BİYOLOJİK VERİTABANLARINA GİRİŞ
BİYOLOJİK VERİTABANLARINA GİRİŞ
Veritabanı Nedir?
Veritabanlarının Çeşitleri.
Biyolojik Veritabanları.
Biyolojik Veritabanlarında Tuzaklar.
Biyolojik Veritabanlarına Gelen Bilgileri Alma.
BİYOLOJİK VERİTABANLARI
Veritabanlarında, özellikle biyolojik veritabanlarında genomik çalışmalar ve modern biyolojik araştırma esastır.
Biyolojik veritabanlarının amacı iki yönlüdür:
Bilgi Alma
Bilgi Keşfi
Database Nedir?
Bir veritabanı, depolamak için kullanılan bir bilgisayar arşivi ve bu bilgi arama çeşitli kriterlere kolayca
ulaşılabilir şekilde verilerin düzenlenmesi şeklinde açıklanabilir.
Tüm veritabanlarının temel amacı VERİ ERİŞİM ini sağlamaktır.
Biyolojik veri tabanları genellikle daha yüksek bir
seviyeye sahip gereklilik, bilgi, ilk girildiğinde bilinen değilde bilgi parçaları arasındaki bağlantıların
tanımlanması anlamına gelir BİLGİ KEŞFİ, olarak da
bilinir.
VERİTABANI ÇEŞİTLERİ
Elektronik veri tabanları olarak da ima edilebilir
Düz dosyalar
İlişkisel
Nesneye Yönelik
Biyolojik Veritabanları
Biyolojik veritabanları her üç tipi kapsayacak.
İçeriklerine göre, biyolojik veri tabanları ayrılır.
Birincil
İkincil
Uzmanlık Veritabanları
Birincil Veritabanları
Sadece dizi veya yapı bilgilerini arşivleme
İkincil Veritabanları
İkincil veri tabanları dizileri ya da yapılar
hakkında daha fazla analizini içerir.
Uzmanlık Veritabanları
İhtisas veritabanları, belirli bir araştırma ilgi hitap.
Tek bir veritabanında girdiler olabilir, böylece başka bir veritabanında ilgili girdileri çapraz bağlanmış olabilir böylece BİYOLOJİK
VERİTABANLARI birbirine gerekir.
Biyolojik Veritabanı
İhtisas veritabanları, belirli bir organizma üzerinde belirli bir araştırma topluluk veya odak hizmet vermektedir.
Onların benzersiz örgütleri ve dizileri ile ilgili ek açıklamaları olabilir.
Birçok genom veritabanlarında bu kategori içinde taksonomik spesifik düşme vardır.
Flybase, WormBase, AceDB, TAIR
Gen Bank EST veri tabanı, Avrupa Biyoinformatik
Enstitüsü (EBI), Mikroarray Gen Expression Veritabanı gibi
gen ifadesi veritabanlarının bazıları kullanılabilir.
BİYOLOJİK VERİTABANLARI ARASINDAKİ ARABAĞLANTI
Biyolojik toplumunda, ikincil ve uzman
veritabanları birincil veritabanlarına bağlanmak
için ve yükleme sırası bilgilerini tutmak için sık
sık böyle arabağlantılara ihtiyaç vardır.
Genel Veribankaları
Nükleotid Dizileri
- EMBL/GenBank/DDBJ.
