KONGRE BAŞKANI
Prof. Dr. Sebahattin ÖZCAN
Ankara Üniversitesi
DÜZENLEME KURULU
Prof. Dr. Mehmet KARATAŞ
Düzenleme Kurulu Başkanı
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi
Prof. Dr. Dilek TURGUT BALIK
Düzenleme Kurulu Başkan Yardımcısı
Yıldız Teknik Üniversitesi
Doç. Dr. Ekrem DÜNDAR
Düzenleme Kurulu Başkan Yardımcısı
Balıkesir Üniversitesi
SEKRETERYA
Arş. Gör. Muhammet DOĞAN
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi
Arş. Gör. Buğrahan EMSEN
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi
BİLİM KURULU
Prof. Dr. Leyla AÇIK
Gazi Üniversitesi
Prof. Dr. Burhan ARIKAN
Çukurova Üniversitesi
Prof. Dr. Dilek TURGUT BALIK
Yıldız Teknik Üniversitesi
Prof. Dr. Fevzi BARDAKÇI
Adnan Menderes Üniversitesi
Prof. Dr. Rıza BASHIROV
Doğu Akdeniz Üniversitesi
Prof. Dr. Hikmet BUDAK
Sabancı Üniversitesi
Prof. Dr. Kemal BÜYÜKGÜZEL
Bülent Ecevit Üniversitesi
Prof. Dr. Özer ÇINAR
Uluslararası Saraybosna Üniversitesi
Prof. Dr. Zeynep PETEK ÇAKAR
İstanbul Teknik Üniversitesi
Prof. Dr. Naci DEĞERLİ
Cumhuriyet Üniversitesi
Prof. Dr. Zihni DEMİRBAĞ
Karadeniz Teknik Üniversitesi
Prof. Dr. Yusuf TURAN
Balıkesir Üniversitesi
Prof. Dr. İsa GÖKÇE
Gaziosmanpaşa Üniversitesi
Prof. Dr. Kemal GÜVEN
Dicle Üniversitesi
Prof. Dr. İbrahim IŞILDAK
Yıldız Teknik Üniversitesi
Prof. Dr. Nejdet KANDEMİR
Gaziosmanpaşa Üniversitesi
Prof. Dr. Sabire KARAÇALI
Ege Üniversitesi
Prof. Dr. Zeki KAYA
Orta Doğu Teknik Üniversitesi
Prof. Dr. Muhsin KONUK
Afyon Kocatepe Üniversitesi
Prof. Dr. Feray KÖÇKAR
Balıkesir Üniversitesi
Prof. Dr. Sebahattin ÖZCAN
Ankara Üniversitesi
Prof. Dr. Hasan ÖZDEMİR
Atatürk Üniversitesi
Prof. Dr. Şaban TEKİN
Gaziosmanpaşa Üniversitesi
Prof. Dr. Sezai TÜRKEL
Uludağ Üniversitesi
Prof. Dr. Ahmet YILDIRIM
Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi
Doç. Dr. Mikail AKBULUT
Erciyes Üniversitesi
Doç. Dr. Yüksel BÖLEK
Sütçü İmam Üniversitesi
Doç. Dr. Ekrem DÜNDAR
Balıkesir Üniversitesi
Doç. Dr. Ayşe FİLİZ GÜREL
İstanbul Üniversitesi
Doç. Dr. Atilla KARŞI
Mississippi State University
Doç. Dr. Ahmet KOÇ
İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
Doç. Dr. İskender PARMAKSIZ
Gaziosmanpaşa Üniversitesi
SÖZLÜ BİLDİRİ
ÖZETLERİ
57
Glioblastoma Multiforme Beyin Tümörleri İçin İlaç İletiminde Kullanılabilecek
Aptamerlerin Geliştirilmesi
Abdullah Tahir Bayraç*,1,2,3, Hüseyin Avni Öktem2
,Weihong Tan3
1Biyomühendislik Bölümü, Mühendislik Fakültesi, Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi, 70100, Karaman,
Türkiye
2Biyoteknoloji Bölümü, Nanobiyoteknoloji Ar&Ge Grubu, Orta Doğu Teknik Üniversitesi, 06531,
Ankara,Türkiye
3
Shands Cancer Center, University of Florida, Gainesville, Florida 32611-7200, United States
*tahirbayrac@gmail.com
Özet
Bu çalışmada glioblastoma multiforme’yi özel olarak tanıyan aptamer probları negatif seçilim yapılmadan tekrarlı hücre SELEX’i temelli bir prosedürün kullanılmasıyla oluşturulmuştur. Seçilim sonrasında 454 sekanslama teknolojisi SELEX yöntemini izlemek için, biyoenformatik araçlar ise yüksek kapasiteli verilerden yararlanılarak aptamerleri tanımlamak için kullanılmıştır. Özellikle hedef hücreye bağlanabilen ve nanomolar düzeyinde ayrılma sabitine (Kd) sahip bir grup aptamer üretilmiştir. Seçilen aptamerler glioblastoma hücre hattına ait farklı türlere yüksek bağlanma eğilimi gösterirken, diğer kanser hücre hatlarına az ya da hiç bir bağlanma göstermemektedir. Bu çalışmada üretilen aptamerler glioblastoma hücreleri için moleküler işaretleyici keşfi için araç olmanın yanı sıra teşhis için kullanılan prob ve hedeflenmiş ilaç dağıtımı gibi farklı uygulama alanlarında kullanılma potensiyeline sahiptirler.
Anahtar Kelimeler: DNA Aptamer, Cell-SELEX, Glioblastoma, Kanser, İlaç İletimi
Development of Aptamers for Targeted Drug Delivery to Glioblastoma Multiforme
Brain Tumors
Abstract
In this study aptamer probes for specific recognition of glioblastoma multiforme were generated using a repetitive and broad cell-SELEX-based procedure without negative selection. The 454 sequencing technology was used to monitor SELEX, and bioinformatics tools were used extensively to identify aptamers from high throughput data. A group of aptamers were generated that can bind to target cells specifically with dissociation constants (Kd) in the nanomolar range. Selected aptamers showed high affinity to different types of glioblastoma cell lines, while showing little or no affinity to other cancer cell lines. The aptamers generated in this study is used as tools in some applications. First of all they were used as recognition elements for their specific target in microscopy. They displayed a distinct binding on their target with observable microscopy images. Also preliminary experiments are carried out with a selected aptamer to be used as drug delivery vehicle.
