Mühendislik Fakültesi Genetik ve Biyomühendislik GBE 407 - Genomik ve Proteomik
DERS TANITIM BÝLGÝLERÝ
Dersin Adý Genomik ve Proteomik
Kodu Yarýyýl Teori
(saat/hafta)
Uygulama/Laboratuvar (saat/hafta)
Yerel Kredi
AKTS
GBE 407 Güz/Bahar 2 2 3 6
Ön Koþullar Yok
Dersin Dili İngilizce
Dersin Türü Seçmeli
Dersin Düzeyi Lisans
Dersin Veriliþ þekli -
Dersin Öðretim Yöntem ve Teknikleri -
Dersin Koordinatörü -
Dersi Veren(ler) * Dr. Öğr. Üyesi Osman Doluca
Dersin Yardýmcýlarý -
Dersin Amacý Bu dersin amacı protein biyokimyası, biyoinformatik, proteomik ve fonksiyonel genomikte kullanılan yöntemleri tanıtmaktır. Bu derste ökaryot organizmaların biyotik ve abiyotik stres karşısında tüm genom seviyesinde verdiği cevap analiz edilecek ve kişiselleşmiş ilaç uygulamalarının önemi tartışılacaktır.
Dersin Öðrenme Çýktýlarý Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler;
* Farklı canlılardaki genomic yapıları tanımlayabilecek.
* Karşılaştırmalı genomik uygulamalarını tartışabilecek.
* Klasik ve modern genomik teknikleri açıklayabilecek.
* Protein yapı ve fonksiyonunu incelemede kullanılan proteomik yaklaşımları inceleyebilecek.
* Genomik ve proteomic uygulama alanlarını tarifedebilecek.
Dersin Tanýmý Genomik ve proteomik yaklaşımların tanımı ve uygulama alanları, yapısal genomik, işlevsel genomik ve karşılaştırmalı genomiklerin kullanım şekilleri, canlılara ait genomların analizi, proteomik analizler.
Ders Kategorisi Temel Meslek Dersleri
Uzmanlık/Alan Dersleri X
Destek Dersleri
İletişim ve Yönetim Becerileri Dersleri Aktarılabilir Beceri Dersleri
HAFTALIK KONULAR VE ÝLGÝLÝ ÖN HAZIRLIK ÇALIÞMALARI
Hafta16 Konular Ön Hazýrlýk
1 Genomik'e Giriş Concepts and Techniques in Genomics
and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 1
2 İnsan Genom Projesi Concepts and Techniques in Genomics
and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 2
3 Model Organizmaların ve Vektörlerin Genomları Concepts and Techniques in Genomics
and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 3,4
4 DNA ve Genom Sekanslama Yöntemleri Concepts and Techniques in Genomics
and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 5,7
5 Genom Haritalama Concepts and Techniques in Genomics
and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam,
Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 6
6 Genom Derleme ve Açımlama Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 8
7 Fonksiyonel Genomik Concepts and Techniques in Genomics
and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 9
8 1. Ara Sınav
9 Proteomik'e Giriş Concepts and Techniques in Genomics
and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 10
10 2D Jel Elektroforez Concepts and Techniques in Genomics
and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 11 11 2. Ara Sınav
12 Kütle Spektroskopisi Concepts and Techniques in Genomics
and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 12
13 Peptit kütle parmak izi ile protein tanılama Concepts and Techniques in Genomics
and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 13
14 Protein sekanslama teknikleri Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu
Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7.
Chapter 14 15 Genel tekrar
16 Final sınavı
KAYNAKLAR
Ders Kitabý Concepts and Techniques in Genomics and Proteomics, Nachimuthu Saraswathy, Ponnusamy Ramalingam, Elsevier, 2011, 978-1-907568-10-7
Önerilen Okumalar/Materyaller
DEÐERLENDÝRME SÝSTEMÝ
Yarýyýl Aktiviteleri Sayý Katký Payý
Katılım - -
Laboratuvar / Uygulama - -
Arazi Çalışması - -
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği 1 15
Portfolyo - -
Ödev 1 15
Sunum / Jüri Önünde Sunum - -
Proje - -
Seminer/Çalıştay - -
Sözlü Sınav - -
Ara Sınavlar 1 30
Final 1 40
Toplam 4 100
YARIYIL ÝÇÝ AKTÝVÝTELERÝN BAÞARI NOTUNA KATKISI 4 70
YARIYIL SONU AKTÝVÝTELERÝN BAÞARI NOTUNA KATKISI 1 30
Toplam 5 100
AKTS / ÝÞ YÜKÜ TABLOSU
Yarýyýl Aktiviteleri Sayý Süresi (Saat) Toplam
Ders saati (Sınav haftası dahildir: 16 x toplam ders saati) 16 4 64
Laboratuvar / Uygulama 16 - -
Sınıf Dışı Ders Çalışması 14 1 14
Arazi Çalışması - - -
Küçük Sınavlar / Stüdyo Kritiği 1 5 5
Portfolyo - - -
Ödev 1 10 10
Sunum / Jüri Önünde Sunum - - -
Proje - - -
Seminer / Çalıştay - - -
Sözlü Sınav - - -
Ara Sınavlar 1 25 25
Final 1 32 32
Toplam Ýþ Yükü 150
DERSÝN ÖÐRENÝM ÇIKTILARININ PROGRAM YETERLÝLÝKLERÝ ÝLE ÝLÝÞKÝSÝ
# Program Yeterlilikleri / Çýktýlarý * Katký Düzeyi
1 2 3 4 5
1 Matematik, Fen Bilimleri ve Genetik ve Biyomühendislik konularında yeterli bilgi sahibidir; bu alanlardaki kuramsal ve uygulamalı bilgileri, karmaşık mühendislik problemlerinde kullanır.
X
2 Karmaşık Genetik ve Biyomühendislik problemlerini saptar, tanımlar, formüle eder ve çözer; bu amaca uygun analiz ve modelleme yöntemlerini seçer ve uygular.
X
3 Karmaşık bir sistemi, süreci, cihazı veya ürünü gerçekçi kısıtlar ve koşullar altında, belirli gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlar; bu amaçla modern tasarım yöntemlerini uygular.
X
4 Genetik ve Biyomühendislik uygulamalarında karşılaşılan karmaşık problemlerin analizi ve çözümü için gerekli olan modern teknik ve araçları geliştirir, seçer ve kullanır.
X
5 Genetik ve Biyomühendislik araştırma konularının incelenmesi için deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz eder ve yorumlar.
X
6 Genetik ve Biyomühendislik disiplini içinde ve çok disiplinli takımlarda etkin biçimde çalışır;
bireysel çalışma sergiler.
X
7 Türkçe sözlü ve yazılı etkin iletişim kurar; etkin rapor yazar ve yazılı raporları anlar, tasarım ve üretim raporları hazırlar, etkin sunum yapar, açık ve anlaşılır talimat verir ve alır.
8 Genetik ve Biyomühendislik uygulamalarının evrensel ve toplumsal boyutlarda sağlık, çevre ve güvenlik üzerindeki etkileri ve çağın sorunları hakkında bilgi sahibidir; Genetik ve
Biyomühendislik çözümlerinin hukuksal sonuçlarının farkındadır.
X
9 Etik ilkelerine uygun davranma, mesleki ve etik sorumluluk bilincine sahiptir; Genetik ve Biyomühendislik uygulamalarında kullanılan standartlar hakkında bilgi sahibidir.
X
10 Proje yönetimi, risk yönetimi ve değişiklik yönetimi gibi, iş hayatındaki uygulamalar hakkında bilgi sahibidir; girişimcilik, yenilikçilik hakkında bilinçlidir; sürdürülebilir kalkınma hakkında bilgi sahibidir.
11 Bir yabancı dili kullanarak Genetik ve Biyomühendislik ile ilişkili konularda, bilgi toplar ve meslektaşları ile iletişim kurar.
X
12 İkinci yabancı dili orta düzeyde kullanır. X
13 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilincindedir; bilgiye erişir, bilim ve teknolojideki gelişmeleri izler ve kendini sürekli yeniler; insanlık tarihi boyunca oluşan bilgi birikimini Genetik ve
Biyomühendislik alanıyla ilişkilendirir.
X
*1 Lowest, 2 Low, 3 Average, 4 High, 5 Highest
