• Sonuç bulunamadı

Protein Katlanması ve Bozunması

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Share "Protein Katlanması ve Bozunması"

Copied!
8
0
0

Yükleniyor.... (view fulltext now)

Tam metin

(1)

Protein Katlanması ve Bozunması

111504 Biyoteknoloji ve Biyokimya Ders Notları

Ders12

Dr. Açelya Yılmazer Aktuna

© 2009 W. H. Freeman and Company

(2)

Protein Katlanması ve Bozunması

• Bir proteinin işlevi: 3D yapısına bağlıdır.

Denatürasyon (yapı bozunması): işlev kaybına neden olmaya yeterli olan 3D yapı kaybı

• Protein denatürasyonu:

• sıcaklık

• pH değişimleri

• organik çözücüler

• Kaotropik ajanlar: üre ve guanidinium hydrochloride

 proteinlerin kararlı merkezini birarada tutan etkileşmeler bozulur, etkileşmelere azaltır, s-s bağlarını koparır.

(3)

Ribonükleaz: 8 Cys kalıntısına sahip, 4 s-s bağları içeren küçük bir proteindir

Üre ve 2-mercaptoethanol: ribonükleazı tamamen denatüre eder

Üre ve 2-mercaptoethanol uzaklaştırıldığında, protein tekrar katlanır, s-s bağları kurulur

Bu da aa diziliminin doğal konformasyonu belirlediğini gösterir

Chris Anfinsen,1972 Chemistry Nobel Prize

Ribonükleaz Katlanması Deneyi

(4)

Proteinler nasıl bu kadar hızlı katlanır?

• Protein katlanması rast gele değildir: Levinthal’s paradox

• Proteinler düşük enerjili katlanmış hallerine mikrosaniye ile saniyeler arasında ulaşır.

• Doğal yapıya ulaşmak termodinamik olarak tercih edilir.

(5)

Şaperonlar: yanlış katlanmayı engeller

• Bazı proteinlerin katlanması için yol gösterilir

• Moleküler şaperonlar: kısmen katlanmış ya da düzgün katlanmamış polipeptitler ile etkileşir.

• İki sınıfı var, türler arasında korunmuştur

1. Hsp70: MA70000, yüksek sıcaklıklarda zorlanan hücrelerde daha çok bulunur

– Hidrofobik kalıntılarca zengin katlanmamış polipeptit bölgelerine bağlanır, ve bozunmalarını engeller ve korur

– Zardan geçene kadar katlanmamış polipeptit zincirlerini de korur – ATP hidrokizi ile Hsp40 yardımyla proteinlere bağlanır

2. Şaperoninler: kendiliğinden katlanmayan proteinler için gerekli olan karmaşık katlanma proteinleri

– GroEL/GroES sistemi

3. İzomerleşme tepkimelerini katalizleyen enzimler

– Protein disülfür izomeraz, peptit prolil cis-trans izomeraz

(6)

Protein Katlanmasındaki Bozukluklar Genetik Hastalık Temeli Olabilir.

• Doğru katlanmayan proteinler yıkılır….

• Bazı durumlarda ise hastalıklara neden olur

• Tip2 diyabet, Alzheimer, Parkinson, Huntington hastalıkları

• Normalde hücrede katlanan protein çözünebilir, yanlış katlanan proteinler çözünmeyen hücre

dışı amiloid lif haline dönüşür. (7-10nm çapta, çoğunlukla B-tabaka yapısı içeren, çok iyi

düzenlenmiş ve dallanmamış yapıda)

• Hastalıklara: amiloidazlar (amiloid birikimi

nörodejenerasyona yol açar)

(7)

Parkinson Hastalığı

• Α-sinuklein proteinin hatalı katlanmış şekli Lewry

cismi adı veilen küresel lifsi kütleleri olarak kümelenir.

• Midbraindeki nöronların yeterisz dopamin üretmesi

• Deep brain stimulation: electrodes placed in brain during surgery (patient in stereotactic frame)

• http://www.youtube.com/watch?v=M_fjiEOb40M

• http://www.youtube.com/watch?v=efnh-X_09e8

• http://www.youtube.com/watch?v=a_4_DvquSYQ

• Nanotechnological alternatives are on the way….

(8)

Priyon Hastalıkları

• Yanlış katlanmış beyin proteinleri memelilerde beyin hastalıklarının nedenidir.

• En bilineni sığır spongioform ensefalopatidir (deli dana hastalığı), insanlarda Creutzfeld Jakob hastalığı

• Kilo kaybı, değişken davranış hal ve denge, bilişsel işlv kaybı gibi bir dizi nörolojik sorun. Bulaşıcı ve öldürücü

• 1960larda etkenin nükleik asit olmadığı, protein olduğu

• Enfeksiyon etmeni: priyon (proteinaceous infectious only) proteini (PrP)

• Priyon proteini memelilerin beyin dokusunda bulunur (sinyal iletiminde görev alıyor olabilir?)

• Normal hücrelerde PrPC, hastalıklı PrPSc (Sc: scrapie form)

• PrPC ile PrPSc nın etkileşimi, PrPC yi PrPSc ye dönüştürür (domino etkisi)

Referanslar

Benzer Belgeler

Ohno, 4 notalık bu zincirinin yeterli olmadığına karar vererek her DNA monomerine 2 müzik değeri verdi bu da müzik alanını genişletti.. Fare immunoglobulin DNA dizilimi,

 ÜREOTELİK: ÜREOTELİK: Karada yaşayan hayvanların çoðu amonyağı Karada yaşayan hayvanların çoðu amonyağı bol suda çözünen üre şekline çevirirler. bol

Bunlar ve farklı amino asid zincirlerindeki diğer gruplar, diğer gıda bileşenleri ile birçok reaksiyona iştirak edebilirler.... • Yapılan çalışmalarda

Bununla beraber, özellikle dikkatiniz çekmek istediğim husus şudur: “Organik tarım” ya da “organik ürünler” sizin hayaliniz- deki gibi doğal yetişmiş yani

In this paper we showed that graph theoretical properties such as connectivity, clustering coefficient, second connectivity, characteristic path length and centrality

• Türev proteinler, ilk iki protein grubunda yer alan proteinlerin belirli etkilerle değişmeleri sonucu oluşan proteinlerdir; primer türev proteinler ve sekonder türev

40S alt ünitesi, daha sonra eIF-2, GTP ve başlatıcı aminoasil tRNA’dan oluşan (Met-tRNA i Met ) üçlü komplekse bağlanır. Prokaryotlarda olduğu gibi, ökaryotlar da ayrı

Differential diagnosis of DIC included microangiopathic pathologies like infectious reasons (purpura fulminans), soft tissue injury due to trauma, snake or insect venom,