• Sonuç bulunamadı

YENİ TANI YÖNTEMLERİ:MİKRODİZİNLERDEN YENİ NESİL SEKANSLAMA TEKNOLOJİSİNE

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Share "YENİ TANI YÖNTEMLERİ:MİKRODİZİNLERDEN YENİ NESİL SEKANSLAMA TEKNOLOJİSİNE"

Copied!
14
0
0

Yükleniyor.... (view fulltext now)

Tam metin

(1)

YENİ TANI YÖNTEMLERİ:

MİKRODİZİNLERDEN YENİ NESİL SEKANSLAMA TEKNOLOJİSİNE

Prof. Dr. Hilal Özdağ

Hafta XIV

PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları

(2)

Soru, Paradigma, Genetik

Tek Gen Hastalıkları Multifaktöryel, Multigenik Hastalıklar

(3)

Şahsi Kronoloji

(4)

• 1993 Yüksek Lisans

• PCR

• Radyoaktif Sanger Sekanslama

• 1995 Doktora

• Otomatik DNA Dizi Analizi (36 kuyulu ABI 377, 1 kapillerli ABI 310)

• 2000 Postdoc

• Otomatik DNA Dizi Analizi (96 kuyulu ABI 377, 16 kapillerli ABI 3100)

• Cancer Research UK_ cDNA mikroarrayleri

• 2005 Yard. Doç.

• Affymetrix Mikroarray

• 2006 Doç.

• Roche GS-FLX Genome Sequencer (100 milyon bç)

• 500 milyon bç

• 1 milyar bç

• 2013 Prof

• Illumina MySeq 15 milyar bç

• Illumina HiSeq 2500 176GB/40saat

• 2017

• İllumina NovaSeq 6000 3000 GB (3x10

12

bp)

(5)

SORU: Heterojen bir hastalığı tanımak, tanımlamak, tedavi etmek

• Kanser, heterojen hastalıklara bir örnek: Herhangi bir kanser türünü (Kolorektal, meme vb) tek bir hastalık olarak görmek ve tedavi etmeye kalkışmak başarısızlığa mahkum olmak demek.

• Diagnostik, prognostik, terapötik moleküler belirteçlerin tespiti, hatta teranostik belirteçlerin ortaya çıkarılması doğru teşhis ve tedavi, “hassas tıp” (precision medicine) uygulamaları için son derece önemli.

• Bu çerçevede hastalığın kimlik kartı hastalığın etki ettiği doku

ve/veya organın moleküler yapısında gizli.

(6)

MİKRODİZİN’den SONRASI: YENİ NESİL

DİZİLEME ile OMİK ANALİZLER

(7)

Yeni Nesil Sekanslama

Teknolojileri

(8)

Yeni Nesil Sekanslama

Pyrosequencing Temelli_Roche GS-FLX

Jonathan Rothberg

(9)

Yeni Nesil Sekanslama

Pyrosequencing Temelli_Roche GS-FLX

(10)

Yeni Nesil Sekanslama pH Temelli_Ion Torrent

Jonathan Rothberg

(11)

Yeni Nesil Sekanslama

Sequencing by synthesis_Illumina

(12)

Yeni Nesil Sekanslama

Sequencing by synthesis_Illumina

Animasyon_İllumina

(13)

OXFORD NANOPORE

(14)

OXFORD NANOPORE

Animasyon_Nanopore

Referanslar

Benzer Belgeler

Buna göre, mRNA ekspresyon verisinden seçilen öz-niteliklerle makine öğrenmesi algoritmaları eğitildiğinde, protein seviyesi verilerinden seçilen öz-niteliklere

O da, Refet Paşa’nın İstanbul’a gelişini takip eden günün sabahı telefonla Sabiha Hanım’ı arayışını anlattı.. - Refet (Bele)

De erlendirme için tek ba na imza- temelli bir STS olan Snort’un ba ar m bu bölümde incelenmektedir, Bölüm 6.5’de de istatistiksel-temelli anormallik tespiti için Snort’a

Purpose: This article to investigate both the direct and indirect the effect of green innovation and firm value on financial performance as mediating

Üçgen alınlıklı stelde, üst kısmı düz olan çerçevenin üzerine masif yapılan geisondan sonra alınlığa geçilmektedir.. Tepe akroterinin bir kısmı, köşe

With the present study, it was aimed to measure circulating levels of AnxA1 protein and also its mRNA expression levels in colorectal cancer patients and

Backward Stepwise logistic regression model (Odds ratio (OR) with confidence interval of 95%, chi square value of 13,032 with 90.9 percentage correct)

KSE anestezi yöntemi daha çok yüksek riskli geriatrik olguları içeren kolorektal kanser cerrahisinde genel veya epidural + yüzeyel genel anesteziye alternatifolarak