• Sonuç bulunamadı

HAFTA  XIII

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Share "HAFTA  XIII"

Copied!
13
0
0

Yükleniyor.... (view fulltext now)

Tam metin

(1)

HAFTA  XIII  

Gen  transfer  teknikleri  

 GFP  plazmid  ile  HEK-­‐293  hücrelerinde  overekspresyon   GFP  siRNA  ile  susturma,    

(2)

•  HEK293,  insan  embriyonik  böbrek  hücreleri  popüler  memeli  

heterolog  ekspresyon  sistemi  hücreleridir  ve  rekombinant  protein   üreOminde  sıklıkla  kullanılırlar.  HEK-­‐293  hücreleri,  bu  hücrelerde   eksprese  olan  membrane  proteinlerinin  farmakolojik  özellikleri  ve   yapısal  ve  fonksitonal  ilişkilerini  çalışmak  için  de  

kullanılabilmektedir.  HEK-­‐293  hücrelerinin  rekombinant  protein   eksprese  etmek  maksadıyla  kullanılması,  bu  hücrelerde  verimli  

olarak  plazmid  DNA  transfeksiyonu  yapılabilmesi,  translasyonun  ve   protein  prosesisinin  yüksek  oranda  doğru  olması  özelliklerinden   kaynaklanır.  

•  Ancak  bu  hücrelerin  ion  kanalları  gibi  membran  proteinleri   ekspresyonu  için  kullanıldığında  verimliliğin  düşük  olduğu   görülmüştür.  Bu  durum  genellikle  hücre  içindeki  ya  da  hücre   yüzeyindeki  reseptör  protein  kopya  sayısının  azlığından  

(3)

•  Ekspresyon  verimliliğini  arUrmanın  bir  yolu  hücre  kültürü   koşullarının  opOmize  edilmesinden  geçer.  

•  Rekombinant  protein  ekspresyonunu  etkileyen  üç  major  faktör   hücre  kültürü  koşulları,  vektör  ve  konakçı  hücre  seçimidir.  

•  Kültür  ortam  sıcaklığını  değişOrmek  genellikle  etkilidir  çünkü  

sıcaklığın  hücre  büyümesi,  canlılığı  protein  sentezi  ve  metabolizması   üzerindeki  etkisi  göz  ardı  edilemeyecek  derecede  önemlidir.  Bu  

anlamda,  kültür  ortam  sıcaklığının  37°C  nin  alUna  düşürülmesi,   hücre  büyüme  hızını  da  düşürecekOr.  Yapılan  bazı  araşUrmalara   göre  HEK-­‐293  hücrelerinin  aksine,  CHO  hücrelerinde  kültür  ortam   sıcaklığının  30-­‐32°C  ye  düşürülmesi  bazı  rekombinant  protein  

ekspresyonlarında  arUşa  sebep  olduğunu  göstermişOr.  Bu  durum   göstermektedir  ki  düşük  sıcaklığın  protein  ekspresyonu  üzerindeki   etkisi  hücre  ha\na  spesifikOr  ve  protein  expresyonu  arUşı  temel   olarak  hücrelerin  soğuk  etkisiyle  hücre  döngüsünün  S  ya  da  G1   fazında    arest  olmalarından  kaynaklanmaktadır.  

(4)

Transfekte  Hücrenin  Takibi  

• 

AraşUrmacılar  gen  düzeyinde  yapUkları  

manipülasyonun  takibini  yapabilmek  için  

çalışUkları  genleri  markır  genlerle  eOketlenir.  GFP  

yeşil  floresan  proteini  bu  amaçla  sıklıkla  kullanılan  

eOketlerdendir.  

• 

GFP  geninin  ekspresyon  plazmidine  ligasyonu  

– 

Ligasyonu  takiben  GFP,  plazmidin  kovalent  parçası  

olarak  plazmidle  aynı  zamanda  sirkülerize  olacakUr.  

Sadece  sirküler  form  hücre  içinde  replike  olmaktadır.  

– 

GFP  ligasyonu  için,  GFP  ve  plazmid  aynı  restriksiyon  

enzimleri  ile  kesilir.  Kesim  sonunda  GFP  geni  ve  

plazmid  birbiriyle  eşleşen  uçlara  sahip  olacakUr.  

(5)

GFP  Plazmid  Ligasyonu  

• 

Örnek  ligasyon  protokolü  

(6)

Hücre  Transfeksiyonu  

• 

GFP  markır  geni  içeren  plazmidin  memeli  

hücresine  akarılması  için,  plazmid  direk  olarak  

konsantre  CaCl2  solüsyonu  ile  karışUrılır.  Bu  

karışıma  damla  damla  fosfat  tamponu  eklenir  

ve  presipitat  elde  edilir.  

(7)

Hücre  Transfeksiyonu    

(8)

Plazmid  ÜreOmi  

• 

GFP  içeren  plazmidler  E.coli  hücresine  

transforme  edilir.  Örnek  transformasyon  

protokolü  

(9)
(10)

Hücre  Transfeksiyonu  

• 

Örnek  protokol  

(11)

GFP  İçeren  Koloni  Taraması  

(12)
(13)

Hücrelerin  Görüntülenmesi  

• 

GFP’li  hücreler  koloni  PCR  ile  konfirme  

edildikten  sonra  florosan  mikroskopu  alUnda  

direkt  olarak  görüntülenebilir.  

Referanslar

Benzer Belgeler

Serada yetiştiriciliği yapılan hıyar bitkilerinde budama 5 şekilde

Ülke genelinde yapılan sayımlara göre aile başına düşen ortalama çocuk sayısı 4 dür... • Bir yerli grubunda mevsime

Kolonyalizmin "medeniyet ışığından yoksun kalmış karanlık bölgelere" ışık götürme idealinin, maddi çıkar elde etme noktasından öteye

Hıdırellez kökü Orta Asya, Orta Balkan, Anadolu ve İslam kültürüne dayanan çok eski bir gelenek olmakla beraber artık günümüzde güncelleşmeye ve değişmeye

Bonnie Steinbock bu makalede, James Rachels'ın aksine hastanın tedaviyi reddetmesi durumunda ve hastanın tedavi etmeme sebebinin onun hayatını sonlandırmak

vive ellos/ellas/ uds... abre

Alfonso XIII quiso evitar, según él dijo, una nueva guerra civil, y dos días después de la votación abandonó

In the Laodiceian example, the lions lying by the feet of the saint look very obedient and submissive; thus, the scene looks not like a scene of combat but rather like a scene