Karadeniz Bölgesi Hepatit C Virus Genotip Belirlenmesine Katkı: Yüksek Hasta Kapasiteli Tek Merkez Verileri, Zonguldak

Karadeniz Bölgesi Hepatit C Virus Genotip

Belirlenmesine Katkı: Yüksek Hasta Kapasiteli

Tek Merkez Verileri, Zonguldak

Contribution to Determination of Hepatitis C Virus Genotypes

in Black Sea Region: Data from Single High Volume Center in

Zonguldak, Turkey

1 _{Bulent Ecevit University Faculty of Medicine, Gastroenterology Clinic, Zonguldak, Turkey.}

2 _{Zonguldak Atatürk Devlet Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Bölümü, Zonguldak.}

2 _{Zonguldak Ataturk State Hospital, Department of Medical Microbiology, Zonguldak, Turkey.}

3 _{Bülent Ecevit Üniversitesi Tıp Fakültesi, İç Hastalıkları Anabilim Dalı, Zonguldak.}

3 _{Bulent Ecevit University Faculty of Medicine, Department of Internal Medicine, Zonguldak, Turkey.}

ABSTRACT

We’ve read with great interest the article entitled “Determination of hepatitis C virus genotypes among hepatitis C patients in Eastern Black Sea Region, Turkey” by Buruk et al. published in Mikrobiyol Bul 2013; 47(4): 650-7. In that study, the authors described the determination and distribution of hepatitis C virus (HCV) genotypes in Eastern Black Sea Region comprehensively. According to the current information, the determination of HCV genotypes is the most important factor for the management of therapy and virus-related complications, such as chirrhosis and hepatocellular carcinoma. The distribution of HCV genotypes varies geographically throughout the world. Therefore every country and even each region within the country should know the distribution of HCV genotypes to determine the appropriate treatment strategy. Herein we would like to contribute the data about distribution of HCV genotypes in whole Black Sea Region by presenting our current results obtained from Zonguldak province, where maximum number of chronic hepatit C patients have already been identified in Eastern Black Sea Region. A total of 53 chronic hepatitis C patients (26 female, 27 male; mean age: 57.1 ± 14.3, age range: 21-82 years) who were admitted to Zonguldak Ataturk State Hospital between January 2012-December 2013 were evaluated. Genotype analysis was performed by RealTime HCV Genotype II (Abbott Molecular, ABD) system. Genotype-1 was found to be the most frequently detected type with a rate of 96.2% (51/53). The prevalences of genotype-2 (1/53) and genotype-4 (1/53) were same, with a rate of 1.9%, in our study. Subtyping of genotype-1 strains yielded 52.9% (27/51) genotype-1b, 3.9% genotype-1a (2/51) and 47% untypeable genotype-1 (24/51). The present study was the second study from the Western Black Sea Region in

Geliş Tarihi (Received): 26.12.2013 • Kabul Ediliş Tarihi (Accepted): 12.03.2014

Editöre Mektup/Letter to Editor

İletişim (Correspondence): Yrd. Doç. Dr. Tarık Akar, Tersane Yapı Koop. A2 Blok D: 6, Zonguldak, Türkiye. Tel (Phone): +90 505 419 2900, E-posta (E-mail): drtarikakar@gmail.com

519

Akar T, Aynioğlu A, Dindar G, Babür T.

our country, regarding HCV genotypes. In conclusion, considering entire Black Sea Region, genotype-1 is the most common genotype (96.2%), and 1b (52.9%) is the most common subtype, in parallel to the data reported from the other regions of Turkey.

Key words: Hepatitis C virus; genotype; Western Black Sea Region; Turkey.

Sayın Editör,

Buruk ve arkadaşları1 _{tarafından bildirilen “Doğu Karadeniz Bölgesi hepatit C hastalarında hepatit C}

virusu genotiplerinin belirlenmesi” isimli çalışmayı büyük bir ilgi ile okuduk. Bu çalışmada yazarlar Doğu Karadeniz Bölgesinde hepatit C virus (HCV) genotipinin belirlenmesi ve dağılımını kapsamlı bir şekilde tanımlamışlardır. Güncel bilgilere göre, HCV genotip tayini, tedaviyi ve virusa bağlı siroz ve hepatoselü-ler kanser gibi komplikasyonları yönetmede en önemli faktördür2_{. HCV genotip dağılımı, coğrafi olarak}

tüm dünyada farklılıklar gösterdiğinden, her ülke ve bir ülkedeki her bölgenin kendi genotip dağılımını bilmesi, doğru tedavi stratejileri için önem taşımaktadır3,4_.

Batı Karadeniz Bölgesinde bulunan iller içerisinde, en fazla kronik hepatit C hasta sayısına sahip olan Zonguldak, bu açıdan bölgenin en önemli şehridir. Bu şehrin kendi hasta kapasitesi ve bölgenin diğer illerinden yoğun şekilde hepatit C tedavisi için hasta kabul etmesi nedeniyle, bu bölgedeki HCV genotip dağılımı tüm Batı Karadeniz Bölgesinin hepatit C genotip dağılımı açısından bize gerçek, bilimsel veriler sağlayacaktır. Zonguldak ilinde hepatit C tedavisi veren iki önemli merkez; Bülent Ecevit Üniversitesi (eski ismi Karaelmas Üniversitesi) Tıp Fakültesi Hastanesi ve Zonguldak Atatürk Devlet Hastanesidir. Üç yıl önce Aktaş ve arkadaşları5 _{tarafından Karaelmas Üniversitesinin HCV genotip sonuçları sunulmuştur. Bu}

yazı-da, Batı Karadeniz Bölgesi HCV genotip dağılımı hakkında bilgilerin tamamlanması amacıyla, Karaelmas Üniversitesi Hastanesinden daha fazla hasta yoğunluğuna sahip Zonguldak Atatürk Devlet Hastanesinin son iki yıl içindeki güncel verilerinin sunulması ve konuya katkı sağlanması amaçlanmıştır.

Çalışmamızda, Ocak 2012-Aralık 2013 tarihleri arasında Zonguldak Atatürk Devlet Hastanesi Gastroenteroloji ve Enfeksiyon Hastalıkları kliniklerinde izlenen toplam 53 (26’sı kadın, 27’si erkek; ortala-ma yaş: 57.1 ± 14.3, yaş aralığı: 21-82 yıl) kronik hepatit C hastası değerlendirilmiştir. HCV genotip anali-zi, genotipe özgül floresan ile işaretlenmiş oligonükleotidli probların kullanıldığı RealTime HCV Genotype II (Abbott Molecular, ABD) ile yapılmıştır. En sık saptanan genotip (Gt), Gt-1 (51/53; %96.2) olmuş; Gt-2 (n= 1) ve Gt-4 (n= 1)’ün sıklığı %1.9 olarak tespit edilmiştir. Gt-1 alt tip dağılımına bakıldığında, hastaların %52.9 (27/51)’unda Gt-1b ve %3.9 (2/51)’unda Gt-1a tanımlanmış, %47 (24/51)’sinde ise Gt-1 alt tip ayırımı yapılamamıştır.

Sonuçlarımız, ülkemiz verilerine paralel olarak, bölgemizde en sık rastlanılan HCV genotipinin, Gt-1 (%96.2), alt tipinin ise Gt-1b (%52.9) olduğunu göstermiştir. Bu çalışma, Batı Karadeniz Bölgesinde genotip dağılımı açısından yapılan ikinci çalışma olup, bildirdiğimiz oranlar son iki yılı kapsayan güncel verilerdir. Yıllık yeni olgu oranımız 27/yıl, aylık yeni olgu oranımız 4/ay gibi yüksek bir seviyededir. Bu verilerle birlikte, yoğun kronik hepatit C hasta sayısına sahip Zonguldak ilindeki genotip dağılımı bilgisi-nin de tamamlandığı düşünülmektedir. Sonuç olarak; tüm Karadeniz Bölgesi dikkate alındığında, bizim verilerimizle birlikte diğer çalışmaların1,5 _{verileri, en sık saptanan HCV genotipinin Gt-1 olduğunu}

520

Karadeniz Bölgesi Hepatit C Virus Genotip Belirlenmesine Katkı: Yüksek Hasta Kapasiteli Tek Merkez Verileri, Zonguldak

MİKROBİYOLOJİ BÜLTENİ

KAYNAKLAR

1. Buruk CK, Bayramoğlu G, Reis A, Kaklıkkaya N, Tosun I, Aydın F. Determination of hepatitis C virus genoty-pes among hepatitis C patients in Eastern Black Sea Region, Turkey. Mikrobiyol Bul 2013; 47(4): 650-7. 2. Akkiz H, Colakoğlu S, Köksal F, Korkut H, Hafta A. Hepatitis C virus genotypes in patients with hepatocellular

carcinoma. J Environ Pathol Toxicol Oncol 1996; 15(2-4): 85-8.

3. Tezcan S, Ulger M, Aslan G, et al. Determination of hepatitis C virus genotype distribution in Mersin provin-ce, Turkey. Mikrobiyol Bul 2013; 47(2): 332-8.

4. Altuglu I, Soyler I, Ozacar T, Erensoy S. Distribution of hepatitis C virus genotypes in patients with chronic hepatitis C infection in Western Turkey. Int J Infect Dis 2008; 12(3): 239-44.