KATALOG 5.1. Ana Kubbe
5.1.1. Ana Kubbe Desen Analizi
Diversos estudos genético-populacionais têm sido conduzidos na tentativa de identificar estruturação populacional em peixes neotropicais. Entretanto, estes estudos ainda são relativamente escassos. Em uma revisão recente, Oliveira et al. (2009) verificou que estudos citogenéticos e populacionais foram realizados em apenas 1040 espécies de peixes de água doce e 109 espécies de peixes marinhos. Destes, os estudos populacionais são minoria, sendo que apenas duas ordens têm sido mais estudadas, Characiformes e Siluriformes.
Introdução
12
Apesar disso, é sabido que análises moleculares apresentam especial relevância para abordagem conservacionista, uma vez que permitem avaliar a estrutura e dinâmica de uma população. A utilização de diversas classes de marcadores moleculares, como RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), DNA mitocondrial, minissatélites ou VNTR (Variable Number of Tandem Repeats) e microssatélites ou SSR (Simple Sequence Repeats), baseadas em PCR (Polymerase Chain Reaction), está possibilitando a caracterização da estrutura genética de diversas populações, incluindo a identificação de indivíduos migrantes e análises de diversidade genética intra- e inter- populacional (Haig, 1998; Wasko e Galetti, 2003; Matoso et al., 2004; Hatanaka et al., 2006; Oliveira et al., 2009).
A técnica de RAPD baseia-se na utilização de apenas um primer com uma seqüência arbitrária em reações de PCR e, portanto, com seqüência alvo desconhecida. Primers únicos de seqüências cernes universais de VNTRs também podem ser utilizados para amplificar regiões arbitrárias do genoma de diversas espécies, incluindo peixes (Wasko e Galetti, 2002) e camarões (Freitas e Galetti, 2002). Existem ainda outros métodos moleculares, como RFLP (Restriction Fragment Polymorphism) e AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism), que podem ser utilizados para inferir sobre a estrutura genética das populações. A técnica de RFLP baseia-se no uso de enzimas de restrição e hibridação destes fragmentos com seqüências homólogas de DNA marcadas com radioatividade ou compostos luminescentes para detectar polimorfismos nos sítios de restrição (Imsland et al., 2004; Okimoto et al., 2008). A AFLP utiliza um misto de digestão de enzimas de restrição e posterior PCR, com análise dos
Introdução
13
fragmentos em géis de alta resolução (Ferreira e Grattapaglia, 1995; Mickett et al., 2003; Maldinia et al., 2006; Liu et al., 2006).
Independente do método empregado, análises moleculares realizadas estão permitindo investigar a estrutura genética de diversas espécies de peixes em diferentes bacias hidrográficas do Brasil. No caso específico dos peixes migradores, estes estudos têm apontado para a presença de populações panmíticas (Revaldaves et al., 1997; Carvalho-Costa, 2008; Calcagnotto e DeSalle, 2009, Iervolino et al., 2010) e também de metapopulações, ou seja, populações geneticamente diferenciadas que mantém fluxo gênico entre si (Hatanaka et al., 2006, Morelli et al., 2007b). A caracterização de populações geneticamente diferenciadas pode ser eficiente para determinar as unidades que deverão ser prioritariamente estabelecidas para conservação do potencial evolutivo de uma espécie (Laikre et al., 2005; Frankham et al., 2008).
Para Laikre et al. (2005) existem três tipos de estruturação populacional em peixes: (1) populações distintas (com baixo fluxo gênico e manutenção de isolados populacionais), (2) populações contínuas (com fluxo gênico moderado e padrão de isolamento por distância) e (3) sem diferenciação (homogeneidade genética entre todas as áreas de distribuição geográfica estudadas). Deste modo, para o estabelecimento de estratégias de manejo deve-se considerar cada um destes casos, pois o manejo incorreto pode levar à perda de alelos raros e conseqüentemente à diminuição na variação genética da espécie, uma vez que cada população contribui com uma parcela da variação total (Laikre et al., 2005).
Em Brycon lundii, a existência de estruturação em populações foi evidenciada através de análises de RAPD e VNTR, na qual ficou demonstrado que diferentes populações coexistem e migram ao longo do canal do rio São
Introdução
14
Francisco (Wasko e Galetti, 2002; Wasko e Galetti, 2003). Matoso et al. (2004), também usando a técnica RAPD, demonstraram a presença de estruturação genética em três populações de Astyanax sp. No gênero Brycon, Sanches e Galetti (2007) utilizando marcadores RAPD identificaram a presença de estruturação populacional em quatro diferentes populações de B. hilarii da sub- bacia do rio Miranda (Bacia do rio Paraguai), durante a piracema e outras épocas do ano. Eles apontaram que a estruturação genética entre as diferentes populações foi maior durante a época não reprodutiva do que durante a época reprodutiva.
Outra classe de marcadores importantes que vem sendo utilizada nestes estudos é a dos microssatélites ou SSR ou ainda STR (Short Tandem Repeats). Estes têm sido considerados a classe de marcadores moleculares mais polimórficos e com o maior conteúdo de informações. Eles consistem em pequenos trechos de DNA (seqüência motif) com 1 a 6 nucleotídeos, repetidos em tandem (lado a lado). Em genomas de eucariotos estas seqüências são freqüentes e distribuídas ao acaso, formando locos extremamente polimórficos (Ferreira e Grattapaglia, 1995; Ellegren, 2004).
Os microssatélites possuem caráter co-dominante e são encontrados em praticamente todos os organismos (Chambers e MacAvoy, 2000). Podem estar em regiões não expressas e expressas, incluindo éxons e íntrons. Em regiões gênicas, eles podem inativar ou ativar genes, afetando a expressão gênica, o processamento de mRNA e/ou sua exportação para o citoplasma (Li et al., 2004).
Estes marcadores vêm sendo amplamente utilizados em estudos de estrutura genética de populações naturais (Sanches e Galetti, 2007; Hatanaka et al., 2006), além de relações de parentesco (Jerry et al., 2004) e desenvolvimento
Introdução
15
de mapas de ligação (Zhang et al., 2007) em espécies economicamente importantes. Acredita-se que a variação nos locos microssatélites seja gerada por erros durante a recombinação e duplicação, como crossing-over desigual ou deslizamento da DNA polimerase durante a replicação do DNA, processo conhecido como slippage (Oliveira et al., 2006).
Em Prochilodus argenteus, estudos utilizando marcadores microssatélites demonstraram que há significativa diferenciação genética entre três populações coletadas na barragem da hidrelétrica de Três Marias-MG, no rio São Francisco, e que estratégias de manejo diferenciadas devem ser adotadas para preservar a integridade genética destas populações (Hatanaka e Galetti, 2003; Hatanaka et al., 2006). Carvalho-Costa et al. (2008), no entanto, também utilizando microssatélites, não encontraram diferenças significativas entre três populações de Prochilodus costatus na mesma região de Três Marias.
Na espécie S. brasiliensis pouco estudos genético-populacionais têm sido conduzidos e os existentes são baseados em marcadores moleculares como RAPD (Lopes et al., 2007; Ramella et al., 2006) e DNAmt (Machado et al.,2005; Freitas, 2010), inexistindo até o momento, estudos com marcadores microssatélites.