VRE Taramasında Moleküler Testlerin
Maliyet-Etkin Kullanımı:
Erciyes Üniversitesi Deneyimi
Dr. Duygu PERÇİN
Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi
Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Kayseri
VRE
Salgınlara yol açabilen önemli hastane enfeksiyonu etkenlerinden
1980’li yıllarda ilk izole edildikten sonra birçok ülkede hastane kökenli enfeksiyonların önemli nedeni
1990’lı yıllarda VRE prevelansı <%1 iken 1997’de %15’e 2000’li yıllarda ise %28’e yükselmiştir
Cansız yüzeylerde 1 haftadan fazla canlı kalması bulaş riskini artırıyor
NNIS (2003) Am J Infect Control 31, 481-498
Glikopeptid direnç tipleri
Cattoir V, Leclerq R. J Antimicrob Chemother, 2013
Epidemiyoloji
(1) Gaziantep Çocuk Hastanesi Onkoloji
İndeks vaka tespiti sonrası nokta prevalans çalışması
VRE kolonizasyonu : % 14.6 (18/123)
Enfeksiyon kontrol önlemleri ve eğitim sonrası nokta prevalans çalışması
3 gün ve daha fazla süredir yatan hastalarda
VRE kolonizasyonu : % 3.3 (8/242)
Yiş R, et al. Mikrobiyol Bul 2011; 45: 646-54.
Epidemiyoloji
(2)
Erzurum, Atatürk Üniversitesi 2008-10
Yanık hastalarında kolonizasyon
Rektal, göbek, boğaz ve axilla sürüntüleri
Yatışta: 0
7 ve 14. gün: %0.8
28.gün: %7
En sık izolasyon rektal örneklerden
VRE’ye bağlı yanık enfeksiyonlarında kolonizasyon ile yakın korelasyon
Altoparlak U, et al. Burns 2011; 37: 49-53
VRE kolonizasyonu
İmmün yetmezlik
Ağır alt hastalık
Böbrek yetmezliği
Lösemi
YBÜ’de yatış
Geniş spektrumlu antibiyotik kullanımı
Meropenem
Siprofloksasin
Uzun süre hastanede yatış (> 7gün)
Diyare
VRE izolasyonu
Rektal sürüntü
Dışkı
Kasıklar
Kolun üst kısımları
Orofarengeal aspirat
Mide aspiratı
Endotrakeal aspirat
VRE kolonizasyonu
Hastaneden çıkıştan sonra ortalama 6 hafta kolonizasyon devam etmekte
VRE’nin tamamen negatifleşmesi ortalama 9 hafta sürmekte
VRE kolonizasyonunu uzatan sebepler
Cerrahi
Antibiyotik kullanımı
Diyaliz
Sohn KM et al. Int J Infect Dis, 2012
Taramanın önemi
Dirençli bakteriler hastanelerde morbidite ve mortalite oranı artırıyor
Nozokomiyal salgınlar
Hastaneye yatışta veya üniteler arası nakillerde gastrointestinal sistem
kolonizasyonunun hızlı ve doğru olarak
saptanması önemli
Management of Multidrug-Resistant Organisms In Healthcare Settings, 2006
V.A.4.a. In microbiology laboratories, use standardized laboratory methods and follow published guidance for determining antimicrobial susceptibility of targeted and emerging MDROs. Category IB
V.B.1.b. Continue to monitor the incidence of target MDRO infection and colonization after additional interventions are implemented. If rates do not decrease, implement more interventions as needed to reduce MDRO transmission.
Category IB
V.B.5.b.i. Obtain ASC from areas of skin breakdown and draining wounds. In addition, include the following sites according to target MDROs:
For VRE: Stool, rectal, or perirectal samples should be collected. Category IB
Tarama yöntemleri
Kültürle VRE tespit edilmesi 3-5 gün gerekli
Kromojenik agarlar ile 48-72 saat
Kültür sonucu çıkana kadar izolasyon
prosedürlerinin uygulanması yoğun bir iş yükü, zaman kaybı ve maliyet gerektirmekte
İzolasyon önlemleri için kültür sonucunun beklenmesi durumunda, diğer hastalara ve çevreye bulaş
PCR ile hızlı tanı? Maliyet???
Erciyes Üniversitesi
rutin tarama : 2008-2009
İlk olarak Kasım 2008’de ve sadece erişkin YBÜ’nde başlandı
Riskli ünite taraması
yoğun bakım üniteleri
hematoloji-onkoloji üniteleri
Pediatri servislerinde klinik VRE
izolatlarının görülmesi sonrası tarama
kültürleri pediati yenidoğan ve YBÜ’ne de
genişletildi
Erciyes Üniversitesi
rutin tarama : 2008-2009
Ayda bir kez perirektal sürüntü örneği
Bir ünitede VRE kolonizasyon/enfeksiyonu tespit edildiğinde, haftalık tarama kültürü
Kolonize hastanın 3 kez perirektal
kültüründe üreme olmaması durumunda izolasyon önlemlerinin kaldırılması
Ünitede yatan hastaların tamamında 4 hafta ardı ardına üreme olmaması
durumunda aylık tarama kültürlerine dönüş
Vankomisine Dirençli Enterokokların Moleküler Epidemiyolojisi
89 VRE suşu (klinik örnek ve rektal sürüntü)
Diversilab rep-PCR
7’si ana klon olmak üzere 12 farklı klon tespit edilmiştir.
A klonunda 3 (A1, A2, A3),
B klonunda 2 (B1, B2),
C klonunda 3 (C1, C2, C3)
E klonunda 2 (E1, E2) alt klon belirlenmiştir.
Erçal BD, Perçin D. Erciyes Üni.Tıbbi Mikrobiyoloji Tez 2011
Rektal sürüntü
(%)
Kan (%)
İdrar (%)
Yara (%)
Dren (%)
Periton (%)
İntra abdominal
mayi (%)
Toplam
Pediatri servisleri 34 (56.7) 6 (46.2)
3 (37.5)
1
(33.3) 44
Cerrahi YBÜ 16 (26.7) 3 (23) 1
(12.5) 20
Dahiliye servisleri 7 (11.6) 1 (7.7) 2 (25) 1 (100) 11
Cerrahi servisler 1 (7.7) 2
(66.7)
3
(100) 1 (100) 7
Dahiliye YBÜ 3 (5) 2
(15.4) 2 (25) 7
Toplam 60 13 8 3 3 1 1 89
B1
B2
B klonuna ait dendrogram ve jel benzeri görüntü.
C1
C2
C3
C klonuna ait dendrogram ve jel benzeri görüntü.
G klonuna ait dendrogram ve jel benzeri görüntü.
Moleküler yöntem seçim kriterleri
Hızlı
Güvenilir
Klinik örnekten direkt çalışmaya uygun
Merkez laboratuvarında rutin kullanıma uygun
Moleküler testler için uzmanlık gerektirmeyen
Ön hazırlık gerektirmeyen
7 gün 24 saat çalışılabilir
Net sonuç
Cepheid Mart 2009
PCR endikasyonları
Kemoterapi
Dış merkezden kabul
Antibiyotik kullanımı
Batın ameliyat öyküsü
Ağır alt hastalık
İmmünsüpresyon
Uzun süre hastanede yatış öyküsü
Kronik böbrek yetmezliği
İlk VRE salgını
(1) 18-24 Mayıs 2010 tarihlerinde yenidoğan YBÜ’de yatan 12 hastanın rektal sürüntü örneklerinde VRE izole edildi.
Suşlar API Rapid 32 Strep kiti (Bio Merieux, Fransa) kullanılarak tanımlandı. Suşların vankomisin ve
teikoplanine duyarlılığı E-test (AB-Biodisk, Solna, İsveç) yöntemiyle değerlendirildi.
Genetik yakınlıklarının incelenmesi repetitif-PCR (rep- PCR) (DiversiLab, Biomerieux, Fransa) yöntemiyle yapıldı.
Vankomisin direnç genlerinin belirlenmesinde Seeplex VRE ACE Detection multiplex PCR kiti (Seegene, Kore) kullanıldı.
Erçal BD, Durmaz S, Alp E, Perçin D.
34.TMC Kongresi, 2010
360bp vanA
Tüm izolatlar vankomisin ve teikoplanine yüksek düzey dirençli vanA pozitif Enterococcus faecium
Erçal BD, Durmaz S, Alp E, Perçin D. 34.TMC Kongresi, 2010
9 suş A klonuna (%75), 3 suş B klonuna (%25) ait idi
Erçal BD, Durmaz S, Alp E, Perçin D. 34.TMC Kongresi, 2010
İlk VRE salgını
(2)
A klonuna ait ilk suş
Diyarbakır’daki bir hastaneden 20 gün önce transfer edilen bir hastaya ait
Bu klon daha önce hastanemizde görülmemiş bir klon
Yenidoğan YBÜ’ne bu hastadan yayılım
B klonunun 2 ay önce farklı bir servisten izole edilen VRE suşuyla aynı
Erçal BD, Durmaz S, Alp E, Perçin D. 34.TMC Kongresi, 2010
2. VRE salgını
2011
M.T bebek Maraş DH’nden ROB muayenesi için yollanmış
Kalp problemi nedeniyle yatış
PCR endikasyonu olduğu halde örnek yollanmamış, istek yapılmamış
Bir hafta sonra 15 bebek VRE pozitif
3. VRE salgını
Eylül 2012
Dış merkezden sevk ile gelen F.H.
Medikal onkoloji servisine yatırılmış
Endikasyon olmasına rağmen örnek gönderilmemiş, PCR isteği yapımamış
Bir hafta sonraki rutin taramada aynı
servisten 20 hasta VRE pozitif
PCR ile taramada güncelleme
Eğitim tekrarı
EKK kararı ve başhekimlik onayı ile yaptırımlar
EKK sıkı denetimi
Acilden yatışların denetimi
Erciyes Üniversitesi tarama sonuçları
Yıl 2009 2010 2011 2012
Rektal sürüntü kültürü (+) 5436 (167) 3909 (29) 8929 (192) 12422 (240)
PCR (+) 112 (29) 231 (31) 1052 (102) 1531 (191)
Kolonizasyon %3.1 %0.7 %2.1 %1.9
Enfeksiyon %0.2 %0.1 %0.1 %0.2
Kolonizasyon-enfeksiyon
oranı %7.1 %13.7 %4.6 %11.3
VRE saptanmasında genexpert
vanA/vanB real time-PCR yöntemi ile kültür yönteminin karşılaştırılması
2009-2011 yılları arasında
Toplam 1574 rektal sürüntü örneği
Cepheid Genexpert vanA/vanB real time PCR
Eş zamanlı kromojenik agara ekim
Durmaz S, Erçal BD, Atalay A, Perçin D. 35. TMC Kongresi, 2012
1574 rektal sürüntü örneği
KÜLTÜR
POZİTİF NEGATİF
REAL TİME PCR
POZİTİF
134 (133 vanA, 1 vanB)
118 51 (35*)
NEGATİF 1405
0 1405
Durmaz S, Erçal BD, Atalay A, Perçin D. 35. TMC Kongresi, 2012
Bulgular
PCR pozitif, kültür negatif hastaların 25’inde vanB pozitifliği saptandı.
Kültür negatif, VanA pozitif olan 16 hastada ise haftalık rutin taramalarda PCR çalışmasından iki hafta içindeki rektal sürüntü kültürlerinin
pozitifleştiği görüldü.
PCR ile vanA pozitif kültür negatif olan dokuz hastadan dördü exitus olmalarından dolayı haftalık rutin tarama yapılamadı.
Dört hastanın ise klinik örneklerinde VRE
saptanmasından dolayı tedavi aldığı belirlendi.
Durmaz S, Erçal BD, Atalay A, Perçin D. 35. TMC Kongresi, 2012
DUYARLILIK (%)
ÖZGÜLLÜK (%)
PPD (%)*
NPD (%)**
RT-PCR* 100 97 86.8 100
GeneXpert vanA/vanB Real Time PCR
Durmaz S, Erçal BD, Atalay A, Perçin D. 35. TMC Kongresi, 2012
Sonuçlar
GeneXpert vanA/vanB RT-PCR yöntemi VRE kolonizasyonunun erken belirlenmesinde
kullanılabilecek hızlı ve duyarlı bir yöntemdir.
Kültürde pozitif örneklerin hepsini tespit etmesi ve kültürü negatif olan 16 hastanın kültürlerinin
sonraki haftalık taramalarda pozitifleşmesi dikkat çekicidir.
vanB açısından kültür ile PCR arasındaki
uyumsuzluk dışkı florasındaki anaerop bakterilerin direnç genleri ya da besiyerinde kullanılan 6-8
μg/ml vankomisin miktarı ile vanB taşıyan suşların inhibe olmasından kaynaklanıyor olabilir.
Durmaz S, Erçal BD, Atalay A, Perçin D. 35. TMC Kongresi, 2012
Sonuçlar
PCR ile vanA veya vanB pozitif bulunan ancak kültürle negatif bulunan durumlar
ölü bakterilerin DNA pozitifliğinin bir süre daha devam etmesi
PCR ile vanA saptanan ancak kültürde
izolasyon yapılamayan, kan kültüründe VRE üremesi sebebiyle linezolid tedavisi almakta olan iki hasta
Kültürle doğrulanamasa bile PCR ile pozitif bulunan hastaların izolasyonu enfeksiyon kontrolü açısından gereklidir.
Durmaz S, Erçal BD, Atalay A, Perçin D. 35. TMC Kongresi, 2012
Maliyet analizi (2012 yılı için)
12422 kültürde 240 VRE pozitif
Kromojenik agar – 3 TL
Pasajlar – 2 TL
Genel maliyet – 62.120 TL
Tanımlama ve duyarlılık – 20 TL
VRE maliyeti – 4800 TL
Toplam maliyet - 66.920 TL
12422 PCR yapılsaydı
Pozitiflik oranı - %1.9
Ortalama-80 TL
Toplam maliyet –
993.760 TL olacak idi
Negatif sonuç maliyeti – 974.560 TL
Endikasyon dahilinde PCR uygulaması ile
1531 PCR
191 pozitif sonuç
Pozitiflik oranı % 12.5
Testten 1 saat sonra hızla temas izolasyon önlemleri uygulaması
Toplam maliyet 122.480 TL
Negatif sonuç maliyeti – 107.200 TL
Puanlama sistemi
YBÜ’de yatış 1 puan
KOAH 2 puan
Antibiyotik kullanımı 3 puan
Vankomisin kullanımı 2 puan
>=3 puan için
Duyarlılık: %84.2
Özgüllük: %82.5
PPD: %15.2
NPD: %99.3
Yoon YK, et al. J Antimicrob Chemother 2012; 67: 2963-9
Sonuç olarak
VRE taraması hastanede yayılımın önlenmesi açısından önemli
VRE ile enfeksiyonda yatış süresinin uzaması, sevk ve maliyet artışı nedeni ile tarama ile erken izolasyon önlemlerinin uygulanması imkanı
moleküler yöntemleri maliyet etkin kılıyor
Moleküler yöntemler kültüre kıyasla pahalı olmakla birlikte,
endikasyonlar dahilinde kullanıldığında ve
rutin işleyişe uygun bir yöntem seçildiğinde
MALİYET ETKİN