW 0 ne{bW 2 dv/bd x}if np 0 0 p mv bL bd 4 m dv round 2 o o lt{e}if pp cvi/nSq x bL nSq 2 m dv dp sc nSq{.135 .667 .865 .667 1 0 rcurveto .135 -.667 .865 -.667 1 0 rcurveto}repeat cm sm st gr}]o 1 g 1 s g e 2 4 gi al pp 5 -1 r exec}{al pp 8 ix 1 eq{DD}{DS}ie 5 -1 r 2 eq{DB}{DS}ie pp}{2 4 gi al pp DT}]o 0 g g exec}b/CS{p mv p l cw lW cW 2 m a sl sp sl}b/cB{12 OB 0 0 p mv 0 p l cm sm cw bW 0 ne{bW}{bd 2 m}ie cW 2 m a sl sp sl}b/CW{12 OB 1 sc cW lW 2 dv
a 0 o p mv 0 e n p l bW 0 ne{bW 2 dv}{bd}ie wF m cW a 1 o n p l 1 e p l cp cm sm}b/CB{np[{[{CS}{CS}{cB}{CW}{pp}{cB}{CW}{pp}{cB}]o 1 g 1 s g e 2 4 gi al pp 5 -1 r exec}{al pp p mv p l CS pp pp}{2 4 gi al pp PT cm sm cw cW 2 m sl sp sl}]o
0 g 1 s g exec clip}b/Ct{bs rot g bs rot g gs o CB CB 1 setgray clippath fill 0 setgray Bd gr}b/wD 18 dict d/WI{wx dx ne{wy dy s wx dx s dv/m1 x wy m1 wx m s/b1 x}if lx ex ne{ly ey s lx ex s dv/m2 x ly m2 lx m s/b2 x wx dx ne{b2 b1 s m1 m2 s dv}{wx}ie dp m2 m b2 a}{ex n dp m1 m b1 a}ie}b/WW{gs wD begin bs e g 2 4 gi al pp o o xl 4 -1 r 3 -1 r s/wx x s/wy x bs e g 2 4 gi al pp 4 -1 r 3 -1 r s/lx x s/ly x 0 bW 2 dv wF m o o wy wx at mt ro tr/dy x/dx x ly lx at mt ro tr n/ey x n/ex x np wx
wy p mv WI p l ex n/ex x ey n/ey x dx n/dx x dy n/dy x lx ly p l WI p l cp fill end gr}b/In{px dx ne{py dy s px dx s dv/m1 x py m1 px m s/b1 x}if lx 0 ne{ly lx dv/m2 x ly ey s m2 lx ex s m s/b2 x px dx ne{b2 b1 s m1 m2 s dv}{px}ie
dp m2 m b2 a}{ex n dp m1 m b1 a}ie}b/BW{wD begin bs e g/wb x bs e g/bb x wb 4 g/cX x wb 5 g/cY x bb 4 g cX eq bb 5 g cY eq and{bb 2 g bb 3 g}{bb 4 g bb 5 g}ie cY s/ly x cX s/lx x/wx wb 2 g cX s d/wy wb 3 g cY s d 0 bW 2 dv ly lx at mt ro tr/ey x/ex x 0 bW 2 dv wF m wy wx at mt ro tr/dy x/dx x 0 lW 2 dv wy wx at mt ro tr wy a/py x wx a/px x gs cX cY xl np px py p mv In p l lx ex s ly ey s p l ex n/ex x ey n/ey x dx n/dx x dy n/dy x wx 2 m px s/px x wy 2 m py s/py x lx ex s ly ey s p l
In p l px py p l cp fill gr end}b/Db{bs{dp type[]type eq{dp 0 g 2 eq{gs dp 1 g 1 eq{dL}if 6 4 gi al pp DS gr}{dp 0 g 3 eq{2 4 gi al pp DT}{pp}ie}ie}{pp}ie}forall}b/I{counttomark dp 1 gt{2 1 rot{-1 r}for}{pp}ie}b/DSt{o/iX x dp/iY x o/cX x dp/cY x np p mv counttomark{bs e g 2 4 gi al pp o cX ne o cY ne or{4 1 r 4 1 r}if pp pp o/cX x dp/cY x o iX eq o iY eq and{pp pp cp}{p l}ie}repeat pp st}b/SP{gs/sf x/lW x/bW x/cW x count 9 ge 7 ix 192837465 eq and{ 7 -1 r pp
6 -2 r o o xl 7 -1 r s e 7 -1 r s e 5 -1 r dv neg e 5 -1 r dv neg e sc neg e neg e xl}{xl pp pp}ifelse 1 1 S dv dp sc cm currentmatrix pp lW sl 4.0 setmiterlimit np}b end 65 76 32 13 40 80 20 20 chemdict begin SP
1060 1000 1060 780 58 Ar 840 400 960 520 58 Ar 1280 420 1160 540 58 Ar 1320 480 1200 600 58 Ar gr end
Glikolaldehit H O
C
CH 2 OH
b. Üç karbonlu şekerlere triozlar adı verilir, gliseraldehit ve dihidroksi- aseton örnek olarak gösterilir.
% ChemDraw Laser Prep
% CopyRight 1986, 1987, Cambridge Scientific Computing, Inc.
userdict/chemdict 145 dict put chemdict begin/version 24 def/b{bind def}bind def/L{load def}b/d/def L/a/add L/al/aload L/at/atan L/cp/closepath L/cv/curveto L/cw/currentlinewidth L/cpt/currentpoint L/dv/div L/dp/dup L/e/exch L/g/get L/gi/getinterval L/gr/grestore L/gs/gsave L/ie/ifelse L/ix/index L/l/lineto L/mt/matrix L/mv/moveto L/m/mul L/n/neg L/np/newpath L/pp/pop L/r/roll L/ro/rotate L/sc/scale L/sg/setgray L/sl/setlinewidth L/sm/setmatrix L/st/stroke L/sp/strokepath L/s/sub
L/tr/transform L/xl/translate L/S{sf m}b/dA{[3 S]}b/dL{dA dp 0 3 lW m put 0 setdash}d/cR 12 d/wF 1.5 d/aF 10 d/aR 0.25 d/aA 45 d/nH 6 d/o{1 ix}b/rot{3 -1 r}b/x{e d}b/cm mt currentmatrix d/p{tr round e round e itransform}b/Ha{gs np 3 1 r
xl dp sc -.6 1.2 p mv 0.6 1.2 p l -.6 2.2 p mv 0.6 2.2 p l cm sm st gr}b/OB{/bS x 3 ix 3 ix xl 3 -1 r s 3 1 r e s o o at ro dp m e dp m a sqrt dp bS dv dp lW 2 m lt{pp lW 2 m}if/bd x}b/DA{np 0 0 mv aL 0 aR aL m 180 aA s 180 aA a arc cp fill}b/OA{np 0 cw -2 dv mv aL 0 aR aL m 180 aA s 180 arc 0 cw -2 dv rlineto cp fill}b/SA{aF m lW m/aL x aL 1 aR s m np 0 p mv rad 0 p l gs cm sm st gr}b/CA{aF lW m/aL x aL 1 aR s m 2 dv rad dp m o dp m s dp 0 le{pp
pp pp}{sqrt at 2 m np rad 0 rad 180 6 -1 r s 180 6 -1 r s arc gs cm sm st gr cpt e at ro}ie}b/AA{np rad 0 rad 180 180 6 -1 r a arc gs cm sm st gr}b/RA{lW m/w x np rad w p mv w w p l rad w n p mv w w n p l w 2 m dp p mv 0 0 p
l w 2 m dp n p l st}b/HA{lW m/w x np 0 0 p mv w 2 m dp p l w 2 m w p l rad w p l rad w n p l w 2 m w n p l w 2 m dp n p l cp st}b/Ar1{gs 5 1 r 3 ix 3 ix xl 3 -1 r s 3 1 r e s o o at ro dp m e dp m a sqrt/rad x[{2.25 SA DA}{1.5 SA DA}{1 SA DA}{cw 5 m sl 3.375 SA DA}{cw 5 m sl 2.25 SA DA}{cw 5 m sl 1.5 SA DA}{270 CA DA}{180 CA DA}{120 CA DA}{90 CA DA}{3 RA}{3 HA}{1 -1 sc 270 CA DA}{1 -1 sc 180 CA DA}{1 -1 sc 120 CA DA}{1 -1 sc 90 CA DA}{6
RA}{6 HA}{dL 2.25 SA DA}{dL 1.5 SA DA}{dL 1 SA DA}{2.25 SA OA}{1.5 SA OA}{1 SA OA}{1 -1 sc 2.25 SA OA}{1 -1 sc 1.5 SA OA}{1 -1 sc 1 SA OA}{270 CA OA}{180 CA OA}{120 CA OA}{90 CA OA}{1 -1 sc 270 CA OA}{1
-1 sc 180 CA OA}{1 -1 sc 120 CA OA}{1 -1 sc 90 CA OA}{1 -1 sc 270 AA}{1 -1 sc 180 AA}{1 -1 sc 120 AA}{1 -1 sc 90 AA}]e g exec gr}b/ac{arcto 4{pp}repeat}b/pA 32 d/rO{4 lW m}b/Ac{0 0 px dp m py dp m a sqrt 0 360 arc cm sm gs sg fill gr st}b/OrA{py px at ro px dp m py dp m a sqrt dp rev{neg}if sc}b/Ov{OrA 1 0.4 sc 0 0 1 0 360 arc cm sm gs sg fill gr st}b/Asc{OrA 1 27 dv dp sc}b/LB{9 -6 mv 21 -10 27 -8 27 0 cv 27 8 21 10 9 6 cv -3 2 -3 -2 9 -6 cv cp}b/DLB{0 0 mv -4.8 4.8 l
-8 8 -9.6 12 -9.6 16.8 cv -9.6 21.6 -8 24.6 -4.8 25.8 cv -1.6 27 1.6 27 4.8 25.8 cv 8 24.6 9.6 21.6 9.6 16.8 cv 9.6 12 8 8 4.8 4.8 cv cp}b/ZLB{LB}b/Ar{dp 39 lt{Ar1}{gs 5 1 r o o xl 3 -1 r e s 3 1 r s e o 0 lt o 0 lt ne/rev x
dp 0 lt{1 -1 sc neg}if/py x dp 0 lt{-1 1 sc neg}if/px x np[{py 16 div dup 2 S lt{pp 2 S}if/lp x lp 0 p mv 0 0 p l 0 py p l lp py p l px lp s 0 p mv px 0 p l px py p l px lp s py p l cm sm st}{py 16 div dup 2 S lt{pp 2 S}if/lp x lp 0 p mv 0 0 0 py lp ac 0 py 2 dv lp neg o lp ac 0 py 2 dv 0 py lp ac 0 py lp py lp ac px lp s 0 p mv px 0 px py lp ac px py 2 dv px lp a o lp ac px py 2 dv px py lp ac px py px lp s py lp ac cm sm st}{py dp 2 dv py 180 pA s 180 pA a arc st np px py s py 2 dv
py pA dp neg arcn st}{0 0 p mv 0 py p l px py p l px 0 p l cp cm sm st}{px lW 2 dv a lW -2 dv p mv rO dp rlineto px lW 2 dv a rO a py lW 2 dv a rO a p l rO lW -2 dv a py lW 2 dv a rO a p l lW -2 dv py lW 2 dv a p l 0 py p l px py p l px 0 p l cp fill 0 0 p mv 0 py p l px py p l px 0 p l cp cm sm st}{0 rO p mv 0 py px py rO ac px py px 0 rO ac px 0 0 0 rO ac 0 0 0 py rO ac cp cm sm st}{rO py p mv rO rO xl 0 py px py rO ac px py px 0 rO ac px 0 0 0 rO ac rO neg dp xl px py 0 py rO ac
cp fill 0 rO p mv 0 py px py rO ac px py px 0 rO ac px 0 0 0 rO ac 0 0 0 py rO ac cp st}{1.0 Ac}{0.5 Ac}{1.0 Ov}{0.5 Ov}{Asc LB gs 1 sg fill gr cm sm st}{Asc LB gs 0.5 sg fill gr cm sm st}{Asc LB gs 0.5 sg fill gr gs cm sm st gr
np -1 -1 sc LB gs 1 sg fill gr cm sm st}{Asc LB gs 0.5 sg fill gr gs cm sm st gr np -0.4 -0.4 sc LB gs 1 sg fill gr cm sm st}{Asc LB gs 1 sg fill gr gs cm sm st gr np -0.4 -0.4 dp sc LB gs 0.5 sg fill gr cm sm st}{Asc DLB -1 -1 sc DLB gs 1 sg fill gr gs cm sm st gr np 90 ro DLB -1 -1 sc DLB gs 0.5 sg fill gr cm sm st}{Asc gs -1 -1 sc ZLB gs 1 sg fill gr cm sm st gr gs 0.3 1 sc 0 0 12 0 360 arc gs 0.5 sg fill gr cm sm st gr ZLB gs 1 sg fill gr cm sm st}{Asc gs -1 -1 sc ZLB gs 0.5 sg
fill gr cm sm st gr gs 0.3 1 sc 0 0 12 0 360 arc gs 1 sg fill gr cm sm st gr ZLB gs 0.5 sg fill gr cm sm st}{0 0 p mv px py p l cm sm st}{gs bW 0 ne{bW}{5 lW m}ie sl 0 0 p mv px py p l cm sm st gr}{gs dL 0 0 p mv px py p l cm sm st gr}{OrA 1 16 dv dp sc 0 1 p mv 0 0 1 0 1 ac 8 0 8 -1 1 ac 8 0 16 0 1 ac 16 0 16 1 1 ac cm sm st}]e 39 s g exec gr}ie}b/Cr{0 360 np arc st}b/DS{np p mv p l st}b/DD{gs dL DS gr}b/DB{gs 12 OB bW 0 ne{bW}{2 bd m}ie sl np 0 0 p mv 0 p l st gr}b/ap{e 3 ix a
e 2 ix a}b/PT{8 OB 1 sc 0 bd p 0 0 p 3 -1 r s 3 1 r e s e 0 0 p mv 1 0 p l 0 0 p ap mv 1 0 p ap l e n e n 0 0 p ap mv 1 0 p ap l pp pp}b/DT{gs np PT cm sm st gr}b/Bd{[{pp}{[{DS}{DD}{gs 12 OB np bW 0 ne{bW 2 dv/bd x}if dp nH dv dp 3 -1 r o 2 dv s{dp bd p mv bd n p l}for st gr}{gs 12 OB 1 sc np bW 0 ne{bW 2 dv/bd x}if 1 1 nH 1 s{nH dv dp bd m wF m o o p mv n p l}for cm sm st gr}{pp}{DB}{gs 12 OB np 0 lW 2 dv o o n p mv p l bW 0 ne{bW 2 dv}{bd}ie wF m o o p l n p l
cp fill gr}{pp}{gs 12 OB/bL x bW 0 ne{bW 2 dv/bd x}if np 0 0 p mv bL bd 4 m dv round 2 o o lt{e}if pp cvi/nSq x bL nSq 2 m dv dp sc nSq{.135 .667 .865 .667 1 0 rcurveto .135 -.667 .865 -.667 1 0 rcurveto}repeat cm sm st gr}]o 1 g 1 s g e 2 4 gi al pp 5 -1 r exec}{al pp 8 ix 1 eq{DD}{DS}ie 5 -1 r 2 eq{DB}{DS}ie pp}{2 4 gi al pp DT}]o 0 g g exec}b/CS{p mv p l cw lW cW 2 m a sl sp sl}b/cB{12 OB 0 0 p mv 0 p l cm sm cw bW 0 ne{bW}{bd 2 m}ie cW 2 m a sl sp sl}b/CW{12 OB 1 sc cW lW 2 dv
a 0 o p mv 0 e n p l bW 0 ne{bW 2 dv}{bd}ie wF m cW a 1 o n p l 1 e p l cp cm sm}b/CB{np[{[{CS}{CS}{cB}{CW}{pp}{cB}{CW}{pp}{cB}]o 1 g 1 s g e 2 4 gi al pp 5 -1 r exec}{al pp p mv p l CS pp pp}{2 4 gi al pp PT cm sm cw cW 2 m sl sp sl}]o
0 g 1 s g exec clip}b/Ct{bs rot g bs rot g gs o CB CB 1 setgray clippath fill 0 setgray Bd gr}b/wD 18 dict d/WI{wx dx ne{wy dy s wx dx s dv/m1 x wy m1 wx m s/b1 x}if lx ex ne{ly ey s lx ex s dv/m2 x ly m2 lx m s/b2 x wx dx ne{b2 b1 s m1 m2 s dv}{wx}ie dp m2 m b2 a}{ex n dp m1 m b1 a}ie}b/WW{gs wD begin bs e g 2 4 gi al pp o o xl 4 -1 r 3 -1 r s/wx x s/wy x bs e g 2 4 gi al pp 4 -1 r 3 -1 r s/lx x s/ly x 0 bW 2 dv wF m o o wy wx at mt ro tr/dy x/dx x ly lx at mt ro tr n/ey x n/ex x np wx
wy p mv WI p l ex n/ex x ey n/ey x dx n/dx x dy n/dy x lx ly p l WI p l cp fill end gr}b/In{px dx ne{py dy s px dx s dv/m1 x py m1 px m s/b1 x}if lx 0 ne{ly lx dv/m2 x ly ey s m2 lx ex s m s/b2 x px dx ne{b2 b1 s m1 m2 s dv}{px}ie
dp m2 m b2 a}{ex n dp m1 m b1 a}ie}b/BW{wD begin bs e g/wb x bs e g/bb x wb 4 g/cX x wb 5 g/cY x bb 4 g cX eq bb 5 g cY eq and{bb 2 g bb 3 g}{bb 4 g bb 5 g}ie cY s/ly x cX s/lx x/wx wb 2 g cX s d/wy wb 3 g cY s d 0 bW 2 dv ly lx at mt ro tr/ey x/ex x 0 bW 2 dv wF m wy wx at mt ro tr/dy x/dx x 0 lW 2 dv wy wx at mt ro tr wy a/py x wx a/px x gs cX cY xl np px py p mv In p l lx ex s ly ey s p l ex n/ex x ey n/ey x dx n/dx x dy n/dy x wx 2 m px s/px x wy 2 m py s/py x lx ex s ly ey s p l
In p l px py p l cp fill gr end}b/Db{bs{dp type[]type eq{dp 0 g 2 eq{gs dp 1 g 1 eq{dL}if 6 4 gi al pp DS gr}{dp 0 g 3 eq{2 4 gi al pp DT}{pp}ie}ie}{pp}ie}forall}b/I{counttomark dp 1 gt{2 1 rot{-1 r}for}{pp}ie}b/DSt{o/iX x dp/iY x o/cX x dp/cY x np p mv counttomark{bs e g 2 4 gi al pp o cX ne o cY ne or{4 1 r 4 1 r}if pp pp o/cX x dp/cY x o iX eq o iY eq and{pp pp cp}{p l}ie}repeat pp st}b/SP{gs/sf x/lW x/bW x/cW x count 9 ge 7 ix 192837465 eq and{ 7 -1 r pp
6 -2 r o o xl 7 -1 r s e 7 -1 r s e 5 -1 r dv neg e 5 -1 r dv neg e sc neg e neg e xl}{xl pp pp}ifelse 1 1 S dv dp sc cm currentmatrix pp lW sl 4.0 setmiterlimit np}b end 211 82 134 14 40 80 20 20 chemdict begin SP
3180 720 3180 520 58 Ar 3180 1240 3180 1020 58 Ar 3060 880 2900 880 58 Ar 3420 900 3300 900 58 Ar 5720 780 5720 540 58 Ar 5740 1300 5740 1080 58 Ar 6040 900 5860 900 58 Ar 6040 980 5860 980 58 Ar gr end
Dihidroksi aseton CH 2 OH
C O CH 2 OH D-Gliseraldehit
CHO H C OH CH 2 OH
c. Dört karbonlu şekerlere tetrozlar adı verilir (eritroz, eritruloz)
d. Beş karbonlu şekerlere pentozlar adı verilir (riboz, ribuloz, deoksiriboz, ksiloz).
e. Altı karbonlu şekerlere heksozlar adı verilir (glikoz, galaktoz, fruktoz).
f. Yedi karbonlu şekerlere heptozlar adı verilir
(sedoheptuloz).
2. Moleküldeki basit şeker ünitesi sayısına göre a. Monosakkaritler
Tek bir polihidroksi aldehit veya keton grubu ihtiva eden karbonhidratlardır. En önemlileri; glikoz, fruktoz, galaktoz, mannoz, riboz, deoksiriboz, gliseraldehit ve dihidroksiasetondur.
Aldehit Aldehit
Keton