• Sonuç bulunamadı

Klinik örneklerde saptanan Candida türlerinin MALDI-TOF MS ile tiplendirilmesi

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Share "Klinik örneklerde saptanan Candida türlerinin MALDI-TOF MS ile tiplendirilmesi"

Copied!
5
0
0

Yükleniyor.... (view fulltext now)

Tam metin

(1)

Dicle Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı, Diyarbakır, Türkiye

Yazışma Adresi /Correspondence: Nezahat Akpolat,

Dicle Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı, 21280 Diyarbakır, Türkiye Email: nakpolat21@gmail.com Geliş Tarihi / Received: 13.01.2016, Kabul Tarihi / Accepted: 08.09.2016

Dicle Tıp Dergisi / 2016; 43 (3): 390-394

Dicle Medical Journal doi: 10.5798/diclemedj.0921.2016.03.0702

ÖZGÜN ARAŞTIRMA/ORIGINAL ARTICLE

Klinik örneklerde saptanan Candida türlerinin MALDI-TOF MS ile tiplendirilmesi

Identification of Candida species isolated from clinical specimens by MALDI-TOF MS

Nida Özcan, Özgür Ezin, Nezahat Akpolat, Hasan Bozdağ, Mahmut Mete, Kadri Gül ÖZET

Amaç: Kandida türleri, hastane ve toplum kökenli enfek-siyon etkenleri arasında önemli yer tutar. Antifungal direnç durumlarının farklılık göstermesi, etkenlerin tür düzeyinde tanımlanmasını önemli kılar. MALDI TOF (matriks aracılı lazer dezorpsiyon iyonizasyon uçuş zamanı) MS (kütle spektrometresi) yöntemi, bakterilerin yanı sıra maya man-tarlarını da içerdikleri protein kütlelerine göre tür düzeyin-de kısa süredüzeyin-de ve doğru şekildüzeyin-de tanımlayabilmektedir. Bu yöntemle laboratuvarımızda izole ettiğimiz kandida türlerini tanımlamayı amaçladık.

Yöntemler: Mart 2015-Şubat 2016 tarihleri arasındaki bir yıllık süre içinde Dicle Üniversitesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen klinik örneklerden soyutlanan kandida türleri çalışmaya dahil edildi. İzolatlar MALDI Bi-otyper (Bruker Daltonics, ABD) kütle spektrometresi kulla-nılarak tanımlandı.

Bulgular: Çalışmaya, klinik örneklerden soyutlanan 297 kandida türü dahil edildi. Klinik örneklerin 195 (%65,7)’i yoğun bakımda, 61 (%20,5)’i klinikte yatmakta olan, 41 (%13,8)’i ise poliklinik hastalarına aitti. Çalışmada 161 (%54,2)’i idrar, 78 (%26,3)’i kan, 34 (%11,4)’ü vajen, 4’ü solunum yolu örneği, 10 (%3,4)’u yara, 8’i diğer (3 plev-ra, 2 periton, 2 dren sıvısı, 1 BOS) örneklerden toplam 297 maya mantarı saptandı. İzolatların 179 (%60,3)’u C. albicans, 46 (515.5)’sı C. tropicalis, 27 (%9,1)’si C. pa-rapsilosis, 19 (%6,4)’u C. glabrata, 13 (%4,4)’ü C. kefyr, 7(%2,3)’si C. lusitaniae, 3 (%1,0)’ü C. krusei, 2(%0,7)’si C. utilis, 1 (%0,3)’i C. guillermondi olarak tanımlandı. Kandida üreyen tüm hastaların 173 (%58,2)’si kadın, 124 (%41,8)’ü erkek hastalardı. İnvaziv örneklerde maya mantarı üreyen toplam 84 hastanın 50 (%59,5)’si erkek, 30 (%40,5)’u ka-dındı.

Sonuç: Candida albicans, %60,3 ile laboratuvarımızda en sık saptanan maya mantarı olmaya devam etmekte ancak diğer türler de (%39,7) önemli oranda enfeksiyona yol aç-maktadır. Kültürde üreyen maya mantarlarının tür düzeyin-de tanımlanması konvansiyonel yöntemlerle birkaç gündüzeyin-de, kütle spektrometresi ile dakikalar içinde gerçekleşmektedir. Bu süre, özellikle yoğun bakım hastalarının tedavisinde ha-yati önem taşır.

Anahtar kelimeler: Kandida türleri, MALDI TOF-MS, has-tane enfeksiyonu

ABSTRACT

Objective: Candida species are common nosocomial in-fectious agents. Since they have different antifungal resis-tance profiles, identification up to species level becomes more crucial. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometry (MS) en-ables rapid and accurate identification of bacteria and fungi up to species level. We aimed to evaluate Candida species identified by MALDI-TOF MS in our laboratory. Methods: Overall 297 strains of Candida spp. were iso-lated from various clinical samples sent to Dicle Univer-sity Hospital Microbiology Laboratory between March 2015 and February 2016. Strains were identified up to the species level by MALDI Biotyper (BrukerDaltonics, USA) mass spectrometry.

Results: A total of 195 (65.7%) yeasts were isolated from intensive care unit (ICU) patients, 61 (20.5%) yeasts from hospitalized patients other than ICU and 41 (13.8%) yeasts from outpatients. The clinical samples consisted of 161 (54.2%) urine, 78 (26.3%) blood, 34 (11.4%) vaginal samples, 10 (3.4%) wound, 6 (2.0%) respiratory and 8 of other samples (3 pleura, 2 peritoneum, 2 drain and 1 cerebrospinal fluid). Overall, 179 (60.3%) C. albicans, 46 (15.5%) C. tropicalis, 27 (9.1%) C. parapsilosis, 19 (6.4%) C. glabrata, 13 (4.4%) C. kefyr, 7 (2.3%) C. lusitaniae, 3 (1.0%) C. krusei, 2 (0.7%) C. utilis and 1 (0.3%) C. guil-liermondii were isolated. Among all patients; 124 (41.8%) were male and 173 (58.2%) female. Among 84 patients with invasive samples, 50 (59.5%) were male and 34 (40.5%) female.

Conclusion: Even though Candida albicans is the most frequently (60.3%) isolated yeast, other yeast species are not uncommon (39.7%) in our hospital. Identification of yeasts to the species level takes several days by conven-tional methods within minutes by mass spectrometry. This period is crucial in the treatment of critically ill patients. Key words: Candida, MALDI TOF-MS, nosocomial infec-tion

(2)

GİRİŞ

Enfeksiyon hastalıklarında en değerli veri, etkenin en kısa zamanda doğru şekilde tanımlanmasıdır. Bu alanda geliştirilen donanımların temel amacı da bu mantığa dayanmaktadır. MALDI-TOF MS (Mat-riks Aracılı Lazer Dezorpsiyon Iyonizasyon- Uçuş Zamanı-Kütle Spektrometresi) son yıllarda mikro-organizma tanımlanmasında da kullanılmaya başla-nan yüksek duyarlıklı hızlı ve ucuz bir sistemdir [1-3]. Bu sistemde, mikroorganizmalara ait biyomo-leküller (protein, peptid, şeker) ve büyük organik moleküller (polimer, dendrimer, makromolekül) la-zer atışları ile iyonizasyon sonrası elektromanyetik uçuş tüpünden geçirilmektedir. Kütleleriyle orantı-lı hız kazanan iyonların detektöre farkorantı-lı zamanda çarpmaları ile kaydedilen sinyaller proteinlerin küt-le spektrumlarını oluşturmaktadır. Bu spektrum gö-rüntülerinin sistemin veri tabanındaki spektrumlar-la karşıspektrumlar-laştırılması sonucu mikroorganizmaspektrumlar-lar hem cins hem de tür bazında tanımlanabilmektedir [3]. Geleneksel yöntemlerle kültürde üreyen maya man-tarlarının tanımlanması günler almakta iken bu süre MALDI-TOF MS ile dakikalara indirgenmektedir. Yapılan çalışmalarda MALDI-TOF MS’in mayaları tanımlama oranı %85-%100 arasında gösterilmek-tedir [4,5]. Özellikle kandida cinsi mantarların tür bazında doğru olarak tanımlanma oranı yüksekken, dermatofitler, Aspergillus, Penicillium ve Fusarium cinsi mantarlar, referans spektrum yetersizliği ne-deniyle daha az oranda tanımlanabilmektedir [6]. Kandida cinsi mantarlar, önemli hastane enfeksi-yon etkenlerindendir. Tür düzeyinde sıklık sırala-masında Candida albicans önde gitmekle beraber, albicans dışı kandida türleri de artış göstermektedir. Farklı antifungal direnç profillerine sahip olabilme-leri nedeniyle etkenolabilme-lerin tür düzeyinde tanımlanma-sı önemlidir [7,8]. Çalışmamızda hastanemizde hiz-mete sunduğumuz MALDI TOF-MS ile tanımlanan kandida türleriyle ilgili bir yıllık hastane verileri sunulmuştur.

YÖNTEMLER

Mart 2015-Şubat 2016 tarihleri arasındaki bir yıllık sure içinde Dicle Üniversitesi Hastanesi Mikrobiyo-loji Laboratuvarına gönderilen klinik örneklerden üretilen kandida türleri retrospektif olarak incelen-di. Aynı hastanın aynı etkenle mükerrer üremeleri çalışma dışı bırakıldı. Klinik örnekler mikrobiyoloji

laboratuvarında rutin kültür işlemlerine tabi tutul-duktan sonra tanımlama için MALDI-TOF MS sis-temi kullanıldı. Kültür plağında üreyen koloniden, bir kürdan ucuyla örnek alınarak MALDI TOF pla-ğına sürüldü. Her aşamada oda ısısında kuruması beklenerek sırasıyla %70’lik formik asit ve matriks (HCCA;siyano-4-hidroksisinamik asit) solüsyonun-dan (Bruker Daltonics, ABD) 1’er µl eklendi. Plak, analiz için Microflex LT MALDI-TOF MS cihazına bırakıldı. Her örnek toplamda 320-400 olacak şekil-de lazer atışlarına maruz bırakıldı. Ölçümler Flex Control 3.0 yazılımı (Bruker Daltonics, ABD) ile gerçekleştirildi. Ölçüm sonuçları 0-3 arasında skor değerleri olarak verilmekte olup üretici firma öne-risiyle ≥2 skor değeri cins ve tür düzeyinde kabul edilebilir skor olarak alındı. Düşük skor değerli ör-nekler taze pasaj ile tekrar çalışıldı.

Kültür plaklarında üreyen maya mantarlarının albicans ve albicans dışı ayrımı için geleneksel bir yöntem olan Çimlenme Borusu Testi(ÇBT) uygu-landı. Bunun için kültür plağından birkaç koloni alı-narak 0,5ml tavşan serumuna eklendi. Süspansiyon 35±2°C’de 2-4 saat inkübe edildikten sonra mikros-kopta 400’lük büyütme ile çimlenme borusu varlığı incelendi.

BULGULAR

Kandida türleri üreyen hastaların 124 (%41.8)’ü erkek, 173 (%58.2)’ü kadındı. Hastaların yaş or-talaması 49,47 ±27,23 (0- 97 yaş) olarak saptandı. İnvaziv örneklerde kandida üreyen toplam 84 hasta-nın 50 (%59,5)’si erkek, 34 (%40,5)’ü kadındı. Kli-nik örneklerin 256 (%86,2)’sı hastanede yatmakta olan, 41(%13,8)’i ise ayaktan tedavi gören hastalara aitti. Hastanede yatan hastaların 195 (%65,7)’i yo-ğun bakım ünitelerinde, 61 (%20,5)’i kliniklerde yatan hastalardı. İzolatların % 86,2’si hastanede yatan hastalara ait olduğu için, hastane-toplum kö-kenli etken ayırımı yapılmamıştır. Çalışmada 161 (%54,2)’i idrar, 78 (%26,3)’i kan, 34 (%11,4)’ü va-jen, 10 (%3,4)’u yara, 6 (%2)’sı solunum yolu örne-ği, 8 (%2,7)’i diğer (3 plevra, 2 periton, 2 dren sıvı-sı, 1 beyin omurilik sıvısı (BOS)) örneklerden top-lam 297 maya mantarı izole edildi. İzolatların 179 (%60,3)’u C. albicans, 46 (515,5)’sı C. tropicalis, 27 (%9,1)si C. parapsilosis, 19 (%6,4)’u C. glabra-ta, 13 (%4,4)’ü C. kefyr, 7(%2,3)’si C. lusitaniae, 3 (%1,0)’ü C. krusei, 2 (%0,7)’si C. utilis, 1 (%0,3)’i

(3)

C. guilliermondii olarak tanımlandı (Tablo). Top-lam 84 invaziv örneğin (78 kan, 3 plevra, 2 periton, 1 BOS) 44’ünde C. albicans, 17’sinde C. parapsi-losis, 12’sinde C. tropicalis, 4’ünde C. lusitaniae üredi. Hastanede yatan hastalarda kandida türleri üreyen en sık klinik örnekler idrar ve kan kültürleri olarak saptandı. Toplam 195 yoğun bakım hastası-nın 120 (%61,5)’sinde, toplam 61 klinik hastasıhastası-nın ise 32 (%52,5)’sinde idrar kültüründe kandida türle-ri üredi. Yoğun bakım hastalarının 61 (%31,3)’inin, klinikte yatmakta olan hastaların ise 16 (%26,2)’sı-nın kan kültürlerinde kandida türleri izole edildi. C. albicans, hastanede tedavi gören hastalarda en sık üreyen kandida türü olarak saptandı. Yoğun

bakım-da yatan 195 hastanın 111 (%56,9)’inde C. albicans izole edildi. C. tropicalis (38 izolat), C. parapsi-losis (25 izolat) ve C. glabrata (12 izolat), yoğun bakım hastalarında en sık üreyen diğer kandida tür-leri olarak belirlendi. Klinikte yatan 61 hastanın 36 (%59)’sında C. albicans, 9 (%14,8)’unda C. kefyr, 7 (%11,5)’sinde C. tropicalis izole edildi. Ayaktan tedavi gören 41 hastaya ait klinik örneklerin 30 (%73,2)’u vajen sürüntü örneği, 9 (%21,9)’u idrar, diğer ikisi kan ve yaraydı. C. albicans, ayaktan te-davi gören hastalarda da en sık (32 izolat, %78) üre-yen etken olarak saptandı. C. glabrata (5 izolat), C. krusei (3 izolat) ve C. tropicalis (1 izolat) poliklinik hastalarında üreyen diğer etkenlerdi.

Klinik Örnekler

Kandida türleri İdrar(n) Kan(n) Vajen(n) Yara(n) Solunum(n) Diğer(n) Toplam n(%)

C. albicans 100 41 26 4 3 5 179(60,3) C. tropicalis 30 12 0 2 2 0 46 (15,5) C. parapsilosis 8 15 0 2 0 2 27 (9,1) C. glabrata 11 2 5 1 0 0 19(6,4) C. kefyr 9 1 0 1 1 1 13(4,4) C. lusitaniae 3 4 0 0 0 0 7(2,3) C. krusei 0 0 3 0 0 0 3 (1,0) C. utilis 0 2 0 0 0 0 2(0,7) C. guillermondi 0 1 0 0 0 0 1 (0,3) Toplam n(%) 161 (54,2) 78 (26,3) 34 (11,4) 10 (3,4) 6 (2,0) 8 (2,7) 297(100) Tablo 1. Kandida

türlerinin izole edil-diği klinik örneklere dağılımı

TARTIŞMA

Görülme sıklığı giderek artan ve özellikle bağışıklık sistemi baskılanmış hastalarda kritik seyreden inva-ziv fungal enfeksiyonların tanısı klinik gözlem ve laboratuvar testlerine dayanmakla beraber kültür ve konvansiyonel tanımlama yöntemleri zaman alıcı ve karışıktır [7-9]. Son yıllarda bakteriyel ve man-tar enfeksiyonlarının tanısında MALDI-TOF MS ile kolay, güvenilir ve hızlı sonuç alındığına dair çok sayıda çalışma yapılmıştır [8,10,-12]. Kim ve ark., 2014’te yaptıkları çalışmada VITEK-2 ile C. famata olarak tanımlanan 26 Candida spp.izolatını tekrar MALDİ –TOF MS yöntemi ile çalışarak gen sekans analizi ile doğrulamalarını yapmışlardır. Çalışmada, VITEK-2 ‘nin C. famata olarak tanımladığı suşların gen sekans analizinde C. guilliermondii ile %100 homoloji gösterdiği, MALDI-TOF MS’in suşla-rın 21’ini doğru tanımladığı, 4 izolatı ise ‘kabul

edilebilir düzeyde’ tanımlayamadığı belirtilmiştir [10]. Carolis ve ark., Candida parapsilosis comp-lex (C. parapsilosis, C. orthopsilosis, C. metapsi-losis) ve Lodderomyces elongisporus izolatlarını MALDI-TOF MS ve amplification fragment-len-gth polymorphism (AFLP) yöntemleri ile çalışmış; iki yöntemle de türlerin doğru tanımlandığını ve MALDI-TOF MS’in tür düzeyinde tanımlamasının güvenilir olduğunu belirtmişlerdir [11]. Lacroix C ve ark., [12] 8 farklı hastaneden topladıkları 1383 Candida spp. izolatını konvansiyonel yöntemler ve MALDI-TOF MS metodu ile çalışmış; kütle spektrometre yönteminin güvenilir olduğunu belir-terek konvansiyonel ve moleküler yöntemlere göre avantajları olduğuna vurgu yapmışlardır. Kandida türleri invaziv fungal enfeksiyonların olduğu kadar nozokomiyal ve dolaşım yolu enfeksiyonlarının da yaygın görülen etkenlerindendir [7,8,13]. Nitekim bir yıllık sürede hastanemizde, klinik örneklerden

(4)

izole edilen 297 maya mantarının 195 (%65,7)’i yoğun bakım ünitelerinde, 61(%20,5)’i kliniklerde olmak üzere %86,2’si hastanede tedavi gören hasta-lara aitti. Sarıgüzel ve ark., [14] 30 aylık kan kültür verilerini değerlendirdikleri bir çalışmada Candida spp. suşlarının 141 (%80,5)’ini yoğun bakım has-talarından, 29 (%16,5)’unu dahili servislerden ve 5 (%2,8)’ini cerrahi servislerden izole ettiklerini bil-dirmişlerdir. Öztürk ve ark.’nın [15] çalışmasında ise 36 izolatın 18 (%50)’i yoğun bakım ünitelerinde, 7 (%19)’si genel cerrahi servisinde, 6 (%17)’sı diğer cerrahi birimlerde (beyin cerrahisi, ortopedi, çocuk cerrahisi, kalp-damar cerrahisi) ve 5 (%14)’i dahili birimlerde (enfeksiyon hastalıkları, nöroloji, gastro-enteroloji) tedavi gören hastalardan izole edilmiştir. Ülkemizde kan dolaşımı enfeksiyon etkenleriyle ilgili çalışmalarda mantar türleri %3,3 ile %22 ara-sında farklı oranlarda bildirilmiştir [16-18]. Hacet-tepe Üniversitesi’nde 2000-2011 yılları arasında pe-diatrik hastalardan alınan kan kültürleri incelenmiş; kontaminasyon sonucu görülebilen etkenler değer-lendirme dışı bırakıldığında gram pozitif bakterile-rin %36,7, gram negatif etkenlebakterile-rin %41,3, mantar-ların ise %22,0 oranında ürediği belirtilmiştir [16]. Üreyen mantarlar arasında C. albicans (%47,3) ile C. parapsilosis (%21,7) ilk ve ikinci sırada yer al-mıştır. Tür düzeyinde incelendiğinde kandida en-feksiyonlarının %50-70’inde Candida albicans’ın, %30-50’ ini ise albicans dışı türlerin etken olduğu belirtilmiştir [8,13-15]. Çalışmamızda izolatlarımı-zın %60,3‘nü C. albicans, %39,7’sini albicans dışı kandida türleri oluşturmuştur. Antifungal tedavi se-çiminde etken kandida türünün belirlenmesi önem taşımaktadır. Örneğin, flukonazole karşı C. kru-sei’de doğal direnç, C. glabrata’da ise azalmış du-yarlılık varken, Candida lusitaniae’da diğer türlere nazaran amfoterisin B duyarlılığının az olduğu bil-dirilmiştir [14]. Kandida türlerinin tanımlanmasın-da MALDI TOF-MS’in yüksek performansı çeşitli çalışmalarda belirlenmiştir. Ferreira ve ark. [19] MALDI TOF-MS’in konvansiyonel yöntemlerle uyumluluğunu cins düzeyinde %100, tür düzeyin-de düzeyin-de %99,2 olarak bildirmiş; MALDI TOF-MS’in geleneksel yöntemlerden daha hızlı, güvenilir ve ekonomik olduğunu vurgulamışlardır. Yaman ve ark. [20], toplam 281 Candida spp. izolatını gele-neksel, moleküler ,VITEK 2 otomatize sistemi ve MALDI TOF-MS ile çalışmış; MALDI TOF-MS’in kandida türlerini %100 doğru tanımladığını

bildir-mişlerdir. Çalışmada hasta materyallerinden izole ettiğimiz suşları geleneksel yöntemlerle tanımlama gereği duyulmamıştır. Sadece çimlenme borusu tes-ti (ÇBT) ile albicans ve albicans dışı kandida ay-rımına gidilmiştir. ÇBT pozitif izolatların tamamı (179 izolat, %60,3) MALDI-TOF MS ile C. albi-cans olarak tanımlanmıştır. C. tropicalis (%13,6) ve C. parapsilosis (%11,4), C. albicans’dan sonra en sık izole ettiğimiz diğer kandida türleridir. Bayram ve ark., [21] klinik örneklerden ürettikleri 112 Can-dida spp. izolatında C. albicans (56 izolat, %50), C. parapsilosis (27 izolat, %24) ve C. kefyr (12 izolat, %11)’i en sık üç tür olarak rapor etmişlerdir. Zer ve ark., [22] yoğun bakım hastalarına ait %54’ü idrar, %11’i kan ve %28’i trakeal aspirat olan örnekler-den izole ettikleri Candida spp. suşlarında tür da-ğılımını; %56,09 C. albicans, %11,21 C. tropicalis, %10,24 C. parapsilosis, %5,83 C. glabrata, %4,39 C. kefyr, %3,41 C. lusitaniae, %2,92 C. famata, %2,92 C. krusei ve %2,92 C. guilliermondii olarak belirtmişlerdir. Cömert ve ark. [23] ise yoğun ba-kım hastalarına ait, %58’i idrar, %7’si kan, %15’i solunum örneklerinden üretilen 320 maya mantarı-nın tür dağılımlarını, %65,6 ile C. albicans, %11,3 ile C. parapsilosis, %8,8 ile C. glabrata ve %7,8 ile C. tropicalis olarak bildirmiştir. Çalışmamızda kandida türlerini en sık izole ettiğimiz klinik örnek-ler idrar (161 örnek, %54,2), kan (78 örnek, %26,3) ve vajen sürüntü (34 örnek, %11,4) örnekleriydi. Hastalarımızın yaş ortalaması 49,47 ±27,23 (0-97 yaş) olarak saptandı. Kandida üreyen tüm hastaların 173 (%58,2)’ü kadın, 124 (%41,8)’ü erkek hasta-lardan oluşmaktayken, invaziv örneklerde kandida üreyen toplam 84 hastanın 50 (%59,5)’si erkek, 34 (%40,5)’ü kadındı. Kandida enfeksiyonları her yaşta görülebilen ancak bağışıklığı baskılanmış ve hastanede yatan hastalarda ciddi sonuçlara neden olabilen enfeksiyonlardır.

SONUÇ

Candida albicans, %60,3 ile laboratuvarımızda en sık saptanan maya mantarı olmaya devam etmekte ancak diğer türler de (%39,7) önemli oranda enfek-siyona yol açmaktadır. Kültürde üreyen maya man-tarlarının tür düzeyinde tanımlanması konvansiyo-nel yöntemlerle birkaç günde, kütle spektrometresi ile dakikalar içinde gerçekleşmektedir. Özellikle uzun süre hastanede yatan, bağışıklığı baskılanmış

(5)

ve uzun süreli geniş spektrumlu antibiyoterapi alan hastalarda mantar enfeksiyonları ciddi morbidite ve mortaliteye yol açmaktadır. Farklı antifungal direnç profillerine sahip kandida türlerinin kısa sürede ta-nımlanması bu hastaların tedavisine ciddi oranda katkı sağlar. Maya mantarları için rutin antifungal duyarlılık testi istenmemekle birlikte invaziv ör-neklerden izole edilen Kandida türleri için duyar-lılık testi çalışılması önerilmektedir. Bu çalışmanın dezavantajı, izole edilen türlerde antifungal duyar-lılığın saptanmamış olmasıdır ancak tür düzeyinde erken tanımlamanın tedavi bazında önemli katkı sağladığını düşünmekteyiz.

18-22 Kasım 2015 Antalya, Ulusal Mikrobiyoloji Kong-resinde sunulmuştur.

Çıkar Çatışması Beyanı: Yazarlar çıkar çatışması olma-dığını bildirmişlerdir.

Finansal Destek: Bu çalışma her hangi bir fon tarafın-dan desteklenmemiştir.

Declaration of Conflicting Interests: The authors de-clare that they have no conflict of interest.

Financial Disclosure: No financial support was received.

KAYNAKLAR

1. Croxatto A, Prod’hom G, Greub G. Applications of MALDI-TOF mass spectrometry in clinica ldiagnostic microbiology. FEMS Microbiol Rev. 2012;36:380-407.

2. Wieser A, Schneider L, Jung J, Schubert S. MALDI-TOF MS in microbiological diagnostics identification of microorganisms and beyond. Appl Microbiol Biotechnol 2012;93:965-74. 3. Yılmaz S, Duyan S, Artuk C, Diktaş H. Mikrobiyolojik

Ta-nımlamada MALDI-TOF MS Uygulamaları TAF Preventive. Medicine Bulletin 2014;13:421-6.

4. Bizzini A, Durussel C, Bille J, et al. Performance of matrix-assisted laser desorption ionisation-time of flight mass spec-trometry for identification of bacterial strains routinely iso-lated in a clinical microbiology laboratory. J ClinMicrobiol 2010;48:1549–54.

5. Van Veen SQ, Claas EC, Kuijper EJ. High throughput identifi-cation of bacteria and yeast by matrix-assisted laser desorp-tion ionizadesorp-tion-time of flight mass spectrometry in conven-tional medical microbiology laboratories. J Clin Microbiol 2010;48:900–7.

6. Bizzini A, Greub G. Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry, a revolution in clinical mi-crobial identification. Clin Microbiol Infect 2010;16:1614-9. 7. Hancı SY, Derici YK, Şirin MC, et al.Üçüncü basamak bir has-tanede, geriatrik olgularda izole edilen kandida türlerinin tip-lendirilmesi ve kanda üreyen mayalarda antifungal duyarlılık. Dicle Med J 2015;42:438-44.

8. Pulcrano G, Iula VD, Vollaro A, et al. Rapid and reliable MALDI-TOF mass spectrometry identification of Candida

non-albicans isolates from bloodstream infections . Journal of Microbiological Methods 94;2013:262–66.

9. Feyzioğlu B, Doğan M, Özdemir M, et al. Kandida Türlerinin Tanımlanmasında Corn Meal Agar, Kandida ID2 Kromojenik Besiyeri ve API 32 IDC Performansının Değerlendirilmesi. Selçuk Tıp Derg 2014;30:43-5.

10. Kim SH, Shin JH, HaMok J, et al. Misidentification of Kan-dida guilliermondii as C. famata among Strains Isolated from Blood Cultures by the VITEK 2 System. Bio Med Research International 2014, Article ID 250408, 6 pages.

11. Carolis E.D, Hensgens L.A.M, Vella A, et al. Identification and typing of the Kandida parapsilosis complex: MALDI-TOF MS vs. AFLP. Medical Mycology 2014;52;123–30. 12. Lacroix C, Gicquel A, Sendid B, et al. Evaluation of two

ma-trix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) systems for the identifica-tion of Kandida species. Clin Microbiol Infect 2014;20:153– 58.

13. Atalay MA, Sav H, Demir G, et al.Kan Kültürlerinden İzo-le Ediİzo-len Kandida Türİzo-lerinin Dağılımı ve Amfoterisin B ve Flukonazole İn V itro Duyarlılıkları. Selçuk Tıp Derg. 2012;28:149-51.

14. Sarıgüzel FM, Koç AN, Karagöz S. Kan Kültürlerinden İzole Edilen Maya Türlerinin Vıtek 2 Sistemi ile Tanımlanması ve Antifungal Duyarlılıkları. Harran Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2015;12:261-8.

15. Öztürk T, Özseven AG, Çetin ES, et al. Kan Kültürlerinden İzole Edilen Kandida Suşlarının Tiplendirilmesi ve Anti-fungal Duyarlılıklarının Araştırılması. Kocatepe Tıp Dergisi 2013;14:17-22.

16. Gülmez D, Gür D. Hacettepe Üniversitesi İhsan Doğramacı Çocuk Hastanesi’nde 2000-2011 Yılları Arasında Kan Kül-türlerinden İzole Edilen Mikroorganizmalar: 12 Yıllık Değer-lendirme. J Pediatr Inf 2012;6:79-83.

17. Çetin F, Mumcuoğlu İ, Aksoy A, et al. Kan kültürlerinden izo-le ediizo-len mikroorganizmalar ve antimikrobiyal duyarlılıkları. TurkHij Den Biyol Derg 2014:67.

18. Yılmaz S, Gümral R, Güney M, et al. İki yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyo-tik duyarlılıkların değerlendirilmesi. Gülhane Tıp Dergisi 2013;55:247-52.

19. Ferreira L, Juanes FS, Vega S, et al. Identification of fungal clinical isolates by matrix-assisted laser desorption ioniza-tion-time-of-flight mass spectrometry . Rev Esp Quimioter 2013;26:193-7.

20. Yaman G, Akyar I, Can S. Evaluation of the MALDI TOF-MS method for identification of Kandida strains isolated from blood cultures. Diagn Microbiol Infect Dis. 2012 May;73:65-7.

21. Bayram Y, Gültepe B, Özlük S, et al.Çeşitli Klinik Örnek-lerden İzole Edilen Kandida Kökenlerinin İdentifikasyonu ve Antifungal Duyarlılıklarının Araştırılması Van Tıp Dergisi 2012;19:177-81.

22. Zer Y, Balci I, Meriç G. Identification and antifungal suscep-tibility of Candida isolated from intensive care unit patients. New Microbiol 2002;25:489-94.

23. Comert F, Kulah C, Aktas E, et al. Identification of Kandida species isolated from patients in intensive care unit and in vi-tro susceptibility to fluconazole for a 3-year period. Mycoses 2007;50:52-7.

Referanslar

Benzer Belgeler

Objective: This study aims to identify enterococci isolated from squeezed cheeses by MALDI-TOF-MS and 16S rRNA sequence analysis and to evaluate antibiotic resistance

Ek olarak MALDI-TOF MS yöntemiyle idrar örneğinden direkt bakteri tanımlanması öncesinde Gram boyama uygulamasının etkinliği araştırılmış ve Gram boyamanın

Sonuç olarak; bla OXA-51-benzeri gen varlığı ile ARDRA sonuçları uyumlu bulunmuş (179/180, %99.4) ve A.baumannii tür düzeyinde tanımlanması için referans

Çalışmamızda, Candida türlerinin tanımlamasında altın standart yöntem olarak DNA dizi analizi yöntemi referans alınarak, tam otomatize tanımlama sistemi Phoenix™ Yeast

Çalışmamızda; laboratuvarımızda izole edilen GSBL üreten E.coli izolatlarında, yüksek riskli ST131 klonunun varlığının ve görülme sıklığının saptanması, ST131

Enfektif endokardit etkeni olarak sıklıkla karşımıza çıkan viridans grup streptokoklar (VGS)’ın doğ- ru tanımlanması her zaman klinik mikrobiyoloji laboratuvarı

MALDI- TOF MS (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry) sistemi direkt olarak pozitif kan kültür şişelerinden bakteri tanımlamasına imkan

By co-operating with different laser induced light, it can be applied to different substance analysis, and b y the scattering light excited by laser, substances can be corresponded