MİKROBİYEL GENETİK
Mikroorganizmaların genetik özelliklerinin bilinmesi;
gen fonksiyonlarının araştırılmasında,
diğer organizmalardaki bazı özel genlerin mikoorganizmalarda çoğaltılmasında,
endüstriyel önemi olan bazı ürünlerin büyük miktarlarda üretilebilmesinde,
mikrobiyel hastalıkların tedavisinde ve
genlerin organizmalar arasında nasıl
aktarıldığının belirlenmesinde son derece önemlidir.
Bu çalışmalarda genetik yapısı değiştirilmiş mikroorganizmalar kullanılmaktadır.
MUTASYON
Bir organizmanın DNA yapısında meydana gelen ve kalıtsal olan her türlü baz sayı ve sıra değişimleri mutasyon olarak
adlandırılmaktadır.
Mutasyon sonucu atasal tipten (wild type) farklı bir DNA taşıyan canlı mutant,
mutasyona sebep olan etken ise mutajen olarak tanımlanmaktadır.
Mutant tipleri
Oksotrofik mutantlar: Minimal
besiyerinde gelişemezler. Biyosentez yollarındaki bazı enzimleri
kaybetmişlerdir.
Dirençli mutantlar:
Hareketsiz mutantlar:
Pigmentsiz mutantlar:
Kapsülsüz mutantlar:
Şekerleri kullanamayan mutantlar:
Virüslere dirençli mutantlar:
Mutasyon tipleri
Spontan mutasyonlar Kendiliğinden oluşan mutasyonlar
Nokta mutasyonu Bir baz çiftinde oluşan mutasyon
Transisyon purin purin, ya da primidin primidin
Transversiyon purin primidin, yada primidin purinin
Mutasyon tipleri
Atasal suşun ATG kodonunda bir nokta mutasyonu sonucu:
ATA kodonu oluşursa, tirozini kodonu sessiz (gizli, silent) mutasyon
ATC kodonu oluşursa, durdurucu kodon anlamsız (nonsense) mutasyon
TTG kodonu oluşursa, asparajin yanlış anlamlı (anlamı değiştiren, missense)
mutasyon
Mutasyon tipleri
Okuma kalıbı kayması ya da çerçeve kayması (Frame shift) mutasyonlar,
DNA’ dan bir baz çiftinin çıkması (mikrodelesyon)
yada DNA’ ya bir baz çiftinin girmesi (mikroinsersiyon)
Genom üzerinde DNA parçalarının
translokasyonla, DNA’ nın farklı bir bölgesine hareketi
inversiyonla kopan DNA parçasının ters dönerek tekrar aynı bölgeye yapıştığı
belirlenmiştir.
Geri mutasyonlar (Reversiyon): Nokta mutasyonları geri dönüşümlüdür.
RNA genomlarında oluşan mutasyonlar:
RNA’ dan oluşan genoma sahip virüslerde, DNA genomlarından daha fazla (yaklaşık 1000 katı kadar) mutasyon olmaktadır.
RNA virüslerindeki RNA polimeraz enzimini, DNA polimeraz gibi replikasyon hatalarını düzeltebilmektedir.
Ancak DNA genomlarında bulunan çok sayıda onarım sistemi RNA genomlarında bulunmaz. Bu nedenle de mutasyonlar DNA genomlarında daha yüksek oranda tamir
edilmektedir.
Mutajenler
1. Kimyasal mutajenler
Baz analogları Timine 5-Bromurasil
DNA ile reaksiyona giren kimyasallar Nitröz asit (HNO2) (deaminasyon)
Alkilleyici maddeler: Guaninin N 7 pozisyonundaki azotunu alkillerler.
Akridin ve etidium bromid gibi baz çiftleri arasına giren boyalar ise mikrodelesyon ve
mikroinsersiyonlara sebep olur.
2. Fiziksel mutajenler
Radyasyon: İyonize olmayan radyasyon ultraviole (UV) ışınları (260nm dalga boyu primidin
dimerleri)
Kozmik ışınlar, X ışınları ve gama ışınları gibi kısa dalga boylu ışınlar ise iyonize radyasyon
etkenleridir.
3. Biyolojik mutajenler
Transpozonlar, Bakteriyofaj Mu, Mutajenik etki gösteren DNA onarım sistemleri:
Mutajenler
Fiziksel mutajenler
Radyasyon: İyonize olmayan radyasyon ultraviole (UV) ışınları (260nm dalga boyu primidin dimerleri)
Kozmik ışınlar, X ışınları ve gama ışınları gibi kısa dalga boylu
ışınlar ise iyonize radyasyon etkenleridir.