Prof. Dr. Hamdi ÖĞÜŞ
hamdiogus@gmail.com
Yakın Doğu Üniversitesi Tıp Fakültesi Biyokimya Anabilim Dalı, LeJoşa, KKTC
Reseptör Enzimler
• Bu reseptörler plazma zarının dış yüzünde ligand-bağlayan bir bölge içerirler. Sitozolik tara?a ise bir enzim ak@f merkezi bulunur.
Bu iki bölge zarı geçen tek bir transheliks segment ile bağlıdır.
• Reseptör enzimlerin çoğu reseptör Rrozin
kinazdır (RTK).
RESEPTÖR TİROZİN KİNAZLAR
Çeşitli Reseptör Tirozin Kinazlar (RTK)
Bütün reseptör @rozin kinazlar evrim sürecinde bir başka
reseptörden kaynak almışFr. Bu nedenle benzer bölgeler içerirler.
İnsülin reseptörü Rrozine-özgü bir protein kinazdır
RTK ile akRve edilen başlıca sinyal ileRm yolları
• MAPK (Mitojenle ak@ve olan protein kinaz) zinciri
• PI-3K (Fosfoinositol 3-kinaz, bir lipid kinaz) → PKB (Protein kinase B) yolağı
• PLC → PKC yolağı
• Src (Reseptör-dışı @rozin kinaz)
Fosfo@rozin etkileşme bölgeleri olan sitoplazmik proteinler reseptördeki fosfo@rozin gruplarına bağlanırlar, ak@ve olurlar ve bir sinyal başlaFrlar.
RTK ile akRve edilen başlıca sinyal ileRm yolları
Üç protein kinaz, herbiri bir sonrakini fosforile ederek ak@ve eden bir zincir
(cascade) oluşturur.
Raf-1 : Bir MAPKKK @pi
MEK : Map-Erk Kinase
(Bir MAPKK @pi)
ERK : Extracellular regulated
kinase (Bir MAPK @pi) IRS-1
İnsulin Reseptör Substratı-1 - İnsülinin hedef proteinidir.
- İnsülin reseptöründen diğer hedeflere haber taşır.
Gen Ekspresyonunun
İnsülinle Düzenlenmesi
İnsülin reseptörü insülini
bağlar ve karboksil ucundaki
@rozinleri otofosforilasyon yoluyla fosforile eder.
İnsülin reseptörü IRS-1’i Tyr yan gruplarından fosforile eder.
Grb2’nin SH2 bölgesi
IRS-1’in fosfo@rozin kısmına bağlanır. Sos, önce Grb’ye, daha sonra da zara bağlı olan Ras proteinine bağlanır: GDP ayrılır ve GTP Ras’a bağlanır.
Ak@ve olan Ras Raf-1’e bağlanır ve ak@ve eder.
Gen Ekspresyonunun
İnsülinle Düzenlenmesi
Raf-1, MEK’i , üzerindeki iki Ser yan grubunda fosforile eder. MEK de ERK’ i
üzerindeki Tyr ve Thr yan gruplarından fosforile ederek ak@ve eder.
ERK nükleusa göçer ve Elk1 gibi nükleer transkripsiyon faktörlerini fosforile ederek ak@ve eder.
Forforillenmiş Elk SRF’ye bağlanarak hücre bölünmesi için gerekli genlerin
transkripsiyon ve translas- yonunu uyarır.
Gen Ekspresyonunun
İnsülinle Düzenlenmesi
Hücre döngüsünde MAPK zinciri
Mitojen sinyalleri, hücreye hücre dışından bölünmeyle ilgili sinyallerdir.
MAPKKK (MAPKK kinase, Raf-1)
MAPKK üzerindeki Ser ve Thr yan gruplarını fosforile eder.
MAPKK (MAPK kinase , MEK)
MAPK üzerindeki hem Ser ve Thr hem de Tyr yan gruplarını fosforile eder.
MAPK (ERK):
Transkripsiyon faktörleri vb.
üzerindeki Ser ve Thr yan gruplarını fosforile eder.
Raf- 1 MEK ERK
MAPK zinciri (Mitojenle uyarılan protein kinazlar)
MAPK zinciri (Mitojenle uyarılan protein kinazlar)
PI-3K ð PIP3 ð PKB Aktivasyonu
İnsülin
Reseptör )rozin kinaz
PI3-kinaz
PIP2 PIP3
PKB
PKB’nin PDK1 tara^ndan fos-
forilasyonu ve ak@vasyonu
PDK1
PKB
PDK1
PKB
PKB
PKB
P
GS GS
GSK3
P
GSK3
UDP-glukoz + Glikojenn Glikojenn+1 + PPi
PIP2 Fosfa@dilinositoldifosfat PIP3 Fosfa@dilinositoltrifosfat PI3K Fosfa@dilinositol-3-kinaz
PDK1 Fosfa@dilinositol bağımlı kinaz 1 PKB Protein kinaz B
GSK3 Glikojen sentaz kinaz 3 GS Glikojen sentaz
IRS-1, çizimi basitleş.rmek için gösterilmedi
İnak@f formlar
PIP2 PIP3 PI3K
Büyüme ve sağkalım sinyalleri
Uyarının sona erdirilmesi
Çeşitli kanser @plerinde, tümör hücrelerinde PTEN’de bir defekt vardır ve çok yüksek PIP3 düzeyine ve PKB ak@vitesine rastlanır.
Sonuçta, sürekli bir hücre bölünme sinyali tümörün büyümesine yol açar.
PIP3-özgül fosfatazlar (PTEN) PIP3’ün 3C konumundaki fosfaF koparır ve PIP2
oluşturur ve böylece arFk PKB için bir bağlanma yeri olamaz ve ak@vasyon zinciri kopar.
Substratların defosforilasyonu, fosfoprotein fosfatazlar [örn.
fosfo@rozin fosfatazlar (PTP) ve bir lipid fosfataz (PTEN)]
tara^ndan gerçekleş@rilir.
PI-3K ð PIP3 ð PKB Aktivasyonu
Küçük G proteinleri (yalnızca bir altbirim)
Küçük G proteinleri beş grup alFnda toplanan 154 üyeli bir ailedir.
GTP bağlama özellikleri vardır. Tek altbirimleri vardır.
İşlevsellikleri bağlı olan nükleo@din GTP (ak@f) ya da GDP olmasıyla belirlenir ve sıkı bir kontrol alFndadır. Diğer proteinlerle birlikte kompleksler yaparak önemli biyolojik olaylarda görev alırlar.
1. Ras Protoonkojendir. Gelişme ve farklılaşmada etkilidirler.
2. Arf Kesecik trafiğinde görev alırlar.
3. Rab Kesecik trafiğinde görev alırlar.
4. Rho Hücre iskele@ (ak@n) oluşmasında görev yaparlar.
5. Ran Nükleer porlardan çekirdeğe giriş/çıkışlarda görevlidirler.
Ras – Küçük G proteini (yalnızca bir altbirim)
İnakRf
Ras-GDP
GTPaz akRve edici proteinler (GAP) Guanin nükleoRd
değiş-tokuş faktörü (GEF)
Ras-GTP
AkRf
GUANİLİL SİKLAZ – İki farklı izozim
• Zarsal guanilil siklaz tek bir polipep@dden oluşur ve GTP’den cGMP sentezler.
• cGMP, protein kinaz G’yi (PKG) ak@ve eder.
Bu enzim de substraF olan proteinleri Ser ya da Thr yan grup-
larından fosforile eder.
Çözünür ve sitozolik olan diğer guanilil siklaz izozimi ise NO tara^ndan ak@ve edilir.
Sinyalin sona erdirilmesi :
• cGMP fosfodiesteraz
(cGMP-PDE) cGMP ’ yi inak@f 5’-GMP’ye çevirir.
• Penis kan damarlarında
bulunan PDE izoformu (PDE5) bir inhibitör olan
sildenafil (Viagra) ile inhibe edilebilir.
• İlaca bağlı olarak cGMP düzeyindeki yükselme erek@l disfonksiyonların
tedavisinde kullanılmaktadır.
GUANİLİL SİKLAZ – İki farklı izozim
• Bu reseptörler, ligandlarına bağlan-
dıklarında dimerize olurlar ve çözünük bir @rozin kinaz olan JAK’ı (Janus kinaz) ak@ve eder. Ak@f JAK önce reseptörü fosforile eder. Daha sonra da bir transkripsiyon faktörü olan STAT’ı fosforile eder.
• Ak@ve olan STAT reseptörden ayrılır ve hücre çekirdeğine göç ederek DNA’ya bağlanır ve
transkripsiyonda yerini alır.
STAT; bir transkripsiyon faktörü ailesi (signal transducer and activator of transcription).Enzim akRvitesi olmayan reseptörler
Nükleer reseptörler
• Ökaryo@k, DNA-bağlayan transkripsiyon faktörleridir.
• Gen ekspresyonunu liganda bağlı bir biçimde düzenlerler.
• Büyüme, gelişme, farklılaşma, metabolizma
ve üreme gibi birçok işlevi düzenlerler.
Steroid hormon reseptörleri
- GR : Glukokor@koid reseptörü
- MR : Mineralokor@koid reseptörü - PR : Progesteron reseptörü
- AR : Androjen reseptörü - ER : Östrojen reseptörü
Ligandı bilinmeyen diğer reseptörler - T
3R : Tiroid hormon reseptörü - VDR : Vitamin D reseptörü
- RAR : Re@noik asit (all-trans) reseptörü - RXR : Re@noik asit (9-cis) reseptörü
- PPAR : Peroksizom-proliferatörle ak@ve edilmiş reseptör
Öksüz (Orphan) Reseptörler : Ligandı bilinmiyor, fakat DNA’ya bağlanır ve transkripsiyonu etkilerler.
Nükleer reseptörler
NÜKLEER RESEPTÖRLER
NASIL ÇALIŞIR ?
Nükleer reseptörler
DBD, DNA bağlayıcı bölge (DNA binding domain)
DBD, Ligand bağlayıcı bölge (ligand binding domain)