/ An Introduction to Biophysics I / An Introduction to Biophysics I GENEL TANIM / GENERAL DESCRIPTION

(1)

2021 - 2022 / 9101045652005 - An Introduction to Biophysics I / An Introduction to Biophysics I

GENEL TANIM / GENERAL DESCRIPTION

Ders Adı / Course Name An Introduction to Biophysics I / An Introduction to Biophysics I Ders Kodu / Course Code 9101045652005

Ders Türü / Course Type

Ders Seviyesi / Course Level Second Cycle / Second Cycle

Ders Akts Kredi / ECTS 8.00

Haftalık Ders Saati (Kuramsal) / Course Hours For Week (Theoretical)

3.00

Haftalık Uygulama Saati / Course

Hours For Week (Objected) 0.00 Haftalık Laboratuar Saati / Course

Hours For Week (Laboratory) 0.00 Dersin Verildiği Yıl / Year 1

Öğretim Sistemi / Teaching System Face to Face / Face to Face Eğitim Dili / Education Language Turkish / Turkish

Ön Koşulu Olan Ders(ler) /

Precondition Courses Yok None

Amacı / Purpose Biyofiziğin temel kavramlarının öğretilmesi To teach the basic concepts of biophysics

İçeriği / Content Kuantum teorisinin temel özellikleri, hidrojen atomu, kimyasal bağlar, Van der Waals bağları, hidrojen bağları, basit moleküllerin enerji halleri, evrensel gaz kanunu ve yorumlanması, kinetik ısı teorisi, sıvılar ve amorf katılar, katıların elektronik yapısı, enerji band modeli, suyun yapısı ve özellikleri, makromoleküllerin yapısındaki genel özellikler, proteinlerin yapısı ve bazı özellikleri, biyolojik membranların yapısı ve bazı özellikleri, elektromanyetik spektrum, radiometri, fotometri, termal radyasyon, nükleer radyasyonlar ve uygulamaları.

The principle characteristics of quantum theory, hydrogen atoms, chemical bonds, bond energies, Van der Waals bonds, hydrogen bonds, the energy states of simple molecules, the universal gas law, kinetic heat theory, liquids and amorphous solids, electronic structure of solids, energy-band model, the structure and properties of water, general features in the structure of macromolecules, protein structure and some features of proteins, structure and some properties of biological membranes,

electromagnetic spectrum, radiometri, photometry, thermal radiation, nuclear radiations and applications.

Önerilen Diğer Hususlar / Recommended Other Considerations

Yok None

Staj Durumu / Internship Status Yok None

Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar / Books / Materials / Recommended Reading

1. G. Ronto and Tarjan, 1999. “An introduction to biophysics with medical orientation”, Akademia Kiado, Budapest.

2. Ferit Pehlivan, 2004, “Biyofizik”, Ankara

1. G. Ronto and Tarjan, 1999. “An introduction to biophysics with medical orientation”, Akademia Kiado, Budapest.

2. Ferit Pehlivan, 2004, “Biyofizik”, Ankara

Öğretim Üyesi (Üyeleri) / Faculty

Member (Members) Prof. Dr. Nadide KAZANCI

(2)

ÖĞRENME ÇIKTILARI / LEARNING OUTCOMES

1 Canlı organizmaların incelenmesinde fizik yasalarını uygulayabilme Being able to apply the Physical laws to the living organisms.

2 Canlıların atom ve molekül yapısını öğrenebilme Being able to learn the atomic and molecular structure of living organisms.

3 Biyolojik makro molekülleri öğrenebilme Being able to learn the biological macro-molecules.

4 Enerji kavramını biyolojik sistemlere uygulayabilme Being able to apply the energy concept to the biological systems.

5 Hücre zarlarının moleküler organizasyonunu öğrenebilme Being able to learn the molecular organization of cell membranes.

6 Elektromanyetik dalgaların biyolojik etki ve uygulamalarını kavrayabilme Being able to comprehend biological effects and applications of electromagnetic waves.

HAFTALIK DERS İÇERİĞİ / DETAILED COURSE OUTLINE

(3)

Hafta / Week

1

Teorik Dersler / Theoretical Öğretim Yöntem ve

Teknikleri/Teaching Methods Techniques

Ön Hazırlık / Preliminary

Uygulama Lab

Biyofiziğin konusu

The topic of Biophysics

2

Biyofizik ve bilimler arası ortak disiplinler

Biophysics and science among the common disciplines

3

Biyofiziğin kapsamı ve dalları

The scope of biophysics and its branches

4

Birer açık sistem olarak canlılar, canlı organizmalarda madde ve enerji taşınım yolları ve yasaları

One by living organisms as open systems, living organisms and the laws of matter and energy transport routes

5

Atomun vektör modeli ve elektron düzeni

Vector model of the atom and electron arrangement

(4)

6

Yörünge açısal momentumu, manyetik moment, elektron spini, toplam açısal momentum

Orbital angular momentum, magnetic moment, electron spin, total angular momentum

7

Çok elektronlu sistemlerde çiftlenimler, pauli ilkesi

The coupling of multi-electron systems, pauli principle

8

Ara sınav

Midterm exam

9

Canlıların atomik ve moleküler içeriği, molekül içi ve moleküller arası bağlar

Atomic and molecular content of organisms, the molecular bonds within and between molecules

10

Kuvvetli etkileşimler, zayıf etkileşimler, hidrojen bağı, hidrofobik etkileşimler

Strong interactions, weak interactions, hydrogen bonding, hydrophobic interactions

(5)

12

Biyolojik makromoleküller, aminoasitler, peptit bağı

Biological macromolecules, amino acids, peptide bonds

13

Proteinler, nükleik asitler, lipitler

Proteins, nucleic acids, lipids

14

Biyolojik sistemlerde enerji dönüşümleri

Energy transformations in biological systems

15

Termodinamiğin birinci yasası, termodinamiğin ikinci yasası

The first law of thermodynamics, second law of thermodynamics

16

Final Sınavı

Final exam

(6)

DEĞERLENDİRME / EVALUATION

Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri / Term (or Year) Learning Activities Sayı /

Number

Katkı Yüzdesi / Percentage of Contribution (%)

100 1

Ara Sınav / Midterm Examination

Toplam / Total: 1 100

Başarı Notuna Katkı Yüzdesi / Contribution to Success Grade(%): 40

Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri / End Of Term (or Year) Learning Activities Sayı /

Number

Katkı Yüzdesi / Percentage of Contribution (%)

100 1

Final Sınavı / Final Examination

Toplam / Total: 1 100

Başarı Notuna Katkı Yüzdesi / Contribution to Success Grade(%): 60

Etkinliklerinin Başarı Notuna Katkı Yüzdesi(%) Toplamı / Total Percentage of Contribution (%) to Success Grade: 100

Değerlendirme Tipi / Evaluation Type:

İŞ YÜKÜ / WORKLOADS

Ara Sınav / Midterm Examination 1 2.00 2.00

Final Sınavı / Final Examination 1 2.00 2.00

Derse Katılım / Attending Lectures 14 3.00 42.00

Proje Hazırlama / Project Preparation 2 30.00 60.00

Proje Sunma / Project Presentation 2 1.00 2.00

Sayı / Number

Süresi (Saat) / Duration

(Hours)

Toplam İş Yükü (Saat) / Total

Work Load (Hour) Etkinlikler / Workloads

(7)

Dersin AKTS Kredisi = Toplam İş Yükü (Saat) / 30.00 (Saat/AKTS) = 238.00/30.00 = 7.93 ~ / Course ECTS Credit = Total Workload (Hour) / 30.00 (Hour / ECTS) = 238.00 / 30.00 = 7.93 ~

PROGRAM VE ÖĞRENME ÇIKTISI / PROGRAM LEARNING OUTCOMES

Öğrenme Çıktıları / Learning Outcomes Program Çıktıları / Program Outcomes

1.1.1 1.1.2 1.1.3 1.1.4 1.1.5 1.1.6 1.1.7 1.1.8 1.1.9 1.1.1 1.1.1 1.Canlı organizmaların incelenmesinde fizik yasalarını

uygulayabilme / Being able to apply the Physical laws to the living

organisms. 5 5 4 4 4 3 5 4 3 3 4

2.Canlıların atom ve molekül yapısını öğrenebilme / Being able to

learn the atomic and molecular structure of living organisms. 5 5 4 4 4 3 5 4 3 3 4

3.Biyolojik makro molekülleri öğrenebilme / Being able to learn the

biological macro-molecules. 5 5 4 4 4 3 5 4 3 3 3

4.Enerji kavramını biyolojik sistemlere uygulayabilme / Being able

to apply the energy concept to the biological systems. 5 5 4 4 4 3 5 4 3 3 3

5.Hücre zarlarının moleküler organizasyonunu öğrenebilme / Being

able to learn the molecular organization of cell membranes. 5 5 4 4 4 3 5 4 3 3 4

6.Elektromanyetik dalgaların biyolojik etki ve uygulamalarını kavrayabilme / Being able to comprehend biological effects and

applications of electromagnetic waves. 5 5 4 4 4 3 5 4 3 3 4

Katkı Düzeyi / Contribution Level : 1-Çok Düşük / Very low, 2-Düşük / Low, 3-Orta / Moderate, 4-Yüksek / High, 5-Çok Yüksek / Very high