• Sonuç bulunamadı

F) Escherichia coli O157:H7 (VTEC)’ nin izolasyonu:

5. SONUÇLAR VE TARTIŞMA

Yapmış olduğumuz Fransız presinden alınan sonuçlar itibariyle değerlendirme yapılacak olursa sisteminin çalışmış olması umut vermektedir. Fakat Fransız presindeki sızdırmazlık problemleri de hala devam etmektedir. Bu sızdırmazlık probleminin çözülmesi için kullanılan o-ringlerin yerine sadece bu sistem için tasarlanmış özel o- ringler kullanılabilir.

Sonikatörde sadece az bir miktar çözeltiyle çalışılabilirken Fransız presinin bir avantajı da 100 ml’ye kadar çözeltileri kolaylıkla tek seferde parçalayabilmesidir. Fakat, sonikatör sistemindeki ısınma problemi Fransız presi için de gündeme gelmiştir. Isınma probleminin giderilmesi sistemin performansını arttıracaktır. Bu yüzden sonikatör sisteminde kullanılan buz içinde parçalama yöntemi Fransız presi için de düşünülebilir. Fransız presi ile hücre parçalama işlemi sonikatöre göre daha uzun zaman almaktadır. Eğer sızdırmazlık problemleri giderilirse bir geçişte en az %50 oranında hücre parçalama işlemi gerçekleşeceği düşünülmektedir. Bu da Fransız presinin daha kullanışlı olması anlamına gelecektir.

KAYNAKLAR

Andreotti, P.E., Ludwig, G.V., Peruski, A.H., Tuite, J.J., Morse, S.S., Peruski Jr, L.F. 2003. Immunoassay of Infectious agents. Reprinted with permission from BioTechniques (35), 850–859

(Anonim), 1992. American Public Health Association. Compendium of Methods for the

Microbiological Examination of Foods, 3rd (Edt.). APHA,Washington, DC, (Anonim), 1992–1993.Centers for Disease Control and Prevention. Update: Multistate outbreak of Escherichia coli O157:H7 infections from hamburgers-Western United States, Morbid. Mortal. Weekly Rep. 42, p. 258–263.

(Anonim), 1996. Centers for Disease Control and Prevention. Outbreak of Escherichia coli O157:H7 infections associated with driking unpasteurized commercial apple juice. Morbid. Mortal. Weekly Rep. 45, p. 44.

(Anonim), 2003. Hücre,http://tr.wikipedia.org/wiki/H%C3%BCcre# Yap.C4.B1s.C4. B1.( 07.05.2010)

(Anonim), 2004. Bakterilerin Kullanım Alanları,http://www.main-

board.eu/biyoloji/336111-bakterilerin-kullanim-alanlari.html (25.02.2010) (Anonim), 2007. E.coli( Escherichia coli), http://ziraat.yyu.edu.tr/tr/modules/ exicon/print.php?entryID=1 (07.05.2010)

(Anonim), 2007. Http:/www.ifr.brsc.ac.uk / Public/Food_nfoSheet. (23.12.2009) (Anonim), 2008. Http:/www.ifr.brsc.ac.uk / Public/FoodnfoSheet, (20.12.2009). (Anonim), 2008. Hücre Zarı. http://tr.wikipedia.org/wiki/H%C3%BCcre_zar% C4%B1.(30.04. 2010 )

Anonim), 2009. E.coli, http://tr.wikipedia.org/wiki/Escherichia_coli. ( 03.02.2010) (Anonim), 2010. Bakteri, http://tr.wikipedia.org/wiki/Bakteri. ( 10.05.2010) Arda.,M.,1999.Temel Mikrobiyoloji. 2. baskı, Ankara, s. 13–15.

Bilgehan, H., 2000. “Escherichia” Prof. Dr. Hakkı Bilgehan,: Klinik Mikrobiyoloji- Özel Bakteriyoloji ve Bakteri Enfeksiyonları, 10. baskı, Đzmir. s. 3–17. Birge, E. A., 2000. Bacterial and Bacteriophage Genetics, Springer-Verlag Inc, Fourth Edition,p 341-369, New York

Bilgin, Y., 2006. Escherichiae coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacterbaumannii ve Staphylococcus aureus suslarında çesitli aminoglikozidlerin duyarlılıklarının arastırılması (uzmanlık tezi) Đstanbul, Brock, T. D. ve Smith, D. W. ve Madigan, M. T., 1984, Biology of Microorganisms, Fourth Edition, Prentice Hall International Inc., New Jersey. p 586-607. Çakır, Đ., 2000. Gıda mikrobiyolojisi ve uygulamaları, Koliform Grup Bakteriler ve E. coli, ( Edt.) : Halkman, A. K., 2. baskı, Basak matbaacılık. 335–343. Ankara. Çakır, Đ., Dogan, B.H., Baspınar, E., Keven, F., Halkman, A.K., 2001.The need for confirmation in coliform and E. coli Enumeration in Foods . Turk J. Vet. Anim. Sci. 26, p. 1049–1053,

Dehghani, M. H., 2005. Effectiveness of Ultrasound on the Destruction of E.coli. American journal of Environmental science, 1 (3), 187-189.

Delikara,B.,2006. L.monocytogenes’in sonikasyonla inaktivasyonuna farklı amplitüd , pH ve sıcaklığın etkisi. Yüksek Lisans Tezi,Biyoloji ABD,Eskişehir.

38

Doyle, M.P., Schoeni, J.L., 1987. Isolation of Escherichia coli O157:H7 from retail meats and poultry. Appl. Environ. Microbiol. 53. p. 2394–2396.

Drlica, K., 2003. Understanding DNA and Gene Clonning. John Wiley and Sons, Inc, Fourth Edition, p 84-89,166-169, NJ .

Entis, P., 1989. Hydrophobic grid membrane filter/MUG method for total coliform and Escherichia coli Enumeration in foods: collaborative study. J. Assoc. Anal. Chem. 72. P.936–950,

Erdem, B., 1999. Enterobacteriaceae, In: Ustaçelebi S, (Edt.): Temel ve Klinik Mikrobiyoloji. 1. Baskı, s. 471–515. Ankara.

Feliu, J. X. ve Cubarsi, R. ve Villaverde, A. 1998. Optimized Release of Recombinant Proteins by Ultrasonication of E.coli Cells. Biotechnology and Bioengineering, 5 (58), 536-540.

Feng, P., Hartman, P.A., 1982. Fluorogenic assays for immediate confirmation of Escherichia coli. Appl. Environ. Microbiol. 43. p.1320–1329.

Feng, P., Weagant, S.D., Grant, M.A., 2002. Enumeration of Escherichia coli and the Coliform Bacteria. Bacteriological Analytical Manual, 8th Edition, Revision A, 1998. Chapter 4, Revised.

Halkman, A.K., Noveir, R.M., Dogan, B.H., 2001. Escherichia coli O157:H7 Serotipi, Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisligi Bölümü, Ankara. Harigan, W.F., 1998. Laboratory Methods in Food Microbiology. 3.baskı.166– 167. Hicks, S., Frankel, G., Kaper, J.B., Dougan, G., Phillips, A.D., 1998. Role of intimin and bundle-forming pili in enteropathogenic Escherichia coli adehesion to pediatric intestinal tissue in vitro. Đnfect. Đmmun. 6.p.1570–1578.

Hu, Y., Zhang, Q., Meitzer, J.C., 1999. Rapid and sensitive detection of Escherichia coli O157:H7 in bovine faeces by a multiplex PCR. J. Appl. Microbiol. 87.p.867– 876.

James, C.J. ve Coakley, W.T. ve Hughes, D.E.,1972. Kinetics of Protein release from yeast sonicated in batch and flow systems at 20Khz. Biotechnology and Bioengineering Journals Vol 14. p 33-42.

Jeffrey, W. H., Nazaret, S., Von Haven, R., 1994. Đmproved method for recovery of mRNA from aquatic samples and its application to detection of mer expression. Appl. Environ. Microbiol. 60. p.1814–1820.

Kuby, J., 1998. Immunology: Antigen- Antibody Interactions, 3. (Edt) .Chapter 6. P. 156-164, Pub: Feeman,

Lindahl, T., 1993. Đnstability and decay of the primary structure of DNA. Nature 362. p. 709–715.

Ludmil,B. ve Jameela, A., 2002. Disrupting Escherischia coli: A Comparison of Methods. Journal of Biochemistry and Molecular Biology , Vol.35,(4). p. 428- 431.

Martins, M.T., Rivera, I.G., Clark, D.I., Stewart, M.H., Wolfe, R.L., Olson, B.H., 1993. Distribution of uidA gene sequences in Escherichia coli isolates in water sources and comparison with the expression of ß-glucronidase activity in 4- methylumbeliferyl-ß-D-glucronide media. Appl. Envirion. Microbiol. 59. p. 2271–2276.

McDaniels, A.E., Rice, E.W., Reyers, A.L., Johnson, C.H., Haugland, R.A., Atelma, G.N.Jr., 1996. Confirmational identification of Escherichia coli, a comparison of genotype and phenotypic assays for glutamate decarboxylase and ß-D- glucronidase. Appl. Environ. Microbiol. 62. p.3350–3354.

Mahvi, A.H. ve Dehghani, M.H. ve Vaezi, F.,2005. Ultrasonic technology effectiveness in total koliforms disinfection of water. Journal of Applied Science. 5. p.856 858.

O’Brien, A.D., La Veck, G.D., Thompson, M.R., Formal, S.B., 1982. Production of Shigella dysenteriae type1-like cytotoxin by Escherichia coli. J.Infect Dis, 146. p. 763–769,

Pitkanen, T., Paakkari, P., Đlkka, T.M., Tanski, H.H., Paulin, L., Hainnen, M.L., 2007. Comparison of media for Enumeration of Coliform Bacteria and Escherichia coli in non-disinfected water. Journal of Microbiological Methods, 68. p. 522– 529.

Rice, E.W., Covert, T.C., Johnson, S.A., Reasoner, D.J., 1995. Detection of Escherichia coli in water using a colorimetric gene probe assay. J. Environ. Sci. Health A 30. p. 1059–1067.

Roitt, I., Brostoff, J., Male, D., 1996. Immunological Techniques. in: Immunology, 4.edition. Chapter 28. Edt: Louise Cook. Pub: Dianne Zack. London,

Sığırtmaç, N.,2008, Escherischia coli’nin farklı şekerleri kullanma yeteneği üzerine bir çalışma,s.12, Kars.

Skauen, D., 1976, A comparison of heat production and cavitation intensity ın several ultrasonic cell disrupters, Ultrasonics 14. p. 173-176.

Song,D.D. ve Jacques,N.A.,1997. Cell Disruption of Escherischia coli by Glass Bead Stirring fort he Recovery of Recombinant Proteins. Anal Biochemistry. 248, p 300-301

Watson, D., 1976, Molecular Biology of the Gene, W.A. BENJAMĐN Inc., Third Edition, p 59-82, Canada.

40

ÖZGEÇMĐŞ

Kişisel Bilgiler

Adı Soyadı : Selçuk DEMĐR

Doğum Tarihi ve Yer : 17.02.1983 /Yenimahalle

Medeni Hali : Evli

Yabancı Dili : Đngilizce

Telefon : 05462992961

E-mail : selcuk66demir@hotmail.com

Eğitim

Derece Eğitim Birimi Mezuniyet Tarihi

Lisans Hacettepe Üniversitesi-Kimya Mühendisliği 2006

Lise Halide Edip Adıvar Lisesi 2001

Đş Deneyimi

Yıl Yer Görev

2010-Halen MKEK Kırıkkale Barut Fabrikası Üretim Mühendisi

Benzer Belgeler