• Sonuç bulunamadı

TÜBERKÜLOZ TANISINDA MOLEKÜLER YÖNTEMLER‹N YER‹Ahmet SAN‹Ç

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Share "TÜBERKÜLOZ TANISINDA MOLEKÜLER YÖNTEMLER‹N YER‹Ahmet SAN‹Ç"

Copied!
5
0
0

Yükleniyor.... (view fulltext now)

Tam metin

(1)

ÖZET

Tüberkülozun tan›s› hastal›¤›n semptomlar›, radyografisi, histopatolojisi, mikroskopisi ve alt›n standart olarak kabul edilen Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC)’in kültürü ile konur. MTBC yavafl üreyen bir bakteri oldu¤u için, izo- lasyonu, tan›mlanmas›, ilaç duyarl›l›k testleri 3-6 hafta sürede tamamlan›r. Klinik materyalin direk mikroskopik incelemesi zaman almaz, ancak metodun duyarl›l›k ve özgüllü¤ü düflüktür.

Moleküler biyoloji sahas›ndaki son geliflmeler ve MTBC’nin moleküler temelinin anlafl›lmas› ile birlikte tüberkülozun h›zl› tan›s› ve antitüberküloz ilaç duyarl›l›k testleri için yeni seçenekler ortaya ç›km›flt›r. Nükleik asit amplifikasyon testleri (NAAT) tüberküloz tan›s›nda oldukça özgüldür, ancak materyalin direk incelemelerinde, özellikle mikroskopi negatif olgular- da, duyarl›l›¤› düflüktür. Moleküler yöntemler ile baflta rifampisin olmak üzere çeflitli antitüberküloz ilaçlara karfl› direnç çok k›sa sürede saptanabilmektedir.

Bununla birlikte bu tekniklerin maliyetinin yüksek oluflu, ileri teknolojiye sahip cihazlara ve e¤itilmifl personele ihtiyaç duyulmas› nedeni ile geliflmekte olan ülkelerde yayg›n olarak kullan›lamamaktad›r.

Anahtar sözcükler: duyarl›l›k testleri, moleküler tan›, MTBC, Mycobacterium tuberculosis complex SUMMARY

The Position of Molecular Methods in the Diagnosis of Tuberculosis

Tuberculosis can be diagnosed by its symptoms, radiography, histopathology, smear microscopy, and by cultivation of Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) which is considered as the gold standard. Because of the slow growth rate of the causative agent MTBC, isolation, identification, and drug susceptibility testing of this organism can take 3-6 weeks. Di- rect staining and microscopic examination of clinical specimens can produce results more quickly, but these methods lack sen- sitivity and specificity.

Recent advances in molecular biology and molecular epidemiology, and a better understanding of the molecular basis of drug resistance in MTBC, have provided new tools for rapid diagnosis. The nucleic acid amplification tests (NAAT) pro- vide a reliable way of increasing the specificity of diagnosis, but sensitivity is poor, especially in smear-negative disease where cli- nical diagnosis is equivocal. In addition to this, by the molecular methods, drug resistant mutants for drugs like rifampicin can be detected with reasonable certainty within hours.

However, the high cost of most of these techniques, and their requirements for sophisticated equipment and skilled per- sonnel have precluded their implementation on a routine basis, especially in developing countries.

Keywords: molecular dignosis, MTBC, Mycobacterium tuberculosis complex, susceptibility tests

TÜBERKÜLOZ TANISINDA MOLEKÜLER YÖNTEMLER‹N YER‹

Ahmet SAN‹Ç

Qafqaz Üniversitesi, BAKÜ/AZERBAYCAN asanic@qafqaz.edu.az

Tüberkülozun tan›s› hastal›¤›n semptom- lar›, balgam›n direk mikroskopisi ve alt›n stan- dart olarak kabul edilen Mycobacterium tubercu- losis complex (MTBC)’in kültürü ve radyolojik görüntülerine göre konur. MTBC’in bölünme zaman› uzundur ve genellikle 2-3 haftal›k inkü- basyondan sonra besiyerinde koloni görülebilir.

Bu özellikleri nedeni ile mikobakterilerin klasik yöntemler ile üretilmesi, tür düzeyinde tan›m-

lanmas› ve duyarl›l›k testlerinin sonuçland›r›l- mas› için 3-6 haftal›k süreye gereksinim duyu- lur. Test süresini k›saltmak amac› ile h›zl› kültür yöntemleri gelifltirilmifl, ancak bu yeni yöntem- ler ile bu süre ancak yar›ya indirilebilmifl- tir(8,10,11).

Klasik laboratuvar tan› yöntemlerinden mikroskopinin özgüllük ve duyarl›l›¤›n›n dü- flük olmas›, kültür yöntemlerinin ise uzun

ANKEM Derg 2007;21(Ek 2):81-85

(2)

zaman almas› nedeniyle yeni yöntemler geliflti- rilmifltir. Tüberküloz hastalar›n›n erken tan› ve tedavisi bu hastal›ktan toplumu korumada en etkili yoldur. Rutin uygulamalarda, kültür ve fenotipik özelliklere dayanan mikobakteri iden- tifikasyon ve duyarl›l›k yöntemlerinin alt›n standart oldu¤u gözard› edilmeksizin, molekü- ler yöntemlerin kullan›lmas› rutin uygulamala- ra girmifltir. Moleküler yöntemler klinik örnek- lerde bulunabilecek etkenin k›sa sürede göste- rilmesi, tan›mlanmas›, alt tipleme ve ilaç diren- cinin saptanmas›nda kullan›lmaktad›r(3-7).

Son y›llarda prob hibridizasyon metodla- r›n›n kullan›m› yayg›nlaflm›flt›r. Prob hibridi- zasyon yöntemleri d›fl›nda DNA dizi analizi, Polymerase Chain Reaction - Restriction En- zyme Analysis (PRA), Single-Stranded Confor- mation Polymorphism Analysis (SSCP) gibi yöntemler de kullan›lmaktad›r. Mikobakteri ta- n›mlamas›nda 16S rRNA veya DNA, hsp65, rpoB, 16S-23S interspace gibi gen bölgelerinden yararlan›lmaktad›r. Tüm bu moleküler yöntem- ler mikobakterilerin tan›mlanmas› için gereken zaman› haftalardan güne indirmifltir. 16S rRNA (veya DNA) gen bölgesi ile di¤er bakteriler de tan›mlanabilir(3-8,10,11).

Moleküler metodlarla MTBC tan›s›n›n ko- nulmas› yan›nda, antitüberküloz ilaç duyarl›l›-

¤›nda moleküler metodlar ço¤u kez rifampisin (RIF), baz› ticari kitlerde izoniazid (INH) sap- tanmas› amac›yla kullan›lmaktad›r. RIF’in ter- cih nedeni olarak, RIF’in en önemli antitüberkü- loz ilaçlardan biri olma özelli¤i yan›nda, direnç- li sufllar›n hemen hemen tamam›na yak›n bir k›sm›nda rpoB geninin 81 bp’lik bölgesindeki mutasyonlar›n olmas› gösterilebilir. Ayr›ca RIF’e dirençli izolatlar›n yaklafl›k % 90’›nda INH direnci de bulunmakta olup, RIF direnci INH direncinin de bir göstergesidir. INH diren- cinin büyük ço¤unlu¤undan katG mutasyonu mevcut olup, en s›k 315. kodonda Ser315Thr mutasyonu gözlenmektedir(7,9,12).

1. Klinik örneklerden direkt MTBC’in saptanmas›

Aside alkole rezistan basil (AARB) boya- ma teknikleri ile mikroskopik inceleme kültüre göre daha h›zl› bir metot olarak kabul edilebilir.

Ancak mikroskopik incelemede AARB’in görü- lebilmesi için klinik örne¤in mililitresinde yak- lafl›k 10,000 bakteri olmas› gerekir. Ayr›ca mik- roskopik inceleme sonucu saptanan basilin MTBC veya hangi tür mikobakteri oldu¤u ko- nusunda karar verilemez. Bu amaçla in-vitro flartlarda türe özgü nükleik asid bölgesinin ço-

¤alt›lmas› ve tespitine olanak sa¤layan nükleik asid amplifikasyon testleri (NAAT) gelifltiril- mifltir(3-8,10,11).

Mikroskopta aside-alkole resistan basil (AARB) görülen akci¤er tüberkülozu olgular›n- da, NAAT ile mikroskopta görülen basilin, bir gün içinde MTBC veya non-tüberküloz miko- bakteri (NTM) oldu¤una karar verilir. MTBC ile NTM infeksiyonlar›n›n tedavileri farkl› olup, bu ayr›m›n önemi büyüktür. Ayr›ca, AARB pozitif olgularda direkt materyalden NAAT’›n çoklu ilaca dirençli tüberküloz (Ç‹T) tayininde kulla- n›lmas› da önerilmektedir. Tüberküloz salg›nla- r›n›n ço¤unlu¤unun Ç‹T olgular›ndan kaynak- land›¤›, olgular›n tedavisinin çok uzun sürdü-

¤ü, tedavi baflar› oranlar›n›n düflük oldu¤u ve sekonder ilaçlarla yap›lan tüberküloz tedavisi- nin maliyetinin yüksek oldu¤u düflünülür ise;

erken tan›n›n halk sa¤l›¤› aç›s›ndan ne kadar öneme sahip oldu¤u ortaya ç›kar(2,5,6,8,10,11).

AARB negatif ancak tüberküloz hastal›¤›- n› yüksek düzeyde flüphelendiren klinik verile- re sahip olgularda, NAAT ile MTBC pozitifli¤i- nin saptanmas› tüberküloz tan›s›n› kesinlefltirir.

Bu olgularda, negatif test sonucu tüberküloz hastal›¤› varl›¤›n› d›fllamak için yeterli de¤ildir.

AARB negatif ancak tüberküloz hastal›¤›- n› orta düzeyde flüphelendiren klinik bulgulara sahip olgularda, pozitif bir NAAT tüberküloz tan›s›na yard›mc› olur. Bu nedenle NAAT test- leri klinik bulgulardan kaynaklanacak hatal› tü- berküloz tan› ihtimalini azaltmakta olup, bu test sonuçlar›n› tek bafl›na de¤erlendirmek anlaml›

de¤ildir. ‹mmun yetmezli¤i bulunan hastalarda klasik tüberküloz bulgular› gözlenmeyebilece¤i hat›rdan ç›kar›lmamal›d›r. Bir örnek verilecek olursa HIV pozitif bireylerde, akci¤er grafisi ka- rekteristik olmayabilir. Balgam mikroskopisi negatif, ancak kültürü pozitif olabilir. Bu olgu- larda, negatif NAAT sonuçlar› tan›y› zorlaflt›ra- bilir(2).

(3)

Ekstrapulmoner tüberküloz olgular›nda NAAT düflük duyarl›l›k ve özgüllü¤e sahiptir.

Kültür, histoloji, radyoloji ekstrapulmoner tü- berküloz tan›s›nda kullan›lmaktad›r. Plöral tü- berkülozda adenozin deaminaz (ADA) ve inter- feron-sitokin testlerinin duyarl›l›klar› yüksek, ancak özgüllü¤ü düflüktür. NAAT, ADA ve in- terferon-sitokin testlerine göre daha özgüldür.

Bu nedenle tüm testler birlikte de¤erlendirilme- lidir. Plörozide pozitif NAAT testleri tan›y› do¤- rularken, negatif test sonucu tüberkülozdan uzaklaflt›rmaz. Bununla birlikte negatif ADA testi tüberküloz hastal›¤› ihtimalini 10 kat azal- t›r. ADA ve NAAT birlikte uyguland›¤›nda ne- gatif sonuçlar elde edilmesi olgunun tüberküloz olmad›¤›n› do¤rular. Her iki test pozitif ise, tü- berküloz plörozi tan›s› % 90’›n üzerinde olas›- l›kla konur. Tüberküloz menenjit tan›s›nda da tüberküloz plörozisindeki gibi NAAT’a ilaveten ADA kullan›labilir. Her iki test pozitif ise % 99 olas›l›kla tüberküloz tan›s› konurken, negatif ol- du¤unda yan›lma olas›l›¤› % 3’den daha düflük- tür(2,5,6,8,10,11).

Klinik örneklerden direkt MTBC tayini için farkl› amplifikasyon metodlar›n›n kullan›l- d›¤› pek çok ticari sistem bulunmaktad›r. Günü- müzde Food and Drug Administration (FDA) taraf›ndan onay verilen iki ticari sistem mevcut- tur: Amplified Mycobacterium tuberculosis Direct Test (MTD), Gen-Probe ve AMPLICOR Myco- bacterium tuberculosis Test (Roche Diagnostic System). Bu iki sitemde de FDA onay› solunum sistemi örnekleri için al›nm›flt›r. Her iki sistem için AARB pozitif klinik örneklerde sonuçlar mükemmel (duyarl›l›k % 95-96, özgüllük % 100) iken, AARB negatif örneklerde duyarl›l›k ve öz- güllükleri düflüktür (duyarl›l›k % 48-53, özgül- lük % 96-99). Bu nedenle FDA bu iki ürün için 1996 y›l›nda sadece AARB pozitif solunum yolu örneklerinde kullan›ma onay vermifltir. 1999 y›- l›nda MTD AARB negatif örnekler için de FDA onay›n› alm›flt›r. Bunun üzerine, National Insti- tute for Health and Clinical Excellence (NICE) 2000 y›l›nda yeni bir algoritm haz›rlayarak reh- berini yenilemifltir. Yeni rehbere göre, EZN bo- yamas› ve mikobakteri kültürü için farkl› üç günde üç balgam örne¤i al›nmas›n› önermifltir.

‹lk örnek EZN pozitif ve NAAT pozitif ise, has-

tan›n tüberkülozlu oldu¤u kabul edilir, testin tekrar›na gerek yoktur. E¤er ilk balgam AARB pozitif, ancak NAAT negatif ise, inhibitörlerin varl›¤› araflt›r›lmal›d›r. Herhangi bir inhibitör madde tesbit edilemez ise, ikinci bir balgam ör- ne¤inde test tekrarlanmal›d›r. E¤er ikinci bal- gam AARB pozitif, NAAT negatif ve herhangi inhibitör madde saptanamaz ise, hastan›n NTM ile infekte oldu¤u kabul edilir. E¤er inhibitörün varl›¤› tespit edilmifl ise, NAAT’›n tan› de¤eri yoktur. Bu durumda ikinci bir balgam örne¤i ile test tekrarlanmal›d›r (Test tekrar›n›n üçten fazla yap›lmas›n›n yarar› yoktur).

AMPLICOR sisteminin örnekte bulunan inhibisyonu saptayabilme yetene¤i vard›r. MTD testinde inhibisyonun belirlenmesi için ekstrak- te edilmifl balgam›n içine yaklafl›k 10 MTBC ba- sili konulmas› önerilir. Negatif sonuç inhibitör varl›¤›n› gösterir.

E¤er AARB negatif ve MTD pozitif ise, NI- CE hastan›n ikinci bir balgam örne¤inde testin bir kez daha tekrarlanmas›n› önermektedir.

‹kinci kez MTD pozitif bulunmufl ise, hastan›n tüberkülozlu oldu¤u varsay›l›r. ‹kinci tekrar›n nedeni, AARB negatif olgularda MTD testinin özgüllü¤ünün % 96-99 aras›nda olmas›na ba¤l›

konulabilecek yanl›fl tan›dan kaç›nmakt›r. Kros kontaminasyona ba¤l› geliflebilecek yanl›fl pozi- tif sonuçlar göz ard› edilmemeli, AARB negatif ve MTD pozitif olgularda hastan›n klini¤i ve radyolojisi ile uyumlu oldu¤u gözlenmelidir.

Ayr›ca yedi günden fazla veya son bir y›l içinde antitüberküloz ilaç alan hastalar›n solunum yo- lu örnekleri NAAT için kabul edilmez.

Solunum yolu d›fl›ndaki klinik örneklerde direkt MTBC aranmas› için ticari ürünlere FDA onay› bulunmamaktad›r. Bu konuda kontrollü genifl çal›flmalara ve yöntem modifikasyonlar›- na gereksinim duyulmaktad›r. Örne¤in plevral s›v›da bulunan inhibitörlerin MTD amplifikas- yonunu önledi¤i saptanm›fl olup, bu tür klinik materyallerde bulunan inhibitörlerin y›kanarak uzaklaflt›r›lmas›ndan sonra çal›fl›lmas› öneril- mektedir(11).

FDA onay› olmamakla birlikte di¤er kuru- lufllardan onay alm›fl ve sat›fla sunulmufl çeflitli ticari ürünler de bulunmaktad›r. Strand Displa- cement Amplification (SDA) yönteminin kulla-

(4)

n›ld›¤› BDProbeTec ET (BD Biosciences), Ligase Chain Reaction (LCR) yönteminin kullan›ld›¤›

LCx Anyliser (Abbott), Nucleic Acid Sequence Based Amplification (NASBA) yönteminin kul- lan›ld›¤› QR System Anyliser (Organon Tekni- ka) bu gruptad›r. Klinik materyalden direkt MTBC arama iflleminde laboratuvarda haz›rlan- m›fl (in-house) PCR yönteminin kullan›lmas›

durumunda standardizasyon problemleri ile karfl›lafl›lmaktad›r(1).

NAAT testleri tüberküloz tedavisinin iz- lenmesinde kullan›lmaz. Tüberküloz tedavisine ba¤l› kültür negatifleflmesinden hatta tedavinin tamamlanmas›ndan sonra da, bu testlerin pozi- tifli¤i devam edebilmektedir. Ayr›ca bir önceki hastadan al›nan ve bronkoskopta kalan MTBC veya DNA kal›nt›lar›n›n yanl›fl pozitifli¤e yol açabilece¤i unutulmamal›d›r(1).

2. Kültürde üretilen mikobakterilerin tür düzeyinde tan›mlanmas›

NICE 1993 y›l›nda MTBC nükleik asid proplar›, NAP testi, high-performance liquid chromotography (HPLC) gibi çabuk sonuçlanan test yöntemlerin kullan›lmas›n› önermifltir. Bu yöntemlerin MTBC tan›s›nda 2-3 hafta avantaj sa¤lad›¤› bildirilmektedir(12).

Mikobakterilerin kromozomal DNA veya ribozomal RNA’lar›n›n, bunlara özgül olarak ba¤lanabilen DNA veya RNA proplar› yard›m›

ile tür düzeyinde tan›mlanmas› mümkün hale gelmifltir. Günümüzde prob teknolojisi olarak AccuProbe (Gen-Probe), BD ProbeTec ET (BD Biosciences) ve bir mikrodilüsyon plate hibridi- zasyon (DDH Mycobacteria, Kyokuto Pharma- ceutical Industrial Co) bulunmaktad›r. Bu test- ler prob teknolojsine göre çal›flt›¤› için örnekte en az 105/ml basil bulunmal›d›r. HPLC miko- bakterilerin hücre duvar›nda bulunan mikolik asit yap› farkl›l›klar›n› ortaya koyarak tür sevi- yesinde tan›mlar. HPLC cihaz›n›n pahal› olmas›

ve iyi yetiflmifl eleman gerektirmesi kullan›m›

s›n›rlar. Referans laboratuvarlar›nda yayg›n olarak kullan›lmaktad›r(3-6,8,10,11).

1993’ten sonra mikobakterilerin tür düze- yinde tan›mlanmas›nda 16S rRNA, hsp65, rpoB ve di¤er gen bölgeleri hedef olarak seçilip, PCR baflta olmak üzere çeflitli amplifikasyon metod-

lar› ile ço¤alt›lmas›na dayanan yöntemler gelifl- tirilmifltir. Amplifikasyondan sonra uygulanan prob hibridizasyon, restriction fragment length polymorphism (RFLP), DNA dizi ve DNA mik- roarrays analizleri ile mikobakterilerin tür dü- zeyinde tan›mlanmas› yap›labilmektedir. Miko- bakterilerin identifikasyonunda DNA dizi ana- lizi en yüksek seviyede do¤ru sonuç vermesine ra¤men cihaz›n pahal› olmas› kullan›m›n› s›n›r- lar. MikroSeq 500 sistemi (Applied Biyosistems) 16S rRNA geninin bir bölümünün DNA dizisi- nin belirlenmesine dayan›r. Bu yöntemle M.tu- berculosis di¤er MTBC basillerinden ayr›labil- mekte ve klinik örneklerden s›k olarak izole edi- len baz› mikobakteri türleri tan›mlanabilmekte- dir. LIPA Mycobacteria, 16S-23S ribozomal RNA ara bölgesinin amplifikasyonu ve bu bölgenin PCR ürünlerinin revers-hibridizasyonu temeli- ne dayan›r. Bu metodla klinik örneklerden s›k olarak izole edilen mikobakteri türleri tan›mla- nabilmektedir. Klinik örneklerden izole edilen mikobakterilerin hemen hemen tamam›n› ta- n›mlayabilen PCR tabanl› RFLP yöntemi geliflti- rilmifltir. Bu yöntem, 65 kDa a¤›rl›¤›ndaki ›s›

flok proteinini kodlayan 439 bp uzunlu¤undaki hsp65 gen bölgesinin ço¤alt›lmas› ve BstEII ve Hae III enzimleri ile kesilmesi sonucu elde edi- len DNA parçalar›n›n jel elektroforezdeki pa- ternlerinin yorumlanmas›na dayan›r. Laboratu- varda haz›rlanm›fl olarak uygulanabildi¤i için ticari sistemlere göre daha ekonomik- tir(5,6,8,10,11).

3. Kültürde üreyen MTBC’nin duyarl›l›k testleri

MTBC yavafl üreyen bir mikroorganizma oldu¤u için klasik kültür besiyerleri ile yap›lan duyarl›l›k test yöntemleri uzun zaman almakta- d›r. Moleküler tan› yöntemleri ilaç direncinden sorumlu mutasyonlar›n belirlenmesini ve ilaç duyarl›l›¤›n› h›zl› bir flekilde belirleyebilmekte- dir. MTBC ilaç direncinin moleküler düzeyde tan›mlanmas› ve uygun tedavi protokollerinin uygulanmas› bu aç›dan önemlidir. Rutin uygu- lamalarda RIF için rpoB ve INH için katG gen mu- tasyonlar› ile ilgili olarak kitler mevcuttur. Pirazi- namid için de çal›flmalar devam etmektedir.

Tüberküloz tedavisinde 1970’li y›llardan

(5)

günümüze kadar kullan›lan RIF, sterilizan etki- si nedeni ile tedavide anahtar rolü olan bir ilaç- t›r. Rifampisine dirençli M.tuberculosis klinik izolatlar›n›n % 95’inden fazlas›nda RNA poli- meraz enziminin‚ alt ünitesini kodlayan rpoB genin 507-533. kodonlar› aras›ndaki 81 baz çifti uzunlu¤undaki rifampin resistance determi- ning region (RRDR) veya hot spot ad› verilen bölgede missense mutasyonlar›n (nükleotid de¤iflimi), küçük delesyon (nükleotid kayb›) ve- ya insersiyonlar›n (nükleotid ilavesi) oldu¤u gösterilmifltir.

Tüberküloz tedavisinde 2. önemli ilaç INH olup, özellikle mikolik asitlerin biyosentezini inhibe etti¤i düflünülmektedir. INH direnci ile ilgili olarak s›kl›kla katG, inhA ve ahpC olmak üzere, en s›k 315. kodonda Ser315Thr mutasyo- nu gözlenmektedir. Genetik çal›flmalar ›fl›¤›nda INH ile katalaz-peroksidaz enzimi aras›nda s›k›

bir iliflki oldu¤u anlafl›lm›flt›r. INH’›n aktive olmas› için katalaz peroksidaz enzimi gerekli olup, bu enzim katG geni taraf›ndan kodlan- maktad›r. katG genindeki mutasyonlar katalaz peroksidaz sistemini etkilemekte ve dolay›s› ile INH direncine neden olmaktad›r(9).

Pirazinamid duyarl›l›k testlerinin uygula- ma zorluklar›, mutasyonlar›n ço¤unun pncA ge- ni üzerinde bulunmas› nedeni ile pirazinamid direncinin genetik temele ba¤l› belirlenmesinin rutin uygulamalara girece¤i tahmin edilmekte- dir. Pirazinamide dirençli kökenlerin % 72- 94’ünde pirazinamidaz enzimini kodlayan pncA geninde çeflitli tipte mutasyonlar›n oldu¤u bi- linmektedir. Mutasyonlar›n›n çok fazla de¤ifl- kenlik göstermesi ve gen boyunca da¤›lm›fl ol- mas› pncA d›fl›ndaki direnç genlerinde görülme- yen bir durumdur. Buna karfl›n pncA geninin üç bölgesinde (3-17, 61-85 ve 132-142. kodonlar aras›nda) mutasyonlar belli bir kümeleflme gös- termektedir. Bu bölgede missense mutasyonla- r›n yan›s›ra delesyon, insersiyon ve terminas- yon mutasyonlar›n›n da olabilece¤i bilinmekte- dir(1,7,9,12).

Moleküler biyoloji sahas›ndaki son gelifl- meler ve M.tuberculosis’in moleküler temelinin anlafl›lmas› ile moleküler metodlarla h›zl› tan›

ve antitüberküloz ilaç duyarl›l›k testleri için ye- ni imkanlar oluflmufltur. Bununla birlikte, bu tekniklerin maliyetinin yüksek oluflu, ileri tek- nolojide cihazlara ve e¤itilmifl personele ihtiyaç göstermesi geliflmekte olan ülkelerde sorun oluflturmaktad›r(8).

KAYNAKLAR

1. Çavusoglu C: Mycobacterium tuberculosis’de molekü- ler antibiyotik duyarl›l›k test yöntemleri, 21.Yüzy›lda Tüberküloz Sempozyumu, Sempozyum kitab›, s.369-87, Otak Form-Ofset Bas›m San. Tic A.fi., Samsun (2003).

2. Dinnes J, Deeks J, Kunst H: A systematic review of rapid diagnostic tests for the detection of tuberculosis infec- tion, Health Technol Assess 2007;11(3):1-196.

3. Durmaz R: Nükleik asit amplifikasyon yöntemlerinde sorunlar ve standardizasyon, “Durmaz R (ed): Uygula- mal› Moleküler Mikrobiyoloji Kursu” kitab›, s.45-56, Malatya (2001).

4. Kathleen DE: Molecular diagnosis, “Radledge C, Dale J (eds): Mycobacteria. Molecular Biology and Virulance”

kitab›nda s.161-79, Blackwell Science, London, UK (2000).

5. Katoch VM: Newer diagnostic techniques for tuberculo- sis, Indian J Med Res 2004;120(4):418-28.

6. Kocagöz T: Tüberküloz tan›s›nda kullan›lan moleküler yöntemler, “A¤açfidan A, Badur S, Türko¤lu S (eds): ‹n- feksiyon Hastal›klar›n Moleküler Tan›s›nda Moleküler Yöntemler” kitab›nda s.189-95, MGG Matbaac›l›k, ‹stan- bul (2002).

7. Öztürk R: Mikobakteriyoloji laboratuar›nda tür ve di- renç tayininde yenilikler, “Eraksoy H, Yenen Ofi (eds):

‹nfeksiyon Hastal›klar› ve Klinik Mikrobiyoloji” kita- b›nda s.35-43, Nobel T›p Kitabevleri, ‹stanbul (2000).

8. Palomino JC: Nonconventional and new methods in the diagnosis of tuberculosis: feasibility and applicability in the field, Eur Respir J 2005;26(2):339-50.

9. Saniç A: Antitüberküloz ilaçlar, “Leblebicio¤lu H, Uslu- er G, Ulusoy S (eds): Güncel Bilgiler Ifl›¤›nda Antibiyo- tikler” kitab›nda s.509-24, Bilimsel T›p Yay›nevi, Anka- ra (2003).

10. Soini H, Musser JM: Molecular diagnosis of mycobacte- ria, Clin Chem 2001;47(5):809-14.

11. Woods GL: The mycobacteriology laboratory and new diagnostic techniques, Infect Dis Clin North Am 2002;16(1):127-44.

12. Zhang Y, Telenti A: Genetics of drug resistance in Myco- bacterium tuberculosis, “Hatful GF, Jacobs WR Jr (eds):

Molecular Genetics of Mycobacteria” kitab›nda s.235-54, ASM Press, Washington, DC (2000).

Referanslar

Benzer Belgeler

Malignite ile tüberküloz tan›s› alan hastalar aras›nda serum ve plevral mayi CA-125 de¤erleri ile plevral mayi/serum CA-125 oran› aç›s›ndan istatistiksel anlaml›

Kültür ve ARB negatif olan, ancak iki haftadan uzun sü- ren öksürük, PPD pozitifliği, Tbc’li erişkinle te- mas öyküsü veya Tbc düşündüren radyolojik bulgular

Füsun Alataş, Sema Uslu, Hale Moral, Özkan Alataş, Muzaffer Metintaş, Sinan Erginel, İrfan Uçgun. 277-281 The Evaluation of Close Contact Case of Pulmonary Tuberculosis

Akın Kaya, Banu Eriş Gülbay, Özlem Ural Gürkan, Gökhan Çelik, Hacer Savaş, İsmail Savaş.. 380-384 Taksi Sürücülerinde Gündüz Aşırı Uyku Hali ve Trafik Kazaları

Tipik olarak diz, kalça gibi büyük ağırlık taşıyan eklemleri etkilemekle birlikte, dirsek, el bileği, sakroiliak, glenohumeral, sternoklaviküler ek- lem, el ve ayak

Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Göğüs Hastalıkları ve Tüberküloz Anabilim Dalı Cebeci - ANKARA Tel: (0312) 319 00 27 • Faks: (0312) 319 00 46 • e-mail:

Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Göğüs Hastalıkları ve Tüberküloz Anabilim Dalı Cebeci - ANKARA Tel: (0312) 319 00 27 • Faks: (0312) 319 00 46 • e-mail:

Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Göğüs Hastalıkları ve Tüberküloz Anabilim Dalı Cebeci - ANKARA Tel: (0312) 319 00 27 • Faks: (0312) 319 00 46 • e-mail: