Targeted
SNP-based Array?
MPS
cfDNA Nasıl Analiz Edilebilir?
Firma Yöntem Dizi Analizi Platformu
MPS MPS
Targeted sequencing
Array* Affymetrix
MPS MPS
Illumina NGS Teknolojisinde Dünyada İlk Sırada Yer Alır.
WGS (whole genom sequencing) yöntemi ile çalışır. WGS , genom boyunca hassas sayıma dayalı sonuçlar verir.
Avantajları
Düşük başarısızlık oranı (<%1)
Teste yeni içerik ekleyebilme olanağı Yüksek okuma sayısı (10–30M)
Dezavantajları
Maliyet
Verifi prenatal test hangi yöntemi kullanıyor?
Verifi Basic :
Trizomi 21, Trizomi 18, Trizomi 13,Cinsiyet kromozum anomalileri (opsiyoneldir)
Verifi Plus:
22 çift kromozum anomalileriCinsiyet kromozum anomalileri
Mikrodelesyon: 1
p36 delesyonu4p-(Wolf Hirschhorn sendromu) 5p- (Cri-du-chat Sendromu)
22q11 (DiGeorge Sendromu)
15q11 (Prader-Wille sendorumu/Angelman Sendromu)
Verifi hangi kromozom anomalilerini tarar?
Yaklaşık 2.500 test gönderimi yapıldı.
False negatif oranı: %0.02 False Pozitif oranı: %0.2
Taneja PA, SnyderHL,de FeoE,et al. Noninvasive prenatal testing in the general obstetric population:
clinical performans and counselling considerations in over 85.000 cases. Prenat Diagn. 2016;36(3):237-
Şimdiye kadar Türkiye’de kaç test yapıldı?
Yanlış negatiflik ve yanlış pozitiflik oranı nedir?
Geleneksel Doğum Öncesi Tarama Yöntemleri
Trizomi 21 için Tespit Oranları
ACOG Practice Bulletin No. 77, January 2007
Hasta izlemi yapılıyor mu? Nasıl?
Verifi Prenatal Test raporlarında ff bildirmektedir.
Fetal fraksiyon veriliyor mu?
Verifi nerede çalışılmaktadır?
Kalite kontrol sistemi nasıldır?
• illumina
ana laboratuvarı : Redwood City CLIA Lab.• Bir testin rapor edilebilmesi için geçmesi gereken çok sayıda laboratuvar içi kalite kontrol ölçümleri mevcuttur.
Kan alımından itibaren 7 ile 10 gün içerisinde
Verifi Prenatal Test’in Rapor verme süresi nedir?
Sonuç verememe oranı nedir?
• Test başarısızlığı binde 1 (%0.01)
Plazma izolasyonu
DNA izolasyonu
Kütüphane
hazırlama Dizi analizi Analiz Sonuç raporu
2-4 gündesonuç raporu elde edilir
Taneja et al.1 n = 86,658
Futch et al.2
n = 6,123 Raporlama süresi
Ortalama (iş günü) 3.3 5.1
İptaller, n (%)
Teknik 101 (0.1) 43 (0.7)
Yönetimsel 1,214 (1.4) 106 (1.7)
Lab’a özel 45 (0.05)
Toplam 1,376 (1.6) 149 (2.4)
Teknik nedenlerle iptal edilen 101 örneğin 52si için takip yapılmıştır.
Test başarısızlık nedenleri?
• Düşük cfDNA
• Belirli kalite kontrol ölçümleri (örneğin yetersiz dizileme)
Numune toplama sistemi ve transfer nasıldır?
• Anlaşmalı kan alma noktaları ve /veya mobil hemşireler
• Transfer : Fedex (express gönderim, yaklaşık 18 saat, hergün uçuş, takip no)
Verifi basic : 2.450 TL Verifi Plus : 2.950 TL
Verifi Prenatal Test fiyatı nedir?
Farklı fiyat uygulamaları var mı?
• Kurum ve hastane fiyatları ?
• Son hasta fiyatları ?
Örnek rapor (verifi basic, verifi plus)
Örnek rapor (detected)
•Verifi raporlarında PPV değeri vermektedir.