Genel Özellikleri sınıflandırılmaları
NÜKLEOTİTLER ve NÜKLEİK ASİTLER
Doç. Dr. Yasemin G. İŞGÖR
Nükleotitlerin genel yapısında
azot içeren bir baz,
pentoz (şeker) kalıntısı
fosfat grubu
Nükleozitler (nükleositler): nükleozitlerin fosfat grubu çıkarıldığında oluşan yapıdır.
Azot içeren bazlar pirimidin ve pürin türevleridir.
Riboz ve azotlu bazlar halkalı heteroatom bileşikleridir (heterosiklik bleşikler).
Nükleotitler, Nükleozitler ve Nükleik Asitler
Pürin Bazları: Adenin ve Guanin
Pirimidin Bazları: Sitozin , Timin ve Urasil
N NH NH
2O NH
NH O
O C
H
3NH NH O
O
Sitozin Timin Urasil
N N NH
N
NH
2N
NH NH
N
NH
2O
Adenin Guanin
Ribonükleotit ve deoksiribonükleotit arasında temel fark riboz şekeri halka yapısında 2.. Pozisyondaki OH grubudur:
Ribozlar
Deoksiribonükleotitlerde 2' karbondaki -OH grubu yerine -H gelir
O O
OH OH
OH O
P O H
Pürin veya Pirimidin
Bazı
O O
H OH OH
O P O H
Pürin veya Pirimidin
Bazı
OH O H OH H OH H OH
H
R i b o z ( A l d e h i t )
O OH O
H
OH OH
R i b o z ( F u r a n o z )
DNA ve RNA moleküllerinin yapısını oluşturan ardarda dizilmiş nükleotitler birbirine fosfat grubu köprüleriyle (fosfodiester bağı) kovalent olarak bağlanırlar.
fosfodiester bağında fosfat grubu, nükleotitlerden birinin 5'-hidroksil grubuyla bunu izleyen nükleotidin 3'-hidroksil grubu arasında oluşturur.
Genel olarak sembolik gösterimde nüldeüc asitlerin 5' ucu solda, 3' ucu ise sağda yer alır ve sonuçta nükleik asit 5' 3' doğrultusunda sembolleştirilmiş olur.
Aynı nükleotit dizisinin diğer basit gösterimleri ise
pA-C-G-T-A0H,
pApCpGpTpA ve
pACGTA şeklindedir