DNA Dizilimi ve Gen İfadesi Düzeyinde Varyasyon
Prof. Dr. Hilâl Özdağ
Genom-Transkriptom
DNA mRNA Protein
Genom Transkriptom Proteom
Mikrosatellitler
• Basit ve kısa dizi tekrarları (short tandem repeats-STR)
• 2, 3, 4, 5 nt’lik tekrarlar
• Allel sayısı çeşitli
• İnsan genomunda her 100kb’de bir.
Mikrosatellitler
TNP’ler
• Tekli Nükleotid Polimorfizmleri
• 2 alleli bulunur.
• İnsan genomunda yaklaşık her 600
bç’de bir tekrarlanır.
TNP’ler
Nature. 409: 929
TNP’lerin tanımlanması
ASA
TNP’lerin tanımlanması
RFLP
AGATCT
Yabanıl Tip Allel
Mutant allel
TCTAGA
AGAGCT TCTCGA
RE kesim bölgesi
RE bölgesi kaybolmuş
TNP’lerin tanımlanması
RFLP
AGATCT
Yabanıl Tip Allel
Mutant allel
TCTAGA
AGAGCT TCTCGA
RE kesim bölgesi
RE bölgesi kaybolmuş
TNP’lerin tanımlanması
http://bio.huji.ac.il/images/genpic4.gif
TRANSKRİPSİYON
http://www.wellesley.edu/Chemistry/