ORGANİK KİMYA
“Karbon bileşiklerinin kimyası” olarakta isimlendirilirler.
Karbon bileşikleri C ve H’den oluşur.
Bağ türü ve molekül yapılarına göre ya
Doymuş (alkanlar, parafinler, alifatikler)
Doymamış (alkenler, alkinler, olefinler)
Ya da
Düz zincirli (asiklik)
Halkalı (siklik)
bileşikler olarak gruplandırılırlar.
Kovalent bağlı karbon omurgalı moleküller organik bileşikler olarak isimlendirilirler.
Biyomoleküllerin çoğunluğu organik bileşiktir.
Gerek bitkisel gerekse hayvansal organizmaların
yapı ve hayatlarını sürdürebilmeleri için gerekli
olan klorofil, vitamin, hormon, enzim, koenzim,
protein, yağ asidi ve karbonhidrat gibi pek çok
bileşik organik yapıdadır.
Organik kimyanın bir bilim dalı olarak 1780’lerde gelişimi ile birlikte;
Canlı organizmadan elde edilen bileşikler
organik, cansız kaynaklardan elde edilen ise
inorganik bileşikler olarak tanımlanmıştır.
Scheele
Üzümden = Tartarik asit
Elmadan = Malik asit
Limondan = Sitrik asit
Sütten = Laktik asit
İdrardan = Ürik asit
elde etti.
Molekül formülleri aynı kimyasal özellikleri farklı olan bileşiklere İZOMER denir.
Liebig-Wöhler:
İzomer moleküllerin varlığını göstererek izomeri
kavramını tanımladılar.
Organik bileşikler ile inorganik bileşikler arasında farklar vardır.
Bu farklılıklar karbonun periyodik cetveldeki
yerinden kaynaklanır.
Organik bileşikler genellikle yanıcıdır.
Organik bileşiklerin erime noktaları genellikle düşüktür (300
0C den düşüktür).
Organik bileşikler genellikle suda çözünmezler.
Organik bileşiklerin çoğunun yapısı iyonik değildir.
Organik bileşiklerde izomerizm büyük rol oynar.
İnorganik bileşikler yanıcı değildir.
İnorganik bileşiklerin erime noktaları genellikle yüksektir.
İnorganik bileşiklerin çoğu suda çözünürler.
İnorganik bileşikler iyonik yapıdadır.
İnorganik bileşiklerde izomerizm yoktur.
Organik bileşiklerin oluşumunda katalizörlerin rolü büyüktür.
Farklı katalizörler kullanılarak aynı maddelerden farklı
bileşikler oluşturulabilir.
Organik bileşiklerle yapılan
reaksiyonlar fazla ısı ve zaman gerektirir.
Organik bileşiklerin dansitesi genellikle düşüktür.
Organik bileşiklerin
reaksiyonları kantitatif değildir.
İnorganik bileşiklerin
reaksiyonları daha hızlıdır.
Orbitaller ve Kovalent Bağlanma
Hidrojen Bağlanma: Hidrojen (H
2) en basit moleküldür.
Hidrojen atomu 1s orbitalinde bir elektron taşır.
İki hidrojen atomu arasında bir moleküler orbital
oluşur ve kovalent bağ meydana gelir. Bu
moleküler orbitale sigma (σ) moleküler orbitali,
oluşan bağa sigma bağı denir.
Karbonun melez orbitalleri
Karbon 1s orbitalinde 2 elektron taşır ve dolu olan bu orbital bağ yapımında kullanılmaz.
Karbonun değerlik eletronları ikinci ana enerji düzeyindeki 4 elektronudur.
İkinci ana enerji düzeyinde 2s ve üç 2p olmak üzere 4 orbital vardır.
Karbon bağ yaparken bu dört orbitali bu
durumlarıyla kullanmaz onları melezleştirir.
Üç şekilde melezleştirilir
1- sp
3melezleşmesi, karbon 4 tekli bağ yaptığında kullanılır.
2- sp
2melezleşmesi, karbon çift bağ yaptığında kullanılır.
3- sp melezleşmesi, karbon üçlü bağ veya bitişik
(kümüle) çift bağ yaptığında kullanılır.
Karbon atomu, melez orbitaller daha iyi
örtüştükleri, daha düşük enerjili, daha
kararlı moleküller oluşturdukları için
melezleşmiş orbitallerle bağ yapar.
Metanda C atomu 4H’ine 4 eşdeğer bağ ile bağlanmıştır. CH bağları arasındaki bağ açısı 109,5
0dir. Bu dört eşdeğer bağ dört atomik orbitalin bir 2s ve üç 2p orbitallerinin karışmasıyla sp
3melez orbitalleri oluşur.
sp
3Melezleşmesi
Karbon çekirdeğinin etrafında dört sp
3melez orbitali, negatif yüklerin birbirini
itmesi nedeniyle birbirlerinden
olabildiğince uzak, bir düzgün dört
yüzlünün (tetrahedron) köşelerine
yönlenmiş durumda bulunurlar. sp
3melezleşmesi yapmış C atomuna düzgün
dört yüzlü C atomu da denir.
Herhangi bir molekülde, bir C atomu dört
başka atoma bağlanmışsa sp
3melezleşmesi yapmıştır ve bağın dördü
de sigma bağıdır. Eğer bir engel yoksa
bağ açıları 109,5
0dir.
sp
2Melezleşmesi
Karbon atomu, başka bir atoma iki bağ ile bağlanmışsa sp
2melezleşmesi yapmıştır.
Karbon, sp
2bağlayıcı orbitallerini oluşturmak için 2s orbitali ile 2p orbitallerinden ikisini melezleştirir.
Melezleşme için üç atomik orbital
kullanıldığından üç tane sp
2melez orbitali oluşur.
Karbon çekirdeği etrafındaki üç sp
2melez orbitali birbirinden olabildiğince uzak olacak şekilde yerleşirler. Aralarındaki açı 120
0dir.
sp
2melezleşmesi yapmış karbon atomuna
eşkenar karbon denir.
Etilen’de karbon atomları birer sp
2melez orbitallerinin örtüşmesiyle kendi aralarında bir sigma bağı oluştururlar. Sigma bağı çift bağları oluşturan bağlardan biridir.
Karbon atomlarının geriye kalan ikişer sp
2melez orbitalleri H atomlarıyla bağ yapar. Ayrıca her bir C atomu melezleşmemiş bir p atomik orbitali taşır.
Geriye kalan bu p orbitalleri, biri sigma bağları
düzleminin altında, diğeri ise üstünde olan iki loba
sahiptirler ve birer elektron taşırlar .
Eğer bu p elektronları, bağlayıcı bir moleküler orbitalde ortaklaşırlarsa sistemin enerjisi azalır. P orbitalleri yan yana bulunduklarından yan yana örtüşürler.
Yandan örtüşme ile oluşan bu bağa pi (π)
bağı denir ve çift bağı oluşturan diğer bağdır.
Başka 3 atoma bağlanmış C atomu sp
2melezleşmesi yapmıştır.
Kararlı bileşiklerde sp
2melezleşmesi yapmış
C atomunun p orbitali komşu bir atomun p
orbitali ile örtüşür. Bu komşu atom karbon
olabileceği gibi başka bir elementin atomu
da olabilir.
İki p orbitalinden oluşan pi bağı sigma bağına göre daha az kararlıdır.
Pi elektronları daha yüksek enerjili oldukları için dış etkilere karşı sigma bağı elektronlarından daha duyarlıdırlar, daha kolay polarlanırlar ve yüksek enerjili bir orbitale daha kolay atlarlar.
Dışarıdaki bir atom veya molekül pi bağına
daha kolay saldırır (etkin bölge).
Pi bağı, çift bağlı C atomlarını sıkı sıkıya tutar, ayrıca bu C atomlarına bağlı diğer atomları da sabit tutar.
Çift bağlı karbon atomlarının ve bunlara
bağlı grupların çift bağ ekseni etrafında
dönebilmeleri için pi bağının kopması
gerekir.
sp Melezleşmesi
Bir C atomu yalnızca iki başka atoma bağlanmışsa sp melezleşmesi yapmıştır.
sp melezleşmesi bir 2s orbitali ile bir 2p orbitalinin karışımından oluşur.
Herbiri tek elektron taşıyan iki 2p orbitali
melezleşme dışı kalır.
P orbitaller hem birbirine, hem de sp orbitaline diktir.
Orbitalleri arasında 180
0’lik açı bulunmaktadır.
Asetilen’de iki C atomu sp-sp sigma bağlarıyla bağlanmıştır. Ayrıca her C bir H atomuna sp-s sigma bağıyla bağlıdır.
Bir C’daki iki p orbitali de iki pi-bağı yapmak üzere
diğer C’un iki p orbitali ile örtüşür. Yani sp
melezleşmesinde 1 sigma ve 2 pi bağı bulunur.
Fonksiyonel (işlevsel) Gruplar
Molekülün kimyasal etkinliğe sahip bölgesine işlevsel grup denir.
Bir organik molekülde kimyasal tepkimenin
meydana gelmesini sağlayan pi bağı ya da
elektronegatif (veya elektropozitif) bir atom bir
işlevsel grup ve ya işlevsel grubun parçası
olabilir.
Aynı işlevsel grubu taşıyan bileşikler benzer kimyasal tepkimeleri verme eğilimindedirler.
Örneğin: hidroksil grubu taşıyan moleküller benzer kimyasal tepkimeler verirler ve alkol sınıfına girerler.
Aynı işlevsel grubu taşıyan bileşiklerin
kimyasal özellikleri benzer olduğu için bunları
bir genel formül ile göstermek mümkündür.
Yalnızca sp
3melezleşmesi yapmış C atomları ve hidrojenleri taşıyan alkil grubu R ile gösterilir.
R = bir alkil grubudur.
CH
3- : metil
CH
3CH
2- : etil gibi
ROH = bir alkoldür.
CH
3OH : metil alkol
CH
3CH
2OH : etil alkol gibi
Karbonil grubu
Karbonil grubu (C=O), çeşitli işlevsel grupların bir bölümüdür.
Bileşiklerin işlevsel grubu ve sınıfı, karbonil
grubuna bağlı diğer atomlar tarafından
tayin edilir.
Eğer bu karbonil grubuna,
Bir H bağlanırsa aldehit meydana gelir.
İki C bağlanırsa keton oluşur.
OH grubu bağlanırsa karboksilli asitler oluşur.
Konjuge çift bağlar
Organik moleküllerde çift bağlar başlıca iki konumda bulunabilirler.
Çift bağlar arasında birer tek bağ varsa bunlara konjuge çift bağlar denir.
Çift bağlar arasında birden fazla tek bağ varsa
bunlara ayrık (izole) ya da konjuge olmayan çift
bağlar denir (yani çift bağlardaki karbon atomları
komşu değildir).
Aromatik Sistemler
Benzen halkalı bir bileşiktir.
Her C sp
2melezleşmesi yapmış 6 C’dan oluşur.
Her bir C, bir H’e bağlıdır.
Organik Bileşiklerde İzomeri
Sadece C ve H içeren bir bileşik hidrokarbon adını alır.
Metan, Etilen, Benzen gibi
Yalnız sp
3melezleşmesi yapmış karbon atomlu hidrokarbonlara alkan denir.
Eğer bunların C atomları halka biçiminde
birleşmişse sikloalkanlar adı verilir.
Alkan ve sikloalkanlara doymuş hidrokarbonlar adı verilir.
Bu bileşikler H ile reaksiyon vermezler.
Pi bağı içeren bileşiklere doymamış bileşikler denir. Bu bileşikler H ile tepkimeye girerek doymuş ürünler verir.
Aynı molekül formülü ile gösterilen iki yada daha
fazla sayıda farklı bileşiğe izomer denir.
İzomerlerin Sınıflandırılması
Yapı (konstitüsyon) İzomeri: Aynı yapıtaşlarının farklı sıralanması
- İskelet izomeri - Pozisyon izomeri - Fonksiyonel izomeri
Konfigürasyon (stereo) izomeri:
Şiralite
Cis-Trans İzomeri
Konformasyon izomeri: Serbest dönmenin sonucu
Yapı İzomerleri
Organik bileşiklerin yapılarındaki çeşitlilik
Molekülde bulunan farklı sayıdaki atom tiplerinden
Bir moleküldeki atomların birbirine bağlanma düzeninden kaynaklanabilir.
Aynı molekül formülü ile gösterildiği halde
atomların bağlanma düzenleri farklı olan bileşiklere
yapı izomeri denir.
İskelet izomeri: Temel iskeletteki C atomlarının farklı dizilimleri
Örnek: n-hekzan, 2-metil pentan
Üç yada daha az sayıda C içeren atomların izomeri yoktur.
Dört C’lu alkanda karbon atomları düz ve dallanmış zincirli olmak üzere iki farklı şekilde düzenlenebilir.
Bir işlevsel grubun bir molekülde farklı durumlarda
bulunması da yapı izomerisine neden olur.
Pozisyon izomeri:
Primer (I) C atomu: Komşu C atomuna tek valansları ile bağlanmışlardır. Zincir başında ve sonunda yer alır.
Sekonder (II) C atomu: Zincir içinde yer alırlar,
komşu C atomuna iki valansları üzerinden
bağlanırlar.
Tersiyer (III) C atomu: Komşu 3C atomuna 3 valansları üzerinden bağlanırlar. Zincirdeki dallanma noktasında yer alırlar.
Quarter C atomu: Komşu 4 C atomuna 4 valansları
üzerinden bağlanırlar. Zincirde her iki yana dallanma
olan bölgede yer alır.
Fonksiyonel İzomeri: Fonksiyonel grupların farklı pozisyonlarda yer alması.
Örneğin C
2H
6O molekül formülü için iki farklı yapı molekülü yazılabilir.
CH
3OCH
3(dimetileter): oda sıcaklığında gaz olup, soğutucu ve itici gaz olarak kullanılır.
CH
3CH
2OH (etilalkol): oda sıcaklığında sıvıdır. Hem çözücü hemde alkollü içeceklerin yapımında
kullanılır.
Konfigürasyon izomeri
Cis-Trans İzomeri: Halka sistemindeki ve çift bağlardaki substitüentlerin farklı dizilişi ile oluşur. Bir alkenin yapısını yazarken sp
2melezleşmesi yapmış C atomlarını ve bunlara bağlı diğer atomları bütünüyle bir düzlem içindeymiş gibi gösteririz.
Benzer iki grup
Çift bağın iki yanındaysa molekül cis,
Çift bağın karşıt yanlarında ise molekül trans yapıdadır.
Cis ve trans 1,2-dikloreten farklı fiziksel özelliklere sahiptir.
Bunlar değişik bileşiklerdir. Ancak bunlar yapı izomerleri değildirler.
Çünkü, cis ve trans izomerlerde atomların sırası ve çift
bağın yeri her iki bileşikte aynıdır.
Cis ve trans 1,2-dikloreten bileşikleri birbirinin steroizomeridir.
Yani, bunlar sadece atomlarını uzaydaki dizilişleri farklı olan, aynı yapıya sahip değişik bileşiklerdir.
Bunlar geometrik izomerlerin özel bir grubunu
oluşturur. Bunlara cis-trans izomerlerde denir.
Şiralite (Molekül asimetrisi, Optik izomeri): Asimetrik C atomundaki farklı dizilim.
Kiral (asimetrik) karbon atomu: Dört farklı gruba bağlanmış C atomuna kiral karbon atomu veya asimetrik karbon atomu denir. Aslında kiral olan C atomu değil moleküldür.
Kiral bir molekülün en önemli yapısal özelliği C atomunun sp
3melezleşmesi yapmış olmasıdır.
İki enantiomeri vardır (L – D).
Üst üste çakışmazlık (kirallik) dışında enantiomerlerin yapıları aynıdır. Bu nedenle hemen hemen tüm fiziksel ve kimyasal özellikleri aynıdır.
Ancak, iki özelliği farklıdır;
Diğer asimetrik bileşiklerle etkileşimi
Polarlanmış ışık ile etkileşimi
Adi ışık, çeşitli dalga boylarında ve çeşitli düzlemlerde hareket eden dalgalardan oluşmuştur.
Dalga hareketi, ışığın yayılma doğrultusuna diktir.
Polarize ışığın yayılma düzlemini sağa çeviren enantiomere destrorotatori yada sağa çeviren denir.
Bunun ayna görüntüsü polarize ışığın yayılma düzlemini sola çevirir ve buna levorotator yada sola çeviren adı verilir.
Adlandırmada sağa çeviren (+),
sola çeviren (-) işaretiyle belirtilir
Bir bileşiğin optik izomerlerinin maksimum sayısı 2
n’dir.
n: kiral karbonların sayısıdır.
2 asimetrik karbonu varsa 4 stereoizomeri olabilir.
3 asimetrik karbonu varsa 8 stereoizomeri
olabilir.
Konformasyon İzomeri
Konformasyonları göstermede üç çeşit formül kullanılır;
1) Üç boyutlu formüller
2) Top ve çubuk formülü
3) Newman iz düşümleri
Top ve çubuk formülü ile üç boyutlu formül bir bileşiğin moleküler modelinin üç boyutlu gösterilişidir.