Mutasyon Analiz Teknikleri III
Doç. Dr. Hilâl Özdağ
Hafta XI
PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları
Bir sonraki aşama….
1. SSCP, HA, DHPLC, TGCE benzeri bir teknikle saptadığınız ve incelediğiniz DNA fragmentinde konformasyonel değişime neden olan dizi değişiminin ne olduğunu ortaya çıkarmak,
2. İncelediğiniz DNA fragmentini bir indirekt yöntemle analiz etmeden doğrudan dizi bazında değerlendirmek,
3. Klonlamak üzere hazırladığınız DNA fragmentine klonlama öncesi aşamalarda (PCR) hatalı bir baz girip girmediğinden emin olmak için
Bir sonraki aşama DNA dizi analizidir.
DNA DİZİ ANALİZİ
PCR TEMELLİ MUTASYON ANALİZ YÖNTEMLERİ
MUTASYONU ÖNCEDEN BİLİYOR VE YENİ BİR ÖRNEK GRUBUNDA VARLIĞINI
SORGULAMAK İSTİYORSANIZ
RFLP ( Restriction Fragment Length Polymorphism)
ASA (Allele Specific Amplification)
Primer Extension
PCR TEMELLİ MUTASYON ANALİZ YÖNTEMLERİ
RFLP
AGATCT
Yabanıl Tip Allel
Mutant allel
TCTAGA
AGAGCT TCTCGA
RE kesim bölgesi
RE bölgesi kaybolmuş
PCR TEMELLİ MUTASYON ANALİZ YÖNTEMLERİ
ASA
Primer Extension :
Bağlanma:
Primere bir nt eklenmesi
Uzama: Saptama:
Floresans