Endüstri
Taşlanmış jean’ların üretiminde GM organizmaların kullanımı
Enzim ve deterjan gibi ajanların üretiminde GM organizmaların kullanımı
Asit, alkol, boya, pigment, koku-tat bileşikleri ve diğer gıda katkı maddelerinin üretiminde GM
organizmaların kullanımı
Kozmetik ürünlerinin üretiminde GM organizmaların kullanımı
Petrol ürünlerinin arıtılmasında GM organizmaların
kullanımı
Çevre Koruma
Atıkların ileri düzeyde parçalanmasında ve yeniden kullanımında GM organizmalardan yararlanma (çevreci mikroorganizmalar)
Madencilikte GM organizmaların kullanımı
Çevreci enerji üretiminde GM organizmaların
kullanımı
DNA ve RNA İzolasyonu
Hücreve hücre çekirdeğinin lize edimesi (lizozim, mutanolisin, proteinaz K, SDS)
DNA nın ekstraksiyonu(ayrılması): DNA sulu fazda kalırken, diğer atıklar organik fazda kalır
(fenol-pH 7.6 nın üzerinde dengelenmelidir-, fenol/kloroform, kloroform/izoamil alkol)
Alkol ile çöktürme: (etanol, izopropanol)
Tuz ile çöktürme: (sodyum ya da potasyum tuzları)
DNA Saflık Ölçümleri: Spektrofotometrik (260 nm)
Etidyum bromit bağlanması
Toplam RNA (Ultrasantrifüj) ve mRNA (polT kolon)
Restriksiyon endonukleazlar
DNA üzerindeki kısa özel serileri tanırlar ve tanıma bölgesi yakınından keserler
Tanıma serileri : genellikle 4 veya 6 baz çiftidir.
Ancak bazen 5, 8 baz çifti yada daha uzun olabilir
Tanıma serileri palindrom özelliktedir
Palindrom: Bir zincirdeki DNA dizisinin
tamamlayıcı zincirdeki DNA dizisi ile, ters yönde aynı olmasıdır
Farklı kaynaklardan izole edilen ve aynı seriyi tanıyarak aynı bölgelerden kesen enzimler
izoşizomerdir. Bu enzimler eğer aynı tanıma
serisini farklı bölgelerden kesiyor ise yalancı
izoşizomerdir.
Restriksiyon endonukleazlar
Palindrom örneği:GAATTC CTTAAG
Bakterilerden izole edilen Restriksiyon Endonuklez enzimleri:
• Bakterinin adından türetilir
• Cins: İlk harfi oluşturur (büyük harfle yazılır)
• Tür- İkinci ve üçüncü harfleri oluşturur (küçük harfle yazılır)
• Diğer harfler suşlardan türetilir
• Romen rakamları aynı bakteriden izole edilen farklı enzimlerin sıra ve sayısını bildirmek için kullanılır
• Örnek: EcoKI
• E Escherichia
• Co coli
• K K suşu
• I E. coli K suşunda tanımlanan ilk enzim