• Sonuç bulunamadı

Ya¸sa-dayal¬sürekli model

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Share "Ya¸sa-dayal¬sürekli model"

Copied!
18
0
0

Yükleniyor.... (view fulltext now)

Tam metin

(1)

Ya¸sa-dayal¬sürekli model

Bir ya¸s s¬n¬f¬n¬n (say¬mlar aras¬ndaki uzunlu¼ ga da e¸sit olan) ∆τ grup uzunlu¼ gu s¬f¬ra gidecek ¸sekilde ( 12 ) ayr¬k modelini göz önüne alarak bir sürekli–zaman modeli olu¸sturabiliriz. n > k için e¸sitli¼ gi

x 1,n =

∑ k i = 1

f i x 1,n i (14)

¸seklinde yaz¬labilir. Ayr¬k modeldeki ilk ya¸s s¬n¬f¬iki ard¬¸s¬k say¬m aras¬nda do¼ gan di¸sileri içermektedir. Sürekli modelde kar¸s¬l¬k gelen fonksiyon ise x 1,n = B ( t n ) ∆τ olmak üzere tüm nüfusun di¸si do¼ gum oran¬B ( t ) olacakt¬r.

E¼ ger n–yinci say¬m¬n bir t n = n ∆τ zaman¬nda yap¬ld¬¼ g¬n¬varsayarsak, bu durumda x 1,n i = B ( t n t i ) ∆τ olur. f i = b i l i parametresinin sürekli model kar¸s¬l¬¼ g¬n¬belirlemek için, τ ya¸s¬na kadar canl¬kalan yenido¼ gan di¸silerin oran¬n¬veren ya¸sa–ba¼ gl¬ya¸ sam fonksiyonu y ( τ ) yu, ve τ ve τ + ∆τ ya¸slar¬aras¬nda bir di¸sinin do¼ gurdu¼ gu ortalama di¸si say¬s¬n¬veren, ya¸sa-ba¼ gl¬do¼gurganl¬k fonksiyonu m ( τ ) yu tan¬mlayal¬m.

Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 38 /

(2)

Ya¸sa-ba¼ gl¬net do¼ gurganl¬k fonksiyonu f ( τ ) = m ( τ ) y ( τ ) ve τ i = i ∆τ ile birlikte

f i = f ( τ i ) ∆τ e¸sitli¼ gine sahibiz. Bu yeni tan¬mlarla ( 14 ) e¸sitli¼ gi

B ( t n ) ∆τ =

∑ k i = 1

f ( τ i ) B ( t n t i )( ∆τ ) 2

¸seklini al¬r. E¸sitli¼ gi ∆τ ile bölüp, t i = τ i yi göz önüne al¬rsak sa¼ g taraf bir Riemann toplam¬na dönü¸sür. t n = t al¬p, di¸si do¼ gurganl¬k ya¸s¬n¬n

maksimumundan büyük τ lar için f ( τ ) = 0 dersek, ∆τ ! 0 durumunda ( 14 ) denklemi

B ( t ) =

Z

0

B ( t τ ) f ( τ ) d τ (15) e¸sitli¼ gine dönü¸sür.

Nuri ÖZALP (Ankara Üniversitesi) 7 !MATEMAT·IKSEL B·IYOLOJ·I7 ! Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 39 / 93

(3)

( 15 ) denkleminde B ( t ) = e rt al¬rsak, denklem e rt =

Z

0

f ( τ ) e r ( t

τ

) d τ

¸seklini al¬r. Denklemi e rt ile bölersek, Euler-Lotka denkleminin sürekli

formu olan Z

0

f ( τ ) e r τ d τ = 1 (16)

e¸sitli¼ gini elde ederiz. ( 16 ) denklemi, ya¸sa ba¼ gl¬net do¼ gurganl¬k fonksiyonu f ( τ ) verilmek üzere, r ye göre bir integral denklemidir. f ( τ ) negatif olmayan sürekli bir fonksiyon olmak üzere, ( 15 ) denkleminin tek bir r gerçek kökünün var oldu¼ gu ve nüfusun e r t ye asimptotik olarak büyüdü¼ gü ( r > 0 ) veya azald¬¼ g¬ ( r < 0 ) ispatlanabilir. Nüfus büyüme oran¬r as¬l büyüme oran¬veya Malthusyan parametresi olarak adland¬r¬l¬r.

Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 40 /

(4)

F ( r ) =

Z

0

f ( τ ) e r τ d τ 1 = 0 (17) dersek, Newton yöntemi ile, bir r = x 0 tahmini ile ba¸slayarak, çözümüne

x n + 1 = x

n

F ( x

n

) F 0 ( x

n

)

= x n +

Z

0

f ( τ ) e x

nτ

d τ 1 Z

0 τf ( τ ) e x

nτ

d τ

, n = 0, 1, 2...

ard¬¸s¬k iterasyonlar¬ile yakla¸sabiliriz.

Asimptotik olarak kararl¬bir ya¸s yap¬s¬na eri¸sildikten sonra, nüfus büyümesi e r t üstel büyümesine benzer davran¬r ki bu da r ¬n ki¸si ba¸s¬sabit do¼ gum oran¬b ve ölüm oran¬d den bulunabilece¼ gini önermektedir. Gerçekten, b ve d nin ifadelerini elde ederek r = b d oldu¼ gunu gösterebiliriz.

Nuri ÖZALP (Ankara Üniversitesi) 7 !MATEMAT·IKSEL B·IYOLOJ·I7 ! Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 41 / 93

(5)

Çiftcinsiyetli bir solucan¬n kuluçka boyutu

Genellikle do¼ gal ay¬klanma ile, evrimin r Malthusyan parametresinin en büyük oldu¼ gu nüfusla sonuçlanaca¼ g¬ve do¼ gal ay¬klanman¬n bu nüfusu olu¸sturacak di¸silerin lehine olaca¼ g¬kabul edilmektedir. "Caenorhabditis elegans", biyologlar¬n üzerinde s¬kl¬kla çal¬¸st¬¼ g¬bir model organizmad¬r.

Yakla¸s¬k 1000 hücreden olu¸san çok hücreli organizmalar¬n en basitlerinden biridir. Ço¼ gunlukla di¸si olup, iç sperm üreterek kendi yumurtalar¬n¬

dölleyebilen solucanlar ve çok az da olsa yavru üretmek için çiftcinsiyetlilerle çiftle¸smek zorunda olan erkekler.

Tipik bir solucan k¬s¬rla¸smadan önce yakla¸s¬k 250 350 döllenmi¸s yumurta üretmektedir. Do¼ gal ay¬klanma nedeniyle, bir solucan¬n hayat¬boyunca üretece¼ gi yavrular¬n belli anlamda optimal olma zorunda oldu¼ gunu kabul etmek akla uygundur. Çiftcinsiyetli bir solucan¬n kuluçka boyutunu incelemek için, bir ya¸sa–dayal¬modelin nas¬l uygulanaca¼ g¬n¬görelim.

Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 42 /

(6)

Solucan için bir matematiksel model geli¸stirmeden önce hayvan¬n ya¸sam süreci hakk¬nda daha fazla ayr¬nt¬bilmemiz gereklidir: t = 0 an¬nda döllenmi¸s yumurta olu¸sur. Yavrunun büyüme dönemi s¬ras¬nda geli¸smemi¸s solucan dört larva evresinden geçer. Dördüncü evrenin sonuna do¼ gru ve yeti¸skinli¼ ge geçmeden önceki son dönü¸sümün hemen ard¬ndan çiftcinsiyetli solucan daha sonra kullanmak için sperm üretir. Solucan daha sonra yumurta üretip, üretti¼ gi spermlerle yumurtay¬a¸s¬layarak yumurtlar. Tüm spermler kullan¬ld¬ktan sonra yumurta üretimi durur. Yavrunun büyüme evresinin 0 < t < g aral¬¼ g¬nda, sperm üretiminin g < t < g + s aral¬¼ g¬nda ve yumurta üretimi, a¸s¬lama ve yumurtlaman¬n da g + s < t < g + s + e aral¬¼ g¬nda olu¸stu¼ gunu kabul edelim.

0 g g+s g+s+e

yetişkin yavru

sperm yumurta

Figure: Bir çiftcinsiyetlinin basitle¸stirilmi¸s bir zaman çizgisi.

Nuri ÖZALP (Ankara Üniversitesi) 7 !MATEMAT·IKSEL B·IYOLOJ·I7 ! Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 43 / 93

(7)

g büyüme süreci 72 sa.

s sperm üretme süreci 11.9 sa.

e yumurta üretme süreci 65 sa.

p sperm üretme oran¬ 24/sa.

m yumurta üretme oran¬ 4.4/sa

B kuluçka boyutu 286 ad.

S olucan¬n ya¸sam–süreci modelinin tahmini parametreleri

Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 44 /

(8)

Solucan¬n sperm üretimini neden s¬n¬rlad¬¼ g¬n¬anlamak istiyoruz.

Biyologlar di¸si ve erkekleri onlar¬n boyutlar¬na ve üreme hücrelerinin metabolik maliyetine göre tan¬mlamaktad¬rlar: spermler ucuz yumurtalar ise pahal¬d¬r. Bu nedenle ilk bak¬¸sta, bir solucan¬n üretti¼ gi yavrular¬n neden üretilen yumurta say¬s¬ndan ziyade, üretilen spermle s¬n¬rl¬oldu¼ gu bir bilmecedir. Solucan¬n daha fazla sperm üretmesinin metabolizma d¬¸s¬nda gizli bir maliyeti olmak zorundad¬r. Temel biyolojiyi anlamak için iki k¬s¬t durumunu göz önüne almak aç¬klay¬c¬olacakt¬r: birincisi hiç sperm üretilmemesi, ikincisi ise sonsuz say¬da sperm üretimi durumu. Birinci durumda sperm olmamas¬ve ikinci durumda da yumurta olmamas¬

nedeniyle solucan her iki durumda da yavru üretmez. Daha fazla sperm daha fazla yavru anlam¬na gelmesine ra¼ gmen daha fazla sperm ayn¬

zamanda gecikmi¸s yumurta üretimi anlam¬na da gelece¼ ginden dolay¬, solucan¬n yumurtlamadan önce sperm üretmesi bir uzla¸sma durumudur.

Nuri ÖZALP (Ankara Üniversitesi) 7 !MATEMAT·IKSEL B·IYOLOJ·I7 ! Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 45 / 93

(9)

Do¼ gal ay¬klanman¬n en büyük r Malthusyan parametresi ile nüfus olu¸sturacak

¸sekilde solucanlar¬evrimle¸stirdi¼ gini varsayaca¼ g¬z.

Kuluçka boyutu, üretilen sperm say¬s¬na ve ayn¬zamanda yumurtlanan yumurta say¬s¬na e¸sit olup, böylece

B = ps = me (18)

olur. m ( τ ) ya¸sa–ba¼ gl¬do¼ guranl¬k fonksiyonu ve y ( τ ) da ya¸sa–ba¼ gl¬ya¸sam fonksiyonu olmak üzere, r ye göre Euler–Lotka sürekli denklemi ( 16 ) , f ( τ ) = m ( τ ) y ( τ ) için bir model gerektirmektedir. y ( τ ) fonksiyonu

y 0 ( τ ) = µ ( τ ) y ( τ ) diferensiyel denklemini sa¼ glamakta olup, basitlik için, d ya¸stan ba¼ g¬ms¬z ki¸si ba¸s¬ölüm oran¬olmak üzere, ya¸sa–ba¼ gl¬ölüm fonksiyonu için µ ( τ ) = d kabul edelim. Daha aç¬kças¬solucanlar¬n yumurtlama s¬ras¬nda ya¸sl¬l¬k nedeniyle de¼ gil, avc¬, açl¬k, hastal¬k ve di¼ ger ya¸stan ba¼ g¬ms¬z nedenlerle öldüklerini kabul edelim. Bu makûl bir kabuldür çünkü laboratuvarda solucanlar¬n

spermlerinin bitmesinden sonra haftalarca ya¸sayabildikleri gözlemlenmi¸stir.

Denklemi denklemini y ( 0 ) = 1 ba¸slang¬ç ko¸sulu alt¬nda çözersek

y ( τ ) = e d τ (19)

elde ederiz.

Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 46 /

(10)

Ya¸sa–ba¼ gl¬do¼ gurganl¬k fonksiyonu m ( τ ) , ∆τ ya¸s aral¬¼ g¬nda üretilen yavrular¬n beklenen say¬s¬m ( τ ) ∆τ olacak ¸sekilde tan¬mlan¬r. Solucan¬n g + s < τ < g + s + e ya¸slar¬nda sabit bir m oran¬nda yumurtlad¬¼ g¬n¬

varsayarsak,

m ( τ ) = m, g + s < τ < g + s + e

0, di¼ ger zamanlarda (20)

olur. ( 18 ) , ( 19 ) ve ( 20 ) kullan¬l¬rsa, Euler–Lotka denklemi ( 16 )

Z

0

f ( τ ) e r τ d τ =

Z

0

m ( τ ) y ( τ ) e r τ d τ

=

Z g + B /p + B /m

g + B /p me ( r + d )

τ

d τ = 1 (21)

¸seklini al¬r.

Nuri ÖZALP (Ankara Üniversitesi) 7 !MATEMAT·IKSEL B·IYOLOJ·I7 ! Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 47 / 93

(11)

· Integral de¼ geri hesaplan¬rsa 1 =

Z g + B /p + B /m g + B /p

me ( r + d )

τ

d τ

= m

r + d e ( g +

Bp

)( r + d ) h

1 e

Bm

( r + d ) i

veya

( r + d ) e ( g +

Bp

)( r + d ) = m h

1 e

Bm

( r + d ) i

(22) olur.

Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 48 /

(12)

Son e¸sitlik r = r ( B ) kapal¬formunda yaz¬labilir. r = r ( B ) denkleminin B nin baz¬de¼ gerleri için bir maksimuma sahip oldu¼ gunu göstermek için g , p, ve m nin Tablodaki de¼ gerleri ile,

F ( r ) = ( r + d ) e ( g +

Bp

)( r + d ) m h

1 e

Bm

( r + d ) i al¬p, verilen bir B de¼ geri için r = r 0 ba¸slang¬ç tahmini ile ba¸slay¬p,

r n + 1 = r n F ( r n ) F 0 ( r n )

iterasyonlar¬ile r çözümüne yakla¸sabiliriz. Verilen B de¼ gerleri için r = r ( B ) nin gra…¼ gi ¸ Sekilde verilmi¸stir. r nin maksimum de¼ gerinin deneysel

de¼ gerlerin %53 üne kar¸s¬l¬k gelen B = 152 civar¬nda oldu¼ gu görülmektedir.

Nuri ÖZALP (Ankara Üniversitesi) 7 !MATEMAT·IKSEL B·IYOLOJ·I7 ! Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 49 / 93

(13)

Figure: r = r ( B ) nin gra…¼ gi. B = 152 kuluçka boyutu civar¬nda Malthusyan büyüme oran¬ r maksimumdur.

Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 50 /

(14)

r nin maksimum oldu¼ gu B de¼ geri için do¼ grudan tek bir denklem de

belirleyebiliriz. B ye ba¼ gl¬tek de¼ ger r olmak üzere, ( 22 ) denkleminde B ye göre türev alarak, dr /dB = 0 maksimum olma ko¸sulunu kullan¬rsak,

( r + d ) e ( g +

Bp

)( r + d ) = pe

mB

( r + d ) (23) elde ederiz. ( 22 ) denklemini ( 23 ) denklemine oranlarsak,

1 = m p

h

e

Bm

( r + d ) 1 i

(24)

veya buradan

r + d = m

B ln 1 + p

m (25)

buluruz. ( 25 ) e¸sitli¼ gi ( 22 ) veya ( 23 ) e¸sitli¼ ginde kullan¬l¬rsa,

m

B 1 + p m

m p

+

mgB

ln 1 + p

m = pm

p + m (26)

olur.

Nuri ÖZALP (Ankara Üniversitesi) 7 !MATEMAT·IKSEL B·IYOLOJ·I7 ! Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 51 / 93

(15)

( 26 ) denklemi boyut analizi ile üç parametreye indirgenebilir. x = mB /p ve y = mg boyutsuz parametreleri ile ( 26 ) denklemi

1

B 1 + B x

x+y B

ln 1 + B

x = B

B + x (27)

¸seklini al¬r. Üç tane boyutsuz x, y , ve B parametresinden ikisi verildi¼ ginde ( 27 ) denklemi ya y = y ( x, B ) den aç¬k olarak ya da Newton yöntemi ile çözülebilir. Tablodan elde edilen x ve y de¼ gerleri x = 52.5 ve y = 317 dir.

B = 286 için y = y ( x ) çözümü, çarp¬ile gösterilen deneysel ( x, y ) de¼ geri ile birlikte ¸ Sekilde gösterilmi¸stir.

Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 52 /

(16)

Figure: B = 286 kuluçka say¬s¬ile y nin x e göre ( 27 ) e¸sitli¼ ginden elde edilen çözüm e¼ grisi. B, m, p, g de¼ gerleri Tablo 1 den al¬nm¬¸st¬r. Çarp¬, çarp¬l¬çember ve içi bo¸s çember s¬ras¬ile f = 1, 1/3 ve 1/8 için y = mg ve x = mfB /p ye kar¸s¬l¬k gelmektedir.

Nuri ÖZALP (Ankara Üniversitesi) 7 !MATEMAT·IKSEL B·IYOLOJ·I7 ! Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 53 / 93

(17)

Teorik sonuç ile deneysel veri aras¬nda görünen büyük fark modeldeki temel kabulleri sorgulamam¬za neden olmaktad¬r. Cutter (2004) taraf¬ndan önerilen, "ergen ya¸ sta üretilen sperm oran¬n¬sabit tutup, yeti¸ skin iken üretilen toplam sperm say¬s¬n¬maksimum yapma" kabulü deneysel veriyle teorik sonuç aras¬nda bir uyum sa¼ glam¬¸st¬r. Bu nedenle

¸

Sekilde görüldü¼ gü gibi, toplam sperm üretme süreci s yi yavru(ergen) ( s E ) ve yeti¸skin ( s Y ) sperm üretme süreci olarak s = s E + s Y ¸seklinde iki parçaya bölelim.

0 g g+s

Y g+sY+

e

yetişkin yavru

sperm yumurta

g-s

E

Figure: Bir çiftcinsiyetlinin daha düzgün bir zaman çizgisi.

Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 54 /

(18)

f yeti¸skin olarak üretilen sperm oran¬n¬ve 1 f de ergen olarak üretilen sperm oran¬n¬göstermek üzere

s E = ( 1 f ) s, s Y = fs (28)

olur. Böylece

s Y = fB /p

olmak üzere, ( 20 ) e¸sitli¼ gindeki ya¸sa–ba¼ gl¬do¼ gurganl¬k fonksiyonu

m ( τ ) = m, g + s Y < τ < g + s Y + e 0, di¼ ger zamanlarda

¸seklini al¬r. Bu durumda ( 21 ) denkleminde p ! p/f de¼ gi¸simi olur. Bu dönü¸süm ile ( 27 ) sonucunun x = mfB /f olmak üzere yine geçerli oldu¼ gu görülür. f = 1/8 e kar¸s¬l¬k gelen bo¸s çember teorik sonuçla deneysel sonucun neredeyse çak¬¸st¬¼ g¬n¬göstermektedir. f = 1/3 Cutter’¬n önerisi olup, ¸sekildeki çarp¬l¬çembere kar¸s¬l¬k gelmektedir ki bu deneysel sonuca f = 1 e kar¸s¬l¬k gelen aç¬k çemberden yine daha yak¬nd¬r.

Nuri ÖZALP (Ankara Üniversitesi) 7 !MATEMAT·IKSEL B·IYOLOJ·I7 ! Biyoloji ve Biyokimya Modelleri 55 / 93

Referanslar

Benzer Belgeler

ilkeler do¤rultusunda çevre ve kültür de¤erlerini yaflatmak, gelifltirmek ve en önemlisi bu de¤erlerle buluflmak için ÇEKÜL ve Tarihi Kentler Birli¤i, Anadolu’da

• Bir araştırıcı için deneme amacına en uygun, çalışılması en kolay, uysal, kolay tutulabilen, bakım ve beslemesi kolay ve ekonomik olan, hakkında yeterince bilgi

Ak¬¸ skan¬t h¬z¬yla sa¼ ga do¼ gru hareket eden bir rüzgar olarak dü¸ sünelim ve kirli havan¬n rüzgar etkisinde hareket... etti¼ gini

Kesikli uzayda tesis yeri problemlerinden biri olan p-medyan problemi ise n adet müşterinin taleplerini karşılamak koşuluyla genellikle amaç fonksiyonunu en

Örneklemi ise, Celal Bayar Üniversitesi Demirci E itim Fakültesi, Bal kesir Üniversitesi Necatibey E itim Fakültesi, Pamukkale Üniversitesi E itim Fakültesi, Dokuz Eylül

Allah sizden, sadece günah kirini gidermek ve sizi tertemiz yapmak istiyor” (Ahzâb Sur. 33) âyetinin tefsirinde, Peygamberimiz'in (sallallahu aleyhi vesellem) “Size iki önemli

Devekuflu yumurtalar›nda da yumurta a¤›rl›¤›n›n ç›k›fl gücüne olan etkisi çeflitli araflt›r›c›lar taraf›ndan incelenmifl ve orta a¤›rl›ktaki yumurtalarda ç›k›fl

MADDE 21 – (1) Noterler a?a??daki i? ve i?lemlerle yükümlüdür:.. a) ?kinci el motorlu kara ta??t? ticaretiyle i?tigal eden i?letme ad?na tescilli ta??tlar?n sat??? ile bu