• Sonuç bulunamadı

EŞ ZAMANLI PCR

N/A
N/A
Info
İndir
Protected

Academic year: 2021

Share "EŞ ZAMANLI PCR"

Copied!
20
0
0

Yükleniyor.... (view fulltext now)

Şimdi indir ( 20 sayfa )

Tam metin

(1)

EŞ ZAMANLI PCR

Prof. Dr. Hilâl Özdağ

Hafta XIII

PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları

(2)

Son nokta tespitindeki eksiklikler (End point detection)

• Düşük hassasiyet

• Düşük çözünülürlük

• Otomasyon eksikliği

• Yalnızca boy belirlenebilmesi

• Sonuçların rakamsal olarak ifade edilmemesi

• EtBr ile boyamanın nicelik belirlemede etkin olmaması

• PCR sonrası işleme devam gereği (agaroz jel elektroforezi)

www.appliedbiosystems.com

(3)

Eş zamanlı PCR Geleneksel PCR’a Karşı

www.appliedbiosystems.com

(4)

Geometrik artış fazı/

Plato etkisi

www.appliedbiosystems.com

(5)

Örnekler arası miktar farkının gözlendiği aşama

www.appliedbiosystems.com

(6)

Eş Zamanlı PCR Sistemleri

(7)

Eş zamanlı PCR’da saptama yöntemleri

• Çift zincirli DNA’ya bağlanan boyalar (SYBR Green; LC Green)

• Hidroliz probları (Taqman probları)

• Hibridizasyon probları

(8)

SYBR Green

(9)

SYBR Green

www.appliedbiosystems.com

(10)

Hidroliz Probları

www.appliedbiosystems.com

(11)

Hidroliz Probları

www.appliedbiosystems.com

(12)

Hibridizasyon Probları

www.appliedbiosystems.com

(13)

Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü

(14)

Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü

(15)

Referans/Standart Gen Zorunlu İdare Genleri

(Housekeeping Genes)

• Her dokuda hücre hayatiyetini temin için mutlak suretle ifadelenen genlerdir.

• İfade düzeylerinin doku/hücreler

arası değişmediği düşünülmektedir.

(16)

Zorunlu İdare Genleri Her Dokuda Eş Düzeyde mi İfadelenir?

Vandesompele J ve ark, 2002, Genome Biology, 3: 7

(17)

E= 10

-1/slope

Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü

(18)

Erime Eğrisi (Melting Curve)

Roche “PCR Applications Manual”

(19)

Erime Eğrisi ile Genotipleme

Roche “PCR Applications Manual”

(20)

Erime Eğrisi ile Genotipleme

Roche “PCR Applications Manual”

Referanslar

Şimdi indir ( PPT - 20 sayfa - 2.51 MB )

Benzer Belgeler

• Hücre yapısı • Organeller ve görevleri • Doku nedir, tipleri nelerdir? • Hücre bölünmesi

• Enerji ihtiyacı fazla olan kas,sinir ve karaciğer gibi hücrelerde sayısı daha fazladır. • Bulundukları hücrenin enerjiye en çok

Radyasyonun hücre ve doku üzerine etkileri

• Radyasyon özellikle mitotik evredeki çekirdeğe etki yaparak hücre çoğalmasını engelleyebilir.. • Hücre döngüsünde radyasyona en duyarlı evreler:geç G2 ve

Eş Zamanlı RT-PCR (qRT-PCR)

SYBR Green kullanılarak yapılan eş zamanlı PCR’de en yüksek verimin elde edilmesi için hedef ürün uzunluğu 100–200 bç.

doku Hücre çeperi mantarlaşmışörtü

Genç hücrelerin radyal çeperlerinde ince bir şerit halinde süberin ve lignin karışımı bir madde birikir ve daha sonra bu şerit alt ve üst çeperlerde de oluşur..

HÜCRELER ARASI İLETİŞİMDE HÜCRE RESEPTÖRLERİNİN FONKSİYONU

Nöral sistemdeki sinyal iletimi yaklaşık saniye düzeyinde gerçekleşirken humoral sistemdeki dakika düzeyinde gerçekleşmektedir... Kimyasal sinyal

Doku aralıkları, hücreler arası (ekstrasellüler) bölgeler ve vücut boşluklarında

Ödem terimi, daha çok doku ve hücreler arasında normalden fazla sıvı toplanması durumunu ifade eder.. Vücut boşluklarında (karın, göğüs boşluğu) sıvı artışını

Yağ Doku Kökenli Kök Hücreler ve Plastik Cerrahide Uygulama Alanları

“In vitro” and multicolor phenotypic characterization of cell sub- populations identified in fresh human adipose tissue stromal vascular fraction and in the derived

POLİTELİA OLGUSUNDA AKSESUAR MEME BAŞI EKSİZYONU İLE EŞ ZAMANLI MASTOPEKSİ

Sonuç olarak, bu olguda olduğu gibi polithelia, meme derisinde konjenital nevüs, fibroadenom gibi iyi huylu meme patolojilerinin tedavisine mastopeksi tek- nikleri