ÖKARYOTİK GENOMLARIN ORGANİZASYONU VE KONTROLÜ

(1)

(2)

ÖKARYOTİK GENOMLARIN ORGANİZASYONU VE KONTROLÜ

(3)

ÖKARYOTİK GENOMLARIN ORGANİZASYONU VE

KONTROLÜ

(4)

• Sekanslar (10 baza kadar) 10-

• 100000 kez tekrarlanabilir

• Böylece her bölgede DNA uzunluğu

farklılaşabilir

Memelilerde genomun % 10 -15’i artarda tekrarlanan DNA, ya da satellite (uydu) DNA’dan oluşur

Bu bölgeler belirli DNA dizilerinin artarda tekrarı oldukları için diğer DNA bölgelerinden farklı ultrasantrifüj bantları

oluştururlar

ÖKARYOTİK GENOMLARIN

ORGANİZASYONU VE KONTROLÜ

(5)

ÖKARYOTİK GENOMLARIN ORGANİZASYONU VE KONTROLÜ

(6)

ÖKARYOTİK GENOMLARIN

ORGANİZASYONU VE KONTROLÜ

(7)

ORGANİZASYONU VE KONTROLÜ

(8)

ÖKARYOTİK GENOMLARIN ORGANİZASYONU VE KONTROLÜ

Bir immünoglobulin geninin olgunlaşması

(9)

Signal

NUCLEUS Chromatin

Chromatin modification:

DNA unpacking involving histone acetylation and

DNA demethlation

Gene

DNA Gene available

for transcription

RNA Exon

Transcription

Primary transcript

RNA processing

Transport to cytoplasm Intron

Cap mRNA in nucleus

Tail

CYTOPLASM mRNA in cytoplasm

Degradation of mRNA

Translation

Polypetide Cleavage Chemical modification

Transport to cellular destination

Active protein

Degradation of protein

Degraded protein

Ökaryotik Gen İfadesi Kontrol Aşamaları

(10)

ÖKARYOTİK GENOMLARIN ORGANİZASYONU VE KONTROLÜ

Enhancer (distal control elements)

Proximal control elements

DNA

Upstream

Promoter

Exon Intron Exon Intron

Poly-A signal sequence Exon

Termination region

Transcription

Downstream Poly-A

signal Exon Intron Intron Exon

Primary RNA Exon transcript (pre-mRNA)

5

Intron RNA

RNA processing:

Cap and tail added;

introns excised and exons spliced together

Coding segment

P P P

mRNA G

5 Cap 5 UTR (untranslated

region)

Start codon

Stop

codon 3 UTR (untranslated

region)

Poly-A tail

Chromatin changes

Transcription

RNA processing

mRNA

degradation Translation

Protein processing and degradation

Cleared 3 end of primary transport

Bir Ökaryotik Gen ve Onun Transkripti

(11)

ÖKARYOTİK GENOMLARIN ORGANİZASYONU VE KONTROLÜ Distal control

element

Activators Enhancer

Promoter

Gene TATA

box General

transcription factors DNA-bending

protein

Group of

Mediator proteins RNA

Polymerase II

RNA

Polymerase II RNA synthesis Transcription

Initiation complex

Chromatin changes

Transcription RNA processing

mRNA

degradation Translation Protein processing

and degradation

A DNA-bending protein brings the bound activators closer to the promoter.

Other transcription factors, mediator proteins, and RNA polymerase are nearby.

2

Activator proteins bind to distal control elements grouped as an enhancer in the DNA. This enhancer has three binding sites.

1

The activators bind to certain general transcription factors and mediator proteins, helping them form an active transcription initiation complex on the promoter.

3

Enhansır Modeli

(12)

Transkripsiyon faktörlerinin yapısal Özellikleri

(13)

Chromatin changes

Transcription

RNA processing

mRNA degradation

Translation

Protein processing and degradation

Exons

DNA

Primary RNA transcript

mRNA

RNA splicing or

Seçenekli RNA Splaysı

(14)

Proteasom Tarafından Protein Yıkımı

(15)

Proto-onkogenlerin Genetik Değişikliklerle Onkogenlere Dönüşümü

(16)

ORGANİZASYONU VE KONTROLÜ

(17)

(18)

DNA TEKNOLOJİSİ VE GENOMİKS

(19)

(20)

DNA TEKNOLOJİSİ VE GENOMİKS

(21)

(22)

(23)

DNA TEKNOLOJİSİ VE GENOMİKS

(24)

(25)

(26)

(27)

(28)

(29)

DNA TEKNOLOJİS İ VE

GENOMİKS

(30)

DNA TEKNOLOJİS İ VE

GENOMİKS

(31)

(32)

(33)

(34)

(35)

(36)

(37)

(38)

(39)

(40)

(41)

(42)

(43)

(44)

(45)

(46)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(47)

(48)

(49)

(50)

(51)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(52)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(53)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(54)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(55)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(56)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(57)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(58)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(59)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(60)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(61)

(62)

GELİŞİMİN GENETİK TEMELİ

(63)