Ankara Üniv Vet Fak Derg, 61, 125-132, 2014
Malaklı Karabaş köpeklerde bazı morfolojik ve genetik özellikler
*Fatih ATASOY1, Metin ERDOĞAN2, Bora ÖZARSLAN3, Banu YÜCEER1, Afşin KOCAKAYA1,
Halil AKÇAPINAR1
1Ankara Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Zootekni Anabilim Dalı, Ankara; 2Afyon Kocatepe Üniversitesi, Veteriner Fakültesi,
Medikal Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı, Afyonkarahisar; 3Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Ankara, Türkiye.
Özet: Bu araştırmada, Türkiye’nin yerli köpeklerinden 18 aylık yaş ve üzeri, 77 dişi ve 200 erkek olmak üzere toplam 277 Malaklı Karabaş köpeğin morfolojik ve genetik özelliklerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Canlı ağırlık (kg) ortalaması dişilerde 53.20±1.01, erkeklerde 62.29±0.68, baş ölçülerinin ortalama değerleri (cm) dişi ve erkeklerde sırasıyla; baş uzunluğu 30.92±0.24, 32.98±0.18; yüz uzunluğu 11.80±0.15, 12.55±0.09; kulak uzunluğu 16.73±0.26, 17.67±0.17; kulak genişliği 13.96±0.26, 14.78±0.18; kulaklar arası mesafe 17.95±0.35, 18.77±0.19; gözler arası mesafe 5.63±0.12, 5.99±0.10; ağız çevresi 29.67±0.28, 32.17±0.22; beden ölçüleri (cm) ise aynı sırayla; cidago yüksekliği 72.98±0.49, 78.36±0.31; sağrı yüksekliği 72.87±0.53, 78.65±0.34; beden uzunluğu 79.02±0.62, 82.68±0.60; göğüs genişliği 24.76±0.35, 26.68±0.20; göğüs derinliği 30.86±0.26, 33.73±0.44; göğüs çevresi 84.47±0.71, 89.89±0.76; ön incik çevresi 14.71±0.12, 15.76±0.08; arka incik çevresi 13.90±0.16, 14.76±0.08; kuyruk uzunluğu 51.36±0.83, 54.76±0.45 olarak tespit edilmiştir. 277 köpek üzerinde yapılan bu çalışmada, birbiriyle akrabalığı olmayanlardan 212’si üzerinde gerçekleştirilen genetik analizler sonucunda, ortalama FIS, FIT ve FST değerleri sırasıyla, 0.0184, 0.0209 ve 0.0025; heterozigotluk
indeksi (He) 0.797; Tajima Nötralite testi sonucu 1.808 olarak tespit edilmiştir.
Anahtar sözcükler: Canlı ağırlık, köpek, Malaklı Karabaş, mikrosatelit, vücut ölçüleri.
Some morphological and genetic characteristics of Malaklı Karabash dogs
Summary: This study was aimed at determining the morphological and genetic traits of Malaklı Karabash dogs in Turkey. Body weight, head and body measurements were taken from eighteen months of age and older, of total 277 dogs (77 female and 200 male). The statistically values (X±SE) on sex groups (female and male, respectively) for body weight (kg), and for head meaures
enclosed head length, face length, ear length, ear width, ears interval, eyes interval, muzzle circumference measures (cm) were detected 53.20±1.01, 62.29±0.68; 30.92±0.24, 32.98±0.18; 11.80±0.15, 12.55±0.09; 16.73±0.26, 17.67±0.17; 13.96±0.26, 14.78±0.18; 17.95±0.35, 18.77±0.19; 5.63±0.12, 5.99±0.10; 29.67±0.28, 32.17±0.22 respectively. The statistic values (X±SE) for
Malaklı female and male dogs for body measurements enclosed height at withers, rump height, body length, chest width, chest depth, heart girth, front and hind cannon bone circumference, tail length measures (cm) were found 72.98±0.49, 78.36±0.31; 72.87±0.53, 78.65±0.34; 79.02±0.62, 82.68±0.60; 24.76±0.35, 26.68±0.20; 30.86±0.26, 33.73±0.44; 84.47±0.71, 89.89±0.76; 14.71±0.12, 15.76±0.08; 13.90±0.16, 14.76±0.08; 51.36±0.83, 54.76±0.45, respectively. For genetic analysis a blood samples were taken from 212 non-relative dogs from a total 277 dogs used in this study. The results of the analysis for FIS, FIT, FST values, heterozygosity (He)
and Tajima Neutrality Test were found to be 0.0184, 0.0209, 0.0025; 0.797 and 1.808, respectively. A020 (18.9%) and B001 (35.2%) haplotypes in Malaklı Karabash population were found to be the highest.
Key words: Body measurements, dog, live weight, Malaklı Karabash, microsatellite.
Giriş
Türkiye’de Akbaş ve Karabaş olmak üzere iki grup çoban köpeği olduğu ifade edilmektedir. Karabaş grubu-nun en ünlü üyesi Kangal ırkı olmakla birlikte Karayaka ve Malaklı Karabaş gibi köpeklerde mevcuttur (5).
Malaklı Karabaş tipi köpekler Aksaray, Şerefli-koçhisar ve Nevşehir başta olmak üzere Türkiye’nin farklı bölgelerinde yetiştirilmektedir. Yapılan saha çalışmalarında Malaklı Karabaş köpeklerin Kangal ırkına göre daha iri yapılı, kısa kıllı, kuyruk yapısının Kangal
köpeğinde olduğu kadar kıvrık olmadığı, insana ve diğer köpeklere karşı daha saldırgan olduğu gözlenmiştir (8). Malaklı genotipinde başta siyah maske (karabaşlılık) bulunması, vücudun boz rengin tonlarında olması ve vücut yapısı bakımından Kangal ırkına benzemesine karşın; büyük baş ve ağız yapısı, sarkık dudakları ve fazla kıvrık olmayan kuyruğu ile Kangal ırkından morfolojik olarak ayrılmaktadır. Malaklı Karabaş köpeklerde çaparlık (kaplan deseni, sarı üzerinde siyah çizgiler) ve alalık (beyaz üzerinde kahverenginin değişik tonlarında lekeler) gibi
∗ Bu araştırma, TÜBİTAK tarafından 109 O 348 proje numarası ile desteklenen projeden özetlenmiştir. Tez çalışması etik kurallara
Fatih Atasoy - Metin Erdoğan - Bora Özarslan - Banu Yüceer - Afşin Kocakaya - Halil Akçapınar 126
renkler de görülebilmektedir. Bu köpeklerde başın nispeten büyük ve dudakların sarkık olması nedeniyle “Malaklı” olarak adlandırılmaktadır (6).
Türkiye’de bugüne kadar Malaklı Karabaş köpekleri ile ilgili herhangi bir resmi kayıt veya bilimsel çalışma yapılmadığı için bir ırk standardı da bulunmamaktadır. Hatta yabancı kaynaklarda ve Uluslararası Köpek Fede-rasyonu (FCI) kayıtlarında da (14) bu ırk ile ilgili herhangi bir bilgiye rastlanmamaktadır.
Bu araştırma, Türkiye’de yerli köpek varlığı içinde önemli bir yere sahip olan Malaklı Karabaş köpeklerinin morfolojik özellikleri, mikrosatelit lokusları ve mitokon-driyal DNA analizi yardımıyla populasyonlar arasındaki genetik ilişkinin belirlenmesi amacıyla yapılmıştır.
Materyal ve Metot
Bu araştırma, Ekim 2009 - Ocak 2012 tarihleri arasında yürütülmüştür. Araştırmanın hayvan materyalini Aksaray, Şereflikoçhisar, Konya (Kulu, Cihanbeyli), Kayseri, Nevşehir (Tuzköy), Yozgat, Niğde, Afyon ve Ankara’ da halk elinde yetiştirilen 18 aylık yaş ve üzeri 77’si dişi 200’ü erkek olmak üzere toplam 277 Malaklı tipi köpek oluşturmuştur.
Köpeklerin baş ve beden ölçüleri literatürlerde (4, 31, 36, 40, 41) belirtildiği şekilde alınmıştır. Canlı ağırlıklar 100 grama hassas tartı ile tartılmıştır. Göğüs çevresi, ön ve arka incik çevresi, kuyruk uzunluğu ile baş ölçüleri ölçü şeridiyle, cidago yüksekliği, sağrı yüksekliği, beden uzunluğu, göğüs derinliği ve göğüs genişliği ise ölçü bastonu ile ölçülmüştür.
Ölçülerin alındığı yerler aşağıda belirtilmiştir. Cidago yüksekliği: Cidagonun en yüksek noktası (vertebrae thoracicae’nin proc. spinosus’larının en üst noktası) ile yer arasındaki dikey uzunluktur.
Sağrı yüksekliği: Sağrının en yüksek noktası (Os ilium’un spina iliaca dorsalis’i) ile yer arasındaki dikey uzunluktur.
Beden uzunluğu: Caput humeri ile tuber ischii arasındaki mesafedir.
Göğüs genişliği: Caput humeri’lerin hemen arkasından alınan yatay ölçüdür.
Göğüs derinliği: Cidagonun en yüksek noktası ile sternum arasında kalan dikey mesafedir.
Göğüs çevresi: Scapula’ların hemen arkasından 13. kostaların processus spinosus’u hizasından alınan göğsü çepeçevre saran ölçüdür.
Ön incik çevresi: Metakarpusların en ince noktasından alınan çevre ölçüsüdür.
Arka incik çevresi: Metatarsusların en ince nokta-sından alınan çevre ölçüsüdür.
Baş uzunluğu: Crista occipitalis’ten burun ucuna kadar olan mesafedir.
Yüz uzunluğu: Göz açılarının birleştiği noktadan burun ucuna kadar olan mesafedir.
Kulak uzunluğu: Auricula’nın kafatasına birleşme çizgisinin orta kısmı ile auricula’nın en uç kısmı arasın-daki mesafedir.
Kulaklar arası mesafe: İki auricula’nın kafatasına birleşen bölümlerinin medial (iç) kenarları arasındaki mesafedir.
Göz arası mesafe: İki gözün medial (iç) açıları (commissura palpeprarum medialis) arası mesafedir.
Genetik Analizler: Kan alınması ve numunelerin hazırlanması için akraba olmayan toplam 212 köpeğin Vena cephalica antebrachii’sinden içerisinde antikoagulant (EDTA) bulunan 10 cc’lik tüplere kan örnekleri alınarak DNA izolasyonu yapılana kadar -20°C’de saklanmıştır.
DNA izolasyonu; kanlardan fenol-kloroform yöntemi ile yapılmıştır (34). Tüm DNA’ların absorbansları 260 ve 280 nm’de Spektrofotometrede ölçülmüştür. DNA örnek-leri mikrosatelit ve DNA dizileme analizi yapılıncaya kadar -35 ºC’de saklanmıştır.
Mikrosatelit belirteçlerinin çoğaltılması Erdoğan ve ark., (13)’na göre yapılmıştır.
Mitokondriyal DNA kontrol bölgesinin (D-loop) çoğaltılmasında Ardalan ve ark., (3)’nın yöntemi kullanıl-mıştır. DNA dizileme analizi sonucu kontrol bölgesi 582 (bp) baz çifti uzunluğunda olacak şekilde Sequencher 4.1 analiz programı ile düzenlenmiş ve haplotipler belirlen-miştir.
Araştırmada mitokondriyal D-loop analizi için 212 hayvana ait DNA örnekleri kullanılmış fakat bunlardan 196 hayvana ait 582 bp uzunluğunda DNA dizisi elde edilmiş ve haplotipleri belirlenmiştir. DNA örneklerini hazırlama veya PCR aşamasındaki kontaminasyondan ya da DNA dizileme cihazından kaynaklanan hatadan dolayı 16 hayvana ait veride problem olması sebebiyle analiz dışı bırakılmıştır.
İstatistik Analizler: Cinsiyet grupları arasında canlı ağırlık, baş ve beden ölçülerindeki farklılıkların önem kontrolleri t testi ile yapılmıştır. Verilerin istatistiki ana-lizleri için SPSS paket programından yararlanılmıştır (2). Ortalama heterozigotluk indeksleri; her bir populas-yonda, her bir lokustaki genetik varyasyonun ölçüsü olan heterozigotluk değerlerinin hatasını azaltmak için yansız (unbiased) olarak Nei (27)’ye göre tahmin edilmiştir. Her bir lokusta hesaplanan heterozigotluk değerlerinden yararlanılarak, populasyonlardaki ortalama heterozigotluk ( ) Nei (28)’ye göre hesaplanmıştır. Populasyonlar arasında tahmin edilen ortalama heterozigotluk indeksleri arasındaki farklılıkların önemli olup olmadığı t-testi ile kontrol edilmiştir.
F-istatistikleri (43, 44) FIT, FST ve FIS örnek esas
alınarak Weir ve Cockerham (43) tarafından önerilen F, θ ve ƒ formunda tahmin edilmiştir. Bunlar GENETIX 4.05 programı (9) kullanılarak hesaplanmıştır.
Populasyonlar arasında meydana gelen gen akışı, bir lokus ve tüm lokuslar için FST değerine bağlı olarak
Köpek p tahmini için yöntemi kull genetik uzak analizinde, d tarafından v method ana analizini ve ve üç boyu bilgisayar pa Bölgele lıkları (π) ve D değeri he bilgisayar pa Canlı A canlı ağırlık istatistik değ Karabaş köp rilmiştir. Can etkisi öneml ağırlık (kg) göre yüksek Genetik için 212 köp Şek Figu populasyonlar Reynolds ve lanılmıştır. Ay klık değerleri dendogramlar verilen UPG alyse) metod dendogram çi utlu grafik aket programın ere göre köpek e populasyon esaplanmıştır aket programı Bu Ağırlık ve Vücu k ve beden ö ğerler Tablo peklerine ait fo nlı ağırlık ve b li bulunmuştu ve beden ölç olduğu belirle k Analizler: Ar peğe ait DNA
kil 1. Malaklı K ure 1. Photogra rı arasındaki g e ark., (32)’nı yrıca Reynold kullanılarak y r için Sneath GMA (unweig du uygulanm izimi için TFP çizimi için ndan (9, 27) y kler arasındak mutasyon ora (30, 37). Bu (38) kullanılm ulgular ut Ölçüleri: Ci ölçüleri ile b 1 ve 2’de ve fotoğraflar ise beden ölçüleri ur (P<0.01). çüsü (cm) de enmiştir. raştırmada mik örnekleri ana arabaş köpekler aphs of Malaklı Ankara Ün enetik uzaklık ın genetik uza ds ve ark., (33) yapılan kümel h ve Sokal gthed pair-g mıştır. Kümel PGA (sürüm GENETIX yararlanılmıştı ki nükleotid fa anı (Ѳ) ve Ta u amaçla Meg mıştır. insiyet gruplar baş ölçülerine erilmiştir. Ma Şekil 1’de gö üzerine cinsiy Erkeklerde c ğerlerinin diş krosatellit anali aliz edilmiş v
rine ait fotoğraf Karabash dogs
niv Vet Fak Der
kların aklık )’nın leme (35) group leme 1, 3) 4.05 r. arklı-ajima ga 4 rında e ait alaklı öste-yetin canlı şilere izleri ve 16 poli seçi hete hete testi hete önem Kar dend loku ile t ve g göst gesi ise T ve yüzd (%4 oldu çeşi dan rastl flar. s. rg, 61, 2014 imorfik mikro ilirken çok say Bölgelere gö erozigotluk i erozigotluk de i sonucunda, h erozigotluk de msiz bulunmu rabaş köpekler dogramı ise Ş Populasyon uslar için FIT (F test edilmiş ve Malaklı Kar gen göçü, ge terilmiştir. Po indeki toplam Tablo 7’de ve Nevşehir (Tu desinin; Niğd 42.9) grupların uğu görülmek tlilik Kayseri en fazla poli lanmıştır. osatellit lokus yıda allele sah öre incelenen indeksleri (H eğerleri Tablo her populasyo ğerleri arasınd uştur (P>0.05 ri arasındaki i Şekil 2’de veri
farklılaşmala F), FST (θ) ve e sonuçları Tab rabaş köpekle enetik uzaklık opulasyonlara haplotip oranl erilmiştir. Aksa uzköy) (%60 de (%52.4), Ne nda A haploti ktedir. Haplo grubunda gö imorfizme Ak su kullanılmış hip olması terc köpek popula He ve Ho)
3’te verilmiş on için hesapla
daki fark istati 5). Bölgelere ilişkileri göste ilmiştir. arı her bir lo
FIS (ƒ) fiksasy
blo 4’te göste eri arasındaki k matrisi Tab göre mt-DNA ları ve haplogr aray (%58.9), 0) gruplarında evşehir (%57 ip yüzdesinin ogrup düzeyin örülürken hapl ksaray ve Niğ 127 ştır. Lokuslar cih edilmiştir. asyonlarındaki ve ortalama tir. Yapılan t-anan ortalama istiki anlamda göre Malaklı eren UPGMA okus ve tüm yon indeksleri erilmiştir. FST istatistiği blo 5 ve 6’da A D-loop böl-rup dağılımları Afyon (%60) a B haplotip .1) ve Yozgat n daha yüksek nde en fazla lotip bakımın-ğde grubunda 7 r i a -a a ı A m i i a -ı ) p t k a -a
Fatih Atasoy - Metin Erdoğan - Bora Özarslan - Banu Yüceer - Afşin Kocakaya - Halil Akçapınar 128 Tablo 1. Malak lı Karaba ş köpeklerinde canl ı a ğı rl ık (kg) v e b az ı be de n öl çü le ri ne (c m) a it i sta ti sti k de ğerl er Tabl e 1 . Sta tisti c valu es for liv e weight (kg) and some bod y measurements in Malakl ı Ka ra ba s dogs P n CY *** n SY*** n BeU** CY/BU n GG*** GÇ*** n GD*** İÇ n Ku yU *** n CA*** n Ö n*** n A rka*** Di şi 42 72.98±0.49 41 72.87±0.53 42 79.02±0.62 0. 92 43 24.76±0.35 84.47±0.71 43 30. 86±0.26 43 14.71±0.12 43 13.90±0. 16 43 51.36±0.83 40 53.20±1.01 Erke k 124 78.36±0.31 123 78.65±0.34 122 82.68±0.60 0.95 123 26.68±0.20 89.89±0.76 124 33.73±0.44 123 15.76±0.08 122 14.76±0.08 120 54.76±0.45 116 62 .29±0.68 Genel 166 77.00±0.32 164 77.20±0.35 164 81.75±0.49 0.94 166 26.18±0.18 88.48±0.62 167 32.99±0.35 166 15.49± 0.08 165 14.53±0.08 163 53.86±0.41 156 59.96±0.65 C Y : C id ago Y üks ekli ği, SY: Sa ğr ı Y üks ek liğ i, Be U: Bede n Uzu nlu ğu, GG : Gö ğüs G en iş liğ i, GÇ: Gö ğüs Çevre si, GD: Gö ğüs D er in liğ i, İÇ: İnci k Çe vr esi , Kuy U :K uy ruk Uzu nl uğ u, CA : Can lı A ğı rl ık ** : P<0 .01, *** : P<0 .001 Not: Ba zı köp ek ler aş ır ı sa ld ırg an ve du ya rl ı da vr an ış lar gösterdi ği i çin g erç ek d eğ erler i ya ns ıtm ay aca ğı ndan baz ı vüc ut öl çü le ri öl çül eme mi ştir. Tablo 2. Malak lı Karaba ş köpeklerde b aş öl çüle ri ne (cm ) ait ist ati stik de ğerler Tabl e 2 . S ta tis tic valu es for h ead m eas urem ents (c m ) in M al akl ı Karabash dogs P n BaU*** n YU*** BaU/YU n K ulU** n KG** n KAM* n GAM* n AÇ*** Di şi 43 30.92±0.24 43 11.80±0.15 2.62 41 16.73±0.26 41 13.96±0.26 43 17.95±0.35 43 5.63±0.12 36 29.67±0.28 Er ke k 124 32.98±0.18 123 12.55±0.09 2.63 67 17.67±0.17 73 14.78±0.18 120 18.77± 0.19 122 5.99±0.10 100 32.17±0.22 Genel 167 32.45±0.16 166 12.36±0.08 2.63 108 17.31±0.15 114 14.49±0.15 163 18. 55±0.17 165 5.89±0.08 136 31.51±0.20 BaU: Ba ş U zunlu
ğu, YU: Yüz u
zunlu ğu, KulU: Kulak Uzunlu ğu, KG: Kulak Geni şli
ği, KAM: Kulaklar Aras
ı Mesafe, GAM: Göz Aras
ı Me sa fe , AÇ: A ğı z Ç evre si * : P<0 .05, ** : P<0.01, *** : P<0.001 Not: Ba zı köp ek ler sa ld ırgan dav ran ış gösterd iğ i iç in a nca k ma ske t ak ılar ak ö lçüm ya pı la bildi ğinden a ğı z çevr eler i, baz ı köpeklerin ise kulak lar ı kesik oldu ğundan ku lak ö lçüleri al ınamam ış tı r. Tablo
3. Bölgelere göre Malakl
ı Karaba şlard a he teroz igotluk inde ksleri (H e ve Ho ), ortalama hetero zigotluk de ğerl er i ve s tand art h at alar ı ( ) Table 3 . Heterozy gosity ind ex (H e ve H o ) of a Malakl ı Karab ash b y regions, av erag e heterozy gosity values and stand ard er rors ( ) Lokus KONY A AKSAR AY Ş. KOÇH İSA R N İĞ DE NEV ŞEH İR KAYSER İ YOZGAT ANKAR A T UZKÖY AFYO N n= 22 n= 82 n= 14 n= 22 n= 21 n= 25 n= 7 n= 9 n= 5 n= 5 He Ho He H o H e Ho He Ho He Ho He Ho H e Ho He Ho He Ho He Ho FHC2010 0.604 0.618 0.600 0.603 0.635 0.659 0.457 0.467 0.473 0.484 0.575 0.587 0. 602 0.648 0.599 0.634 0.580 0.644 0.460 0.511 FHC2054 0.799 0.817 0.859 0.864 0.850 0.881 0.828 0.847 0.831 0.851 0.840 0.857 0. 786 0.846 0.728 0.771 0.700 0.778 0.840 0.933 FHC2079 0.614 0.628 0.631 0.635 0.541 0.561 0.578 0.591 0.550 0.563 0.619 0.632 0. 622 0.670 0.636 0.673 0.420 0.467 0.640 0.711 PEZ1 0.700 0.717 0.740 0.745 0.745 0.773 0.791 0.810 0.779 0.798 0.807 0.824 0. 806 0.868 0.778 0.824 0.740 0.822 0.700 0.778 PEZ5 0.752 0.770 0.776 0.780 0.778 0.807 0.778 0.796 0.770 0.789 0.736 0.751 0. 755 0.813 0.624 0.660 0.580 0.644 0.760 0.844 PEZ6 0.844 0.864 0.814 0.819 0.824 0.855 0.816 0.835 0.850 0.871 0.851 0.869 0. 816 0.879 0.704 0.745 0.740 0.822 0.760 0.844 PEZ8 0.813 0.832 0.724 0.729 0.725 0.751 0.657 0.672 0.672 0.689 0.707 0.722 0. 786 0.846 0.648 0.686 0.460 0.511 0.740 0.822 FH2001 0.716 0.733 0.741 0.745 0.658 0.683 0.802 0.821 0.786 0.805 0.769 0.785 0. 714 0.769 0.722 0.765 0.660 0.733 0.700 0.778 FH2164 0.853 0.873 0.836 0.841 0.783 0.812 0.839 0.858 0.780 0.799 0.790 0.807 0. 816 0.879 0.741 0.784 0.600 0.667 0.780 0.867 FH2247 0.933 0.955 0.937 0.943 0.867 0.900 0.922 0.943 0.935 0.958 0.930 0.949 0. 908 0.978 0.901 0.954 0.860 0.956 0.880 0.978 FH2289 0.910 0.931 0.876 0.882 0.872 0.905 0.879 0.900 0.903 0.925 0.897 0.915 0. 837 0.901 0.852 0.902 0.680 0.756 0.740 0.822 FH2326 0.882 0.903 0.862 0.867 0.860 0.892 0.871 0.891 0.884 0.906 0.874 0.891 0. 806 0.868 0.852 0.902 0.820 0.911 0.600 0.667 PEZ22 0.759 0.777 0.775 0.780 0.727 0.754 0.750 0.767 0.766 0.785 0.702 0.716 0. 806 0.868 0.747 0.791 0.740 0.822 0.740 0.822 FH2161 0.813 0.832 0.790 0.795 0.765 0.794 0.750 0.767 0.808 0.828 0.790 0.807 0. 602 0.648 0.741 0.784 0.660 0.733 0.820 0.911 FH2324 0.851 0.871 0.850 0.855 0.870 0.902 0.862 0.882 0.865 0.886 0.860 0.878 0. 796 0.857 0.815 0.863 0.800 0.889 0.780 0.867 PEZ11 0.785 0.803 0.800 0.805 0.793 0.823 0.812 0.831 0.738 0.756 0.754 0.769 0. 725 0.780 0.765 0.811 0.700 0.778 0.760 0.844 FH2293 0.894 0.914 0.903 0.909 0.834 0.865 0.895 0.915 0.863 0.884 0.924 0.943 0. 888 0.956 0.870 0.922 0.820 0.911 0.820 0.911 ± S h 0.814 ± 0 .024 0.800 ± 0 .022 0.801 ± 0 .024 0.800 ± 0 .030 0.799 ± 0 .030 0.806 ± 0 .025 0.828 ± 0 .024 0.792 ± 0 .023 0.756 ± 0 .033 0.818 ± 0 .027
Ankara Üniv Vet Fak Derg, 61, 2014 129
Şekil 2. Bölgelere göre Malaklı Karabaş köpekler arasındaki ilişkileri gösteren UPGMA dendogramı
Figure 2. UPGMA Dendogram showing the relationship between Malaklı Karabas dogs bred by regions
Tablo 4. Malaklı Karabaş köpeklerdeki f - istatistik değerleri Table 4. F-statistic values for Malaklı Karabas dogs
Locus FIS = ƒ FIT = F FST = θ FHC2010 0.0211 0.0238 0.0028 FHC2054 0.0234 0.0258 0.0025 FHC2079 0.0098 0.0131 0.0033 PEZ1 0.0196 0.0222 0.0027 PEZ5 0.0173 0.0199 0.0026 PEZ6 0.0176 0.0202 0.0027 PEZ8 0.0171 0.0197 0.0026 FH2001 0.0199 0.0224 0.0026 FH2164 0.0166 0.0192 0.0027 FH2247 0.0167 0.0194 0.0027 FH2289 0.0218 0.0235 0.0018 FH2326 0.0212 0.0228 0.0016 PEZ22 0.0181 0.0206 0.0026 FH2161 0.0209 0.0235 0.0027 FH2324 0.0189 0.0213 0.0024 PEZ11 0.0165 0.0185 0.0020 FH2293 0.0191 0.0214 0.0024 Tüm lokuslar (0.0118) 0.0184 (0.0110) 0.0209 (0.0016) 0.0025 ƒ, Populasyon içindeki saf yetiştirme tahmini; F, toplam saf yetiştirme tahmini; θ, populasyon farklılaşma ölçüsü. Standart sapma değeri parantez içinde verilmiştir.
Tablo 5. Bölgelere göre Malaklı Karabaş köpekleri arasındaki FST istatistiği (dik üçgen) ve gen göçü (log(Nm)) (ters dik üçgen)
Table 5.The FST statistics (vertical triangle) and gene migration Nem (inverted vertical triangle) among Malaklı Karabas dogs by
regions
KONYA AKSARAY Ş.KOÇHİSAR NİĞDE NEVŞEHİR KAYSERİ YOZGAT ANKARA TUZKÖY AFYON
KONYA *** 1,65 1,68 1,73 1,66 2,26 2,95 0 1,08 0 AKSARAY 0,0055 *** 0 2,41 1,51 1,77 1,47 0 1,01 0 Ş.KOÇHİSAR 0,0052 -0,0009 *** 1,77 1,89 1,77 1,55 0 1,17 0 NİĞDE 0,0046 0,0010 0,0042 *** 2,52 1,93 1,64 0 1,41 0 NEVŞEHİR 0,0054 0,0077 0,0032 0,0008 *** 0 0 0 1,67 0 KAYSERİ 0,0014 0,0042 0,0042 0,0030 -0,0025 *** 0 0 1,25 0 YOZGAT 0,0003 0,0084 0,0071 0,0057 -0,0042 -0,0080 *** 0 1,19 1,40 ANKARA -0,0008 -0,0022 -0,0009 -0,0022 -0,0075 -0,0058 -0,0103 *** 2,19 0 TUZKÖY 0,0204 0,0236 0,0166 0,0095 0,0053 0,0138 0,0158 0,0016 *** 1,04 AFYON -0,0133 -0,0214 -0,0202 -0,0153 -0,0054 -0,0129 0,0098 -0,0215 0,0225 ***
Tablo 6. Bölgelere göre Malaklı Karabaş köpekler arasındaki genetik uzaklık matrisi Table 6. Genetic distance matrix among Malaklı Karabas dogs by regions
KONYA AKSARAY Ş.KOÇHİSAR NİĞDE NEVŞEHİR KAYSERİ YOZGAT ANKARA TUZKÖY
KONYA ***** AKSARAY 0,0160 ***** Ş.KOÇHİSAR 0,0287 0,0163 ***** NİĞDE 0,0225 0,0125 0,0271 ***** NEVŞEHİR 0,0237 0,0183 0,0269 0,0194 ***** KAYSERİ 0,0190 0,0141 0,0265 0,0199 0,0160 ***** YOZGAT 0,0398 0,0384 0,0500 0,0427 0,0353 0,0315 ***** ANKARA 0,0319 0,0233 0,0364 0,0296 0,0261 0,0265 0,0430 ***** TUZKÖY 0,0683 0,0625 0,0691 0,0569 0,0544 0,0608 0,0827 0,0633 ***** AFYON 0,0403 0,0263 0,0389 0,0367 0,0453 0,0389 0,0763 0,0439 0,0959
Fatih Atasoy - Metin Erdoğan - Bora Özarslan - Banu Yüceer - Afşin Kocakaya - Halil Akçapınar 130
Köpeklere ait nükleotid dizileri için toplam polimorfik bölge sayısı (S), polimorfik bölge oranı (ps), grup
mutasyon oranı (Ѳ), nükleotid farklılıkları (π) ve Tajima D değeri hesaplanmış olup sonuçlar Tablo 8’de verilmiştir. Tablo 8. Malaklı Karabaşlarda Tajima Nötralite Test Sonuçları Table 8. Tajima Neutrality Test Results of Malaklı Karabas dogs
n m S ps Θ π D
196 578 26 0.045 0.0077 0.0127 1.8086
Tartışma ve Sonuç
Canlı Ağırlık ve Vücut Ölçüleri: Malaklı Karabaş köpekler ile ilgili daha önce yapılmış herhangi bir bilimsel çalışma bulunmadığı için, bu çalışmada elde edilen morfolojik özelliklere ait veriler başta Kangal olmak üzere Akbaş ve Kars köpek genotipleri üzerinde yapılmış araştırmaların sonuçlarıyla karşılaştırılmıştır.
Bu araştırmadan elde edilen canlı ağırlık, baş ve beden ölçülerine ait değerlerin Kangal (10, 12, 32, 40, 41, 42), Akbaş (7, 12, 41, 42) ve Kars (12, 21) köpek ırkları üzerinde yapılan araştırmalarda elde edilen değerlerden genellikle daha yüksek olduğu gözlenmiştir. Bu da araştırma materyali köpeklerin genotipinden (daha iri yapılı olmalarından), daha iyi bakım – besleme şartlarına sahip olmalarından kaynaklanmış olabilir. Çoban köpek-lerinde canlı ağırlık ve vücut büyüklüğünün fazla olması istenmektedir. Dolayısıyla Malaklı köpeklerde de bu yönde bir yetiştiricilik olduğu görülmektedir. Bu sonuç-lara göre vücut yapısı bakımından Malaklı köpeklerinin Kangal, Akbaş ve Kars çoban köpeklerinden daha iri yapılı köpekler olduğu söylenebilir.
Ayrıca, baş uzunluğunun yüz uzunluğuna oranının Malaklılarda daha yüksek olması, başın yüze göre daha uzun olduğunu göstermektedir. Cidago yüksekliğinin beden uzunluğuna oranı ise Kangal ırkında birin üzerinde (>1) değer alırken, Malaklılarda birin altında (<1) değer almaktadır. Dolayısıyla, vücut yapısının yandan görünüşü
Malaklılarda dikdörtgene (beden cidagoya göre daha uzun), Kangal’da ise kareye benzemektedir (beden uzunluğu cidago yüksekliğine eşit veya cidago biraz daha yüksek). Sağrı ile cidago yüksekliği kıyaslandığında ise Kangal’a benzer olarak sağrı cidagodan biraz daha yüksektir.
Genetik Analizler: Ortalama heterozigotluk değerinin en az Tuzköy (0,756 ± 0,033), en fazla ise Yozgat (0,828 ± 0,024) köpek populasyonunda olduğu belirlenmiştir. Heterozigotluğun Tuzköy populasyonunda diğer popu-lasyonlara göre daha düşük olması bu bireylerin diğer populasyonlara göre daha kapalı yetiştirildiklerini düşün-dürmektedir.
Malaklı genotipi için hesaplanan heterozigotluk değerleri, farklı ırklar üzerinde yapılan araştırmalarda bildirilen (1, 11, 16, 17, 18, 19, 20, 22, 23, 24, 25, 26, 39) heterozigotluk değerlerinden yüksek bulunmuştur. Bunun sebebi bu araştırmadaki köpeklerin birbiriyle akraba ol-mayan bireylerden seçilmiş olması, çok allelli lokusların seçilmesi ve / veya bu köpek populasyonuna yerli çoban köpeklerinden zaman zaman gen akışının olma olasılığı ile açıklanabilir.
Hesaplanan F istatistiklerine bakıldığında, ortalama FST değerinin çok düşük olması ve heterozigotluğun da
çok yüksek olması bu populasyonun benzer genetik yapıya sahip olduğunu düşündürmektedir. Tajima D değerinin pozitif çıkması ise, populasyonda mutasyon-ların az olmasından, dengeli seçilimden ve populasyonun azalmasından (daralmasından) kaynaklanabilir.
Sonuç olarak, bu araştırma ile Malaklı tipi köpek-lerin Kangal ırkından daha iri bir baş ve bedene sahip olduğu, hem baş uzunluğunun yüz uzunluğuna oranı hem de cidago yüksekliğinin beden uzunluğuna oranı ile elde edilen değerlerle Kangal ırkından ayrıldığı belirlenmiştir. Dolayısıyla morfolojik özellikler bakımından Malaklı Karabaş köpekleri Kangal ırkından farklılıklar göster-mektedir. Ayrıca yapılan genetik analizler Malaklı Karabaş köpek populasyonunun benzer genetik yapıya sahip olduğunu düşündürmektedir.
Tablo 7. Malaklı Karabaşlarda bölgelere göre toplam haplotip oranları ve haplogrup dağılımları Table 7. Total haplotype ratios and haplogroup distributions of Malaklı Karabash population
Populasyon N ABC(DEF) nA(%toplam) nB(%toplam) nC(%toplam) nHT nHG
Konya 20 (1) 10 (47.6) 10 (47.6) - 6 3 Aksaray 72 (1) 29 (39.7) 43 (58.9) - 14 3 Niğde 21 (-) 11 (52.4) 9 (42.9) 1 (4.8) 14 4 Nevşehir 20 (1) 12 (57.1) 8 (38.1) - 8 4 Kayseri 24 (1) 11(44.0) 10 (40.0) 3 (12.0) 10 5 Ş.Koçhisar 12 (-) 6 (50.0) 6 (50.0) - 8 2 Ankara 6 (-) 3 (50.0) 3 (50.0) - 3 2 Yozgat 5 (2) 3 (42.9) 1 (14.3) 1 (14.3) 5 4 Afyon 5 (-) 2 (40.0) 3 (60.0) - 3 2 Tuzköy 5 (-) 1 (20.0) 3 (60.0) 1 (20.0) 3 3 Toplam 190 (6) 88 (44.9) 96 (49.0) 6 (3.1) 23 5
Ankara Üniv Vet Fak Derg, 61, 2014 131
Kaynaklar
1. Altet L, Francino O, Sánchez A (2001): Microsatellite
polymorphism in closely related dogs, J Hered, 92, 276-279.
2. Anonim (2001): SPSS Statistical Package in Social
Science for Windows. Statistical Innovations Inc., Serial
Number 902 4147.
3. Ardalan A, Kluetsch CFC, Zhang A, Erdogan M, Uhlen M, Houshmand M, Tepeli C, Ashtiani SRM, Savolainen P (2011): Comprehensive study of mtDNA
among Southwest Asian dogs contradicts independent domestication of wolf, but implies dog-wolf hybridization,
Ecol Evol, 1, 373-385.
4. Arıtürk E (1983): Genel Zootekni. A. Ü. Veteriner Fakültesi Yayınları: 395, Ankara.
5. Atasoy F (2010): Köpek - Kedi Yetiştiriciliği Ders Notları, Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi, Zootekni Anabilim Dalı, Ankara.
6. Atasoy F, Kanlı O (2005): Türk Çoban Köpeği Kangal, 2. Baskı, Medisan Yayıncılık, No: 60, Ankara.
7. Atasoy F, Uğurlu M, Özarslan B, Yakan A (2011): Halk
elinde yetiştirilen Akbaş köpeklerinde canlı ağırlık ve vücut ölçüleri, Ankara Üniv Vet Fak Derg, 58, 213-215.
8. Atasoy F, Erdoğan M, Yüceer B, Özarslan B, Kocakaya A (2011): Türk Mastifi morfolojik ve genetik özelliklerinin
belirlenmesi ve bu köpeğin tanıtılması, Broşür 1. Baskı,
Medisan Yayınevi Ltd Şti., Ankara.
9. Belkhir K, Borsa P, Chikhi L, Goudet J, Bonhomme F (1996): GENETIX 4.00 WindowsTM Software for Population
Genetics, Laboratoire Genome, Populations, Intereactions,
University of Montpellier, France.
10. Daşkıran İ (2007): Body weight and some morphological
characteristics of Kangal dogs, J Anim Vet Adv, 6,
368-370.
11. Erdogan M, Ozbeyaz C (2004): Investigation of blood
protein polymorphism and estimation of genetic distances in some dog breeds in Turkey, Turk J Vet Anim Sci, 28,
583-590.
12. Erdoğan M, Tepeli C, Özbeyaz C, Dosay-Akbulut M, Uğuz C (2012): Comparison of some morphological
characteristics of native Turkish dog breeds. Eurasian J
Vet Sci, 28, 106-110.
13. Erdoğan M, Tepeli C, Brenig B, Dosay-Akbulut M, Uğuz C, Savolainen P, Özbeyaz C (2013): Genetic
variability among native dog breeds in Turkey. Turk J
Biol, 37, 176-183.
14. FCI (1989): Anatolian Shepherd Dog, In: Federation Cynologique Internationale, Belgium.
15. Hartl DL, Clark AG (1989): Principles of Population
Genetics, Second Edition, Sinaur Associates, Inc.
Publishers, Sunderland, Massachsetts.
16. Ichikawa Y, Takagi K, Tsumagari S, Ishihama K, Morita M, Kanemaki M, Takeishi M, Takahashi H (2001): Canine parentage testing based on microsatellite
polymorphisms, J Vet Med Sci, 63, 1209-1213.
17. Irion DN, Schaffer AL, Famula TR, Eggleston ML, Hughes SS, Pedersen NC (2003): Analysis of genetic
variation in 28 dog breed populations with 100 microsatellite markers, J Hered, 94, 81-87.
18. Irion DN, Schaffer AL, Grant S, Wilton AN, Pedersen NC (2005): Genetic variation analysis of the Bali street
dog using microsatellites, BMC Genetics, 6, 1-13.
19. Jordana J, Piedrafita J, Sanchez A (1991): Variabiliad Y
relaciones geneticas de cinco poblaciones de la raza canina " Gos d’Atura ", Prod Sanid Anim, 6, 211-223.
20. Jouquand S, Priat C, Hitte C, Lachaume P, Andre C, Galibert F (2000): Identification and characterization of a
set of 100 tri- and dinucleotide microsatellites in the canine genome, Anim Genet, 31, 266-272.
21. Kırmızıbayrak T (2004): Some morphological
characteristics of Kars dogs, Turk J Vet Anim Sci, 28,
351-353.
22. Kim KS, Tanabe Y, Park CK, Ha JH (2001): Genetic
variability in East Asian dogs using microsatellite loci analysis, J Hered, 92, 398-403.
23. Kobayashi R, Miyakawa H, Tanabe Y, Hashimoto Y, Ôta K, Fraque MO (1987): Blood protein polymorphism
in Bangladesh native dogs, Report of the Society for
Research on Native Livestock, 12, 269-289.
24. Koskinen MT, Bredbacka P (2000): Assessment of the
population structure of five Finnish dog breeds with microsatellites, Anim Genet, 31, 310-317.
25. Lachmann C (1993): Verteilung Genetisher Polymorphismen
bei Einigen Deutschen Hunderassen, Tierarztl, Hochsch.,
Diss., Hannover.
26. Lüpke L, Distl O (2005): Microsatellite marker analysis
of the genetic variability in Hanoverian hounds, J Anim
Breed Genet, 122, 131-139.
27. Miller MP (1998): TFPGA (Tools for Population Genetic
Analysis) Version 1.3., Department of Biological Sciences,
Northern Arizona University.
28. Nei M (1972): Genetic distance between populations, Am Nat, 106, 283-292.
29. Nei M (1987): Molecular Evolutionary Genetics, Columbia University Press, New York.
30. Nei M, Kumar S (2000): Molecular Evolution and
Phylogenetics, Oxford University Press, New York.
31. Onar V, Özcan S, Pazvant G (2001): Skull typology of
adult male Kangal dogs, Anat Histol Embryol, 30, 41-48.
32. Özbeyaz C (1994): Kangal köpeklerinde bazı morfolojik
özellikler, Lalahan Hay Araşt Enst Derg, 34, 38-46.
33. Reynolds J, Weir BS, Cockerham CC (1983):
Estimation of the coancestry coefficient: basis for a short-term genetic distance, Genetics, 105, 767-769.
34. Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T (1989): Molecular
Cloning:Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Press.
Cold Spring Harbor, NY, USA.
35. Sneath PHA, Sokal RR (1973): Taxonomy Structure, In
Numerical Taxonomy, The Principle and Practice of Numerical Classification, (ed. Kenedy, D. and Park, R.B.),
W.H. Freeman, San Francisco, 134-230.
36. Spira RH (1991): Canine Terminology, Howell Book House Inc., Newyork, USA.
37. Tajima F (1989): Statistical methods to test for nucleotide
mutation hypothesis by DNA polymorphism, Genetics, 123,
585-595.
38. Tamura K, Dudley J, Nei M, Kumar S (2007): MEGA4:
Molecular evolutionary genetics analysis software version 4.0, Mol Biol Evol, 24, 1596-1599.
39. Tanabe Y, Ota K, Ito S, Hashimoto Y, Sung YY, Ryu JK, Fraque MO (1991): Biochemical-genetic relationships
among Asian and European dogs and the ancestry of the Japanese native dogs, J Anim Breed Genet, 108, 455-478.
Fatih Atasoy - Metin Erdoğan - Bora Özarslan - Banu Yüceer - Afşin Kocakaya - Halil Akçapınar 132
40. Tepeli C, Çetin O (2000): Kangal ırkı Türk çoban
köpeklerinde büyüme bazı vücut ölçüleri ve döl verimi özelliklerinin belirlenmesi, I. Büyüme ve bazı vücut ölçüleri,
Veteriner Bilimler Dergisi, 16, 5-16.
41. Tepeli C, Çetin O (2003): A study on head measurements
of Kangal and Akbas Turkish shepherd dogs, J Vet Sci, 19,
17-20.
42. Tepeli C, Çetin O, İnal Ş, Kırıkçı K, Yılmaz A (2003):
Kangal ve Akbaş ırkı Türk çoban köpeklerinde büyüme özellikleri, Turk J Vet Anim Sci, 27, 1011-1018.
43. Weir BS, Cockerham CC (1984): Estimating F-statistics
for the analysis of population, Evolution, 38, 1358-1370.
44. Wright S (1965): The interpretation of population
structure by F-statistics with special regard to systems of mating, Evolution, 19, 395-420.
45. Wright S (1978): The Theory of Gene Frequencies,
Evolution and The Genetics of Populations, University Of
Chicago Press, Vol. 4.
Geliş tarihi: 28.06.2013 / Kabul tarihi: 10.12.2013
Yazışma adresi:
Yrd. Doç. Dr. Banu Yüceer
Ankara Üniversitesi, Veteriner Fakültesi Zootekni Anabilim Dalı, 06110
Dışkapı/Ankara
