B 482 B 482 ÇEVRE MİKROBİYOLOJİSİ ÇEVRE MİKROBİYOLOJİSİ

(1)

B 482 B 482

ÇEVRE MİKROBİYOLOJİSİ ÇEVRE MİKROBİYOLOJİSİ

Prof.Dr. Gönül DÖNMEZ

(2)

KAYNAKLAR

 1) Environmental Microbiology, Sharma, P.D.

Alpha Science International Ltd. Harrow, U.K. 2005.

 2) Microbial Ecology Fundamentals and

Applications Atlas, R. M., Bartha, R. Wesley Longman Inc. 1997.

 3) Environmental Microbiology (Second Edition), A Laboratory Manual. Pepper, I.L., Gerba, C.P. Elsevier Inc. 2004.

 4) Microbial Biotechnology, Energy and

Environment, Rajesh arora, CAB International, 2012

 5) Güncel bilgiler için, konuyla ilgili süreli yayınlar ve internet siteleri kullanılacaktır.

(3)

Çevre Mikrobiyolojisi Mikrobiyel Ekoloji

Mikroorganizmaların biyotik ve abiyotik çevreleri ile olan

ilişkilerini inceleyen bir bilim dalıdır.

(4)

1. TARİHSEL GELİŞİM

Saf kültür eldesi

Louis Pasteur (1822-1895)

Robert Koch (1843-1910)

(5)

Sergei Winogradsky (1856- 1953)

 Winogradsky kolonu

Nitrifikasyon bakterilerinin izolasyonu

 H₂S, S ve Fe⁺² oksidasyonu

 Kemolitotrofik gelişme

(6)

Martinus Beijerinck (1851-1931)

 Simbiotik (1888) ve Simbiotik

olmayan (1901) aerobik azot fikse eden mikroorganizmaların

izolasyonu,

 Sülfat redükleyen

mikroorganizmaların izolasyonu

 Zenginleştirme ile izolasyon

(7)

Albert Jan Kluyver (1888-1956), Mikrobiyel

metabolizma (oksidatif, fermentatif ve kemolitotrof metabolizma)

Cornelius Bernardus van Niel (1897-1985), Bakteriyel fotosentez (bakterilerde H₂S)

Roger Stanier, organik bileşiklerin aerobik mikroorganizmalarla (Pseudomonas spp.) parçalanması

Robert Hungate, Zorunlu anaerob

mikroorganizmaların kütüre alınması (rumen ve termit barsak bakterileri ilişkileri)

(8)

Çevre

Mikrobiyolojisinde kullanılan metotlar

 Biyoçeşitlilik

1. Mikrobiyel populasyonların kültüre alınarak analizi

2. Mikrobiyel populasyonların moleküler analizi

 Mikrobiyel aktivitenin belirlenmesi

(9)

Biyoçeşitlilik

1. Mikrobiyel populasyonların kültüre alınarak analizi

 Zenginleştirme ve izolasyon (azotsuz besiyerleri, winogradsky kolonu)

 Saf kültür izolasyonu (çizgi ekim, agar shake tüp metodu, sıvı seyreltme, optikal tweezers)

(10)

Biyoçeşitlilik

2. Mikrobiyel populasyonların moleküler analizi

Boyama teknikleriyle canlılık ve sayının belirlenmesi

Genetik boyama

Özel genlerin belirlenmesi

Çevresel genomik (Metagenomiks)

(11)

Mikrobiyel aktivitenin belirlenmesi

Bir habitatdaki önemli metabolik reaksiyonların hem tipleri hem de oranları hakkında bilgi verir.

1.Radyoizotoplar 2.Mikroelektrotlar 3.Stabil izotoplar