400100710151-MOLEKÜLER MARKÖRLER VE BİTKİ
ISLAHINDA KULLANIMI
400100710151-MOLEKÜLER MARKÖRLER VE BİTKİ
ISLAHINDA KULLANIMI
Prof. Dr. Ali ERGÜL
Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü
http://biotek.ankara.edu.tr/
Hafta-1 Tarım Bitkileri, Biyoçeşitlilik, Transgenik Bitkiler Hafta-2 Nükleik Asit İzolasyonu (DNA)
Hafta-3 Nükleik Asit İzolasyonu (DNA)-UYGULAMA Hafta-4 PCR (Polimerase Chain Reaction)
Hafta-5 PCR (Polimerase Chain Reaction)-UYGULAMA Hafta-6 Kapiller Elektroforez
Hafta-7 Moleküler Markörler ve SSR (Simple Sequence Repeats) Hafta-8 Kapiller Elektroforez - UYGULAMA
Hafta-9 SNP Markırlar, Yeni Nesil Sekanslama Teknikleri ve SNP Haplotiplemesi Hafta-10 DNA Barkodlama
Hafta-11 Markıra Dayalı Seleksiyon (MAS) Hafta-12 Haritalama Yaklaşımları
Hafta-13 Dizi Analizi
Hafta-14 Dizi Analizi-UYGULAMA
Hafta 11: Markıra Dayalı Seleksiyon (MAS)
Hafta 11: Markıra Dayalı
Seleksiyon (MAS)
DNA Markörlerin Kulllanım Alanları DNA Markörlerin Kulllanım Alanları
•
Evrimsel gelişimin moleküler analizi
•
Tür, çeşit, tip genetik ilişkilerinin belirlenmesinde
•
Varyasyonların belirlenmesi (Somaklonal vb)
•
Ebeveyn-döl tanısı (SSR)
•
Genetik haritalama ve markör yardımı ile seleksiyon (MAS: Marker
assisted selection)
Agronomik özellikleri kontrol eden gen markörleri yardımı ile
seleksiyon:
MAS: Marker Assisted Selection
R: Resistant S: Sensitive
500 armuttan 50’si ateş yanıklığına dayanıklı
500 armuttan 50’si ateş yanıklığına dayanıklı
•cDNA bölgeleri
•EST veri tabanları
•Gen INDEL bölgeleri-SNP
•Patojen İlişkili Gen Bölgeleri
Agronomik özellikleri kontrol eden
gen markörleri yardımı ile seleksiyon
Eş Zamanlı RT PCR
50 armut ateş yanıklığına dayanıklı ancak hangisi ne
kadar dayanıklı
Gen-A
Ders KapsamındaYaralanılan Kaynaklar
Ders KapsamındaYaralanılan Kaynaklar
1. Andrews, K. R., Good, J. M., Miller, M. R., Luikart, G. ve Hohenlohe, P. A.
2016. “Harnessing the power of RADseq for ecological and evolutionary genomics”, Nature Reviews Genetics, 17(2), 81.
2. Biotechnology of Fruits and Nut Crops (Editor:R. E. Litz)(2005)
3. Genome Mapping and Molecular Breeding in Plants(Fruits and Nuts) (Editor:Chittaranjan Kole)(2007)
4. Genomics-Assisted Crop Improvement, Volume 1(Editor: Rajeev K.
Varshney, Roberto Tuberosa) (2007)
5. Model Plants and Crop Improvement(Editors: R. K. Varshey, R. M. D.
Koebner)(2007).
6. Plant Molecular Breeding (Editor: H. John Newbury)(2003)
7. Thomson, M. J., Zhao, K., Wright, M., McNally, K. L., Rey, J., Tung, C. W., Reynolds, A., Scheffler, B., Eizenga, G., McClung et.al. 2012. “High- throughput single nucleotide polymorphism genotyping for breeding applications in rice using the BeadXpress platform”, Mol. Breed., 29, 875-886.
