İSTİNYE ÜNİVERSİTESİ
MOLEKÜLER KANSER ARAŞTIRMA VE UYGULAMA MERKEZİ
(İSÜMKAM)
CENTER FOR MOLECULAR CANCER RESEARCH AND IMPLEMENTATION
2020 FAALİYET RAPORU
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
Yönetim
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi Direktörü Prof. Dr. Engin Ulukaya
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi Sorumlu ve Araştırmacıları Dr. Öğr. Üyesi Süreyya Bozkurt
Dr. Öğr. Üyesi Didem Karakaş Zeybek Dr. Öğr. Üyesi Nazlıhan Aztopal
Dr.Öğr.Üyesi Dilşad Özerkan Dr.Öğr.Üyesi Huri Bulut Dr. Öğr. Üyesi Caner Geyik Dr. Öğr. Üyesi Öykü Gönül Geyik
Dr. Öğr. Üyesi Aslı Kutlu Araştırma Görevlisi Okan Remzi Akar
Araştırma Görevlisi Nazlı Sıla Kara Araştırma Görevlisi Hilal Şentürk
Uzman Biyolog Merve Erkısa Uzman Biyolog Melda Sarıman
Yüksek Lisans Öğrencileri Beste Aydın, Yüksek Lisans Öğrencisi Selin Kaymaz, Yüksek Lisans Öğrencisi Hatice Dinçer, Yüksek Lisans Öğrencisi Vida Rezayifar, Yüksek Lisans Öğrencisi Sonia Shokouhy, Yüksek Lisans Öğrencisi Gouled Said Abdi, Yüksek Lisans Öğrencisi Abdülkadir Slocum, Yüksek Lisans Öğrencisi Mehmet Emin Köse, Yüksek Lisans Öğrencisi Malika Bezgrari, Yüksek Lisans Öğrencisi
Nourhan Samir Abdelhamit Ali Hamed Yüksek Lisans Öğrencisi Derya Yıldız,Yüksek Lisans Öğrencisi
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
Sıla Sığırlı, Yüksek Lisans Öğrencisi Senanur Malcanlı,Yüksek Lisans Öğrencisi Janset Ceren Namlı, Yüksek Lisans Öğrencisi
Merve Arda, Yüksek Lisans Öğrencisi
İstinye Üniversitesi AR-GE bölümünde, 2017 yılından bu yana Moleküler Kanser Araştırma Merkezi (İSUMKAM) olarak anti- kanser ilaç geliştirme ve kişiselleştirilmiş onkoloji alanındaki çalışmalarımıza devam etmekteyiz.
Projeler:
• TUSEB 2020 -Yenilikçi ilaç geliştirme alan- Patentli Bir Bileşik: Palladyum (II) Barbitürat ompleksinin Kolon Kanserinin Farklı Genetik Alttipleri (BRAFmut Vs KRASmut) Üzerindeki Etkisinin in Vitro ve in Vivo Araştırılması
• Tübitak 1002 - Bazı Yeni 5-Ariliden-Tiyazolo[3,2-B]-1,2,4-Triazol-6(5H)-on Türevlerinin Sentezi, Karakterizasyonları ve Sitotoksik Etkilerinin İncelenmesi (devam ediyor)
• Tübitak 3501 – Kolorektal Kanser Hasta Dokularından Üç Boyutlu ex vivo Tümör Organoid Modellerinin Geliştirilmesi ve Bu Modellerde İlaç Taşıyıcı Proteinlerin Tedavi Yanıtındaki Rollerinin Araştırılması (devam ediyor)
• Tübitak 3501 – Pankreatik Kanser Hücreleri ile Nöral Hücreler Arasındaki Eksozomal MikroRNA Aracılı İletişimin Pankreatik Kanserin Agresif Karakteri Üzerine Etkilerinin İncelenmesi (devam ediyor)
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
• Tübitak 1001 – Pankreatik Kanser Stromasının Hedeflenmesi ile Doğal Öldürücü Hücrelerin Sitotoksik Aktivitesi Arasındaki lişkinin İncelenmesi (devam ediyor)
• İstinye Üniversitesi-Bilimsel Araştırma Projeleri BAP-Çevre Dostu Yöntemlerle Bitkilerden Yeni Nesil Nanopartikül Sentezi ve Antikanser Etkileri
• İstinye Üniversitesi- Bilimsel Araştırma Projeleri BAP-Yeni Sentez Naftakinon Türevli Bileşiklerin Kanser Hücre Hatları Üzerindeki Sitotoksik/Antikanser Aktivitelerinin İncelenmesi
• Tübitak 1001- Rett Sendromu (RTT) İle İlişkilendirilmiş Mutasyonların Yapısal Etkilerinin Moleküler Dinamik Simülasyonları İle Araştırılması
• İstinye Üniversitesi -BAP-Deneysel Otoimmun Ensefalomiyelitli Farelerde Microarray Analizi ile Elde Edilmiş,Erken Tanıda Kullanılabilecek Aday miRNAların İnsan Oligodendrosit Hücrelerine Etkisinin Araştırılması
• İstinye Üniversitesi-Bilimsel Araştırma Projeleri BAP-Etoposidin Anti-anjiyogenik Etkisinin Chorioallantoic Membrane (CAM) Deneyi ile Gösterilmesi
Ortak Projeler:
• Bozok Üniversitesi BAP: Pankreas Kanseri Hücrelerinde İçeri Doğrultucu Potasyum Kanallarının Rolü.
• Bozok Üniversitesi BAP: Akciğer Kanseri Hücrelerinde Potasyum Kanallarının Rolü.
• Hacettepe Üniversitesi BAP: Bazı Yeni Tiyazolo[3,2-b]-1,2,4-triazol-6(5H)-on Türevlerinin Sentezi ve Sitotoksik Etkilerinin Araştırılması
• İstanbul Üniversitesi BAP: Meme Kanseri Kök Hücrelerinin Farklı Biyokimyasal ve Morfolojik Yöntemler ile Tanımlanması
• Tübitak 1001: Kemik İliği Mezenkimal Kök Hücrelerinden in vitro Bağ Dokusu Gelişimi Sırasında Kullanılan Polimerik/Seramik Yapılı Kompozit Biyomalzemelerin Enzimatik Olarak Degradasyonun Hücrelerin Fenotipik ve Morfolojik Farklılaşmaları Üzerine Etkisinin İncelenmesi
• İstanbul Üniversitesi BAP: Fosfin Ligandı İçeren Platin (II) Sakkarinat Komplekslerinin Anti- Anjiyogenik Etkilerinin İn Vitro ve İn Vivo Araştırılması
• Hacettepe Üniversitesi BAP:Hidrazon Yapısında Yeni MAO İnhibitörü Bileşiklerin Sentezi ve MAO İnhibisyonunun İnsan Prostat Akciğer ve Gliyoma Tümörlerindeki Teröpatik Etkisinin Değerlendirilmesi
• TÜBİTAK 1001-Olusturulacak in-vitro Tümör Heterojenite Modelinde Solid Tümörlerdeki Farklı Hücre Populasyon Kinetiklerinin Incelenmesi
• İstinye Üniversitesi BAP: Kolorektal Kanserde FOXP3 ve TGF-B Reseptör Gen Regülasyonlarının İrinotekanın Sitotoksik Aktivitesi Üzerine Etkisinin Araştırılması:Prediktif Belirteç Keşfi
• Bülent Ecevit Üniversitesi BAP:İmidazol Halkası İçeren Yeni Bakır Komplekslerinin Antikanser Aktivitesinin Belirlenmesi
Başvurusu Yapılan Projeler:
• Tübitak 1002: İlaç Direnci Geliştirerek Metabolik Değişime Uğramış Kanser Hücrelerinde Gentamisinin Terapötik Etkilerinin Araştırılması
• Tübitak 1002 Lavandula Stoechas Esansiyel Yağlarının Sıçanlarda Fluoksetin Kaynaklı Hepatotoksisite Üzerine Koruyucu Etkileri
• Tübitak 1002: İskemi/Reperfüzyon Yaralanması Kaynaklı Oksidatif Stres Oluşturulmuş Sıçan Testisi Üzerinde Lavandula Stoechasin Koruyucu Etkisi
• Tübitak 1002: Citrus Bergamia Esansiyel Yağlarının Adolesan Dönemindeki Sıçanlarda Sosyal İzolasyon Kaynaklı Anksiyete Üzerine Koruyucu Etkileri
• Tübitak 3501: Mitokondriyal Füzyon Mekanizmasında Görevli Mitofusin Proteinlerini Hedef Alan İnhibitör Geliştirilmesi
• Tübitak-İkili İş Birliği-Periodontal Ligament Kök Hücrelerinden Türetilen Eksozomlar Ve Periferal Nöral Greft Içeren Polikaprolakton / Kollajen Nanofibröz Kanallar Kullanarak Omurilik Hasarının Onarımı
• Tübitak İkili İşbirliği- Yeni Prolidinler, Siklik Tiyoüre analoglarının Sentezi, Karakterizasyonu, Biokativite ve Hesaplamalı Çalışmaları ve Anti-Kanser Aktivitelerinin Araştırılması
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
Yapılan İşbirlikleri:
1-Zonguldak Bülent Ecevit Üniversitesi Kimya Bölümü, Doç. Dr. Zuhal Gerçek, yeni bakır komplekslerinin antikanser aktivitesinin incelenmesi merkezimizde yapılmaktadır.
2-Hacettepe Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Farmasötik Kimya ABD; Prof. Dr. Birsen Tozkoparan Köprücü ile ortak olarak yeni sentez bileşiklerin antikanser etkisinin araştırılması merkezimizde gerçekleştirilmektedir.
3- İstanbul Üniversitesi, Kimya Bölümü, Prof. Dr. Zeliha Gökmen, yeni naftakinon türevlerinin sentezi ve sitotoksik/antikanser aktivitelerinin İncelenmesi merkezimizde yapılmaktadır.
4-İstanbul Üniversitesi,Tıp Fakültesi Fizyoloji ABD,Prof.Dr.Dürdane Serap Kuruca,ile meme kanseri kök hücre çalışmaları merkezimizde yapılmaktadır.
5-Kastomunu Üniversitesi, Mühendislik ve Mimarlık Fakültesi Biyomedikal Mühendisliği, Dr.Öğr.Üyesi Nuray Emin ile kemik iliği mezankimal kök hücre karakterizasyonu merkezimizde yapılmaktadır.
6-Bozok Üniversitesi, Tıp Fakültesi Biyofizik ABD,Dr.Öğr.Üyesi Enes Akyüz, prostat ve akciğer iyon kanalları araştırmalarının hücre kültürü çalışmaları merkezimizde yapılmaktadır.
Merkezimizde Yapılan Çalışmalardan Görüntüler:
‘Onkogram yönteminin geliştirilmesine yönelik laboratuvar çalışmaları ’
‘Genel olarak hücre ölümü / sitotoksisite testlerinin metodolojik değerlendirilmeleri’
Çalışmalarımız
-Merkezimizde birkaç ana başlıkta çalışmalar yürütüyoruz ama en önemlisi kanser ilaç geliştirme çalışmalarıdır.
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
-Diğeri, hangi kanser hastasının hangi ilacı veya ilaçları alması gerektiği üzerinde çalışmalar yapıyoruz.
1-KİŞİSELLEŞTİRİLMİŞ ONKOLOJİ ÇALIŞMALARI DR-70 TESTİ
- Kanser Riskini erken evrede saptayan ve kanserli hastaların takibinin yapılmasını sağlayan FDA onaylı bir kan testidir.
- Diğer testler farklı kanser tiplerini ayrı ayrı değerlendirirken, DR-70 kanser riskini tek seferde saptayan en yeni ve yenilikçi ELISA bazlı bir laboratuvar testidir.
M30/M65 TESTİ
-Kemoterapi sonrası, spesifik apoptozis ve nekrozis ölçümleri yapılarak, -ilaç etkinliği, hastaların tedavi yanıtı ve olası direnç gelişimi izlenebilir.
-M30 ELİSA insan plazma/serum örneklerinde kaspazla kırılmış K18’i tespit eder.
- M65 ELISA insan plazma/serum örneklerinde hem kaspazla kırılmış hem de intakt K18’i tespit eder.
LİKİT BİYOPSİ TESTİ
-kanser tanısı konmuş ya da kanser olma ihtimali olan kişilerin - plazmalarından cfDNA fragmentlerinin izole edilmesi ile - non-invasif, yüksek sensitiviteye sahip bir testtir.
ONKOGRAM TESTİ
-Tümör kemosensitivite testi -Hastaya özgü kanser ilacı seçimi
Kanser tedavisi artık hastanın moleküler yapısına göre belirlenmeli. Ancak bu şekilde uzun yaşam sürelerine ulaşılabilir çünkü her insanın kanseri farklı, dolayısıyla her hastanın farklı ilaç kullanması gerekiyor. Merkezimizde, bu amaca yönelik hem araştırmalar hem de bizzat hastaya yönelik test hizmetleri (örneğin, likit biyopsi) başlattık.
2-ANTİ-KANSER İLAÇ GELİŞTİRME ÇALIŞMALARIMIZ
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
‘Anorganik sentez, bitki-ekstraktları, nanopartiküller vs. kullanılarak yeni ajan geliştirme çalışmaları ve bu ajanların sitotoksik etkilerinin preklinik değerlendirilmesi (in vitro ve in vivo) (drug discovery and development)’
Eğitim ve Etkinlik:
Yaz Stajı: Yaz Stajı kapsamında merkezimize üniversitemizden toplamda 3 lisans öğrencisine ilaç geliştirmenin ön basamağı olan temel hücre kültürü metodları, sitotoksisite testleri ve genomik - proteomik uygulamalarını pratik olarak deneyimleme fırsatı sunmuştur.
Lisans düzeyinde:
• Lisans düzeyinde Tıp Fakültemiz ve Moleküler Biyoloji Bölümü öğrencilerimiz Tübitak öğrenci projlerini merkezimiz bünyesinde gerçekleştirmektedirler.
• TÜBİTAK Öğrenci Projesi (2209A)-2020: Pankreas Kanserinde Baicalein ile Spironolactone Kombinasyonunun Sitotoksik/Apoptotik Etkilerinin Araştırılması-Buse Meriç Açar ve Hümeyra Karaca
• TÜBİTAK Öğrenci Projesi (2209A)-2020:Kolorektal Kanserde Timokinin ve Palladyum (II) Bileşiği Kombinasyonunun Sitotoksik/Apoptotik Etkilerinin Araştırılması- Onur Orbeği; Mehmet Toktaş; Emir Toğay
• TÜBİTAK Öğrenci Projesi (2209A)-2020 :Pankreas kanseri hücrelerinin silibine yanıtında pankreatik stellat hücreleirnden salınan faktörlerin etkisinin 2 boyutlu ve 3 boyutlu hücre kültüründe incelenmesi-İrem Nur Ateş
• Merkezimiz tıp fakültesi ve moleküler biyoloji ve genetik öğrencileri anti-kanser ilaç geliştirme çalışmalarına katılarak teorik bilgiyi uygulamalı olarak deneyimlemelerine fırsat sunmaktadır.
• Merkezimizde bulunan Spektrofotometre, Floresan Mikroskobu ve Jel Elektroforez Sistemleri lisans öğrencilerinin derslerinin uygulamalarında kullanılmaktadır.
Yüksek Lisans düzeyinde: Merkezimizde Kanser Biyolojisi ve Farmakolojisi Yüksek Lisans derslerine ve araştırmalarına uygulamalı olarak ev sahipliği yapmaktadır.2020 yılında ve Kanser Biyolojisi ve Farmakolojisi Yüksek Lisansında eğitim gören 5 öğrencimiz,Msc.Okan Remzi Akar, Msc.Çiler Gökçebel, Msc.Eren Şahin,Msc Beyhan Kılıç ,Msc Demet Sevimli, tez çalışmalarının ARGE merkezimizde gerçekleştirerek başarıyla mezun olmuştur.
İSÜMKAM İşbirliği ile Düzenlenen Etkinlikler/Kongreler
1-Onkolojinin Geleceği: Likit Biyopsi Toplantısı -(Zoom Toplantısı) ( 02 Eylül 2020)
02 Eylül 2020 Çarşamba tarihinde İstinye Üniversitesi Kanser Araştırma Merkezimizin önderliğinde düzenlediğimiz “Onkolojinin Geleceği: Likit Biyopsi Toplantısı” Zoom programı üzerinden gerçekleştirilmiştir.
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
2020 Yayınlar:
1-Erkisa, M., Ari, F., Ulku, I., Khodadust, R., Yar, Y., Yagci Acar, H., & Ulukaya, E. (2020).
Etoposide Loaded SPION‐PNIPAM Nanoparticles Improve the in vitro Therapeutic Outcome on Metastatic Prostate Cancer Cells via Enhanced Apoptosis. Chemistry & Biodiversity.
2-Yılmaz, I., Akar, O. R., Erkisa, M., Selvi, S., Şengül, A., & Ulukaya, E. (2020). Highly Promising Antitumor Agent of a Novel Platinum (II) Complex Bearing a Tetradentate Chelating Ligand. ACS Medicinal Chemistry Letters, 11(5), 940-948.
3-Icsel C, Yilmaz VT, Cevatemre B, Aygun M, Ulukaya E. Cytotoxic platinum(II) complexes derived from saccharinate and phosphine ligands: synthesis, structures, DNA cleavage, and oxidative stress- induced apoptosis. J Biol Inorg Chem. 2020 Feb;25(1):75-87. doi: 10.1007/s00775-019-01736-4. Epub 2019 Oct 26. PMID: 31655897.
4-Icsel C, Yilmaz VT, Aygun M, Ulukaya E. Trans-Pd/Pt(II) saccharinate complexes with a phosphine ligand: Synthesis, cytotoxicity and structure-activity relationship. Bioorg Med Chem Lett. 2020 May 1;30(9):127077. doi: 10.1016/j.bmcl.2020.127077. Epub 2020 Mar 4. PMID: 32156495.
5-Latif AD, Jernei T, Podolski-Renić A, Kuo CY, Vágvölgyi M, Girst G, Zupkó I, Develi S, Ulukaya E, Wang HC, Pešić M, Csámpai A, Hunyadi A. Protoflavone-Chalcone Hybrids Exhibit Enhanced Antitumor Action through Modulating Redox Balance, Depolarizing the Mitochondrial Membrane, and Inhibiting ATR-Dependent Signaling. Antioxidants (Basel). 2020 Jun 12;9(6):519. doi:
10.3390/antiox9060519. PMID: 32545536; PMCID: PMC7346169.
6-Erkisa, M., Aydinlik, S., Cevatemre, B., Aztopal, N., Akar, R. O., Celikler, S., ... & Ulukaya, E.
(2020). A promising therapeutic combination for metastatic prostate cancer: Chloroquine as autophagy inhibitor and palladium (II) barbiturate complex. Biochimie.
7-Erkisa, M., Aztopal, N., Erturk, E., Ulukaya, E., Yilmaz, V. T., & Ari, F. (2020). Combination of Histone Deacetylase Inhibitor with Cu (II) 5, 5-diethylbarbiturate Complex Induces Apoptosis in Breast Cancer Stem Cells: A Promising Novel Approach. Anti-cancer Agents in Medicinal Chemistry.
8-Gençkal, H. M., Erkisa, M., Alper, P., Sahin, S., Ulukaya, E., & Ari, F. (2020). Mixed ligand complexes of Co (II), Ni (II) and Cu (II) with quercetin and diimine ligands: synthesis, characterization, anti-cancer and anti-oxidant activity. JBIC Journal of Biological Inorganic Chemistry, 25(1), 161-177.
9-Aydinlik, S., Erkisa, M., Ari, F., Celikler, S., & Ulukaya, E. (2020). Palladium (II) Complex Enhances ROS-Dependent Apoptotic Effects via Autophagy Inhibition and Disruption of Multiple Signaling Pathways in Colorectal Cancer Cells. Anti-cancer Agents in Medicinal Chemistry.
10- Balıkcı N,Sarımahmut M,Arı F,Aztopal N,Özel M,Z,Ulukaya E,Çelikler KS.Toxicity assessment of Hypericum olympicum subsp.olympicum L.on human lymphocytes and breast cancer cell lines.
Journal of Applied Biomedicine,18(1),18-25.2020.
11- Karakas D, Ozpolat B .Eukaryotic elongation factor-2 kinase (eEF2K) signaling in tumor and microenvironment as a novel molecular target. .J Mol Med (Berl). 2020 Jun;98(6):775-787.
12-Sırma Ekmekci S, Emrence Z, Abacı N, Sarıman M, Salman B, Ekmekci CG, Güleç Ç. LEF1 Induces DHRS2 Gene Expression in Human Acute Leukemia Jurkat T-Cells. Turk J Haematol.
2020 Nov 19;37(4):226-233. doi: 10.4274/tjh.galenos.2020.2020.0144. Epub 2020 Jun 26. PMID:
32586085; PMCID: PMC7702649.
13-Taskin E, Guven C, Tunc Kaya S, Sariman M, Emrence Z, Ekmekci SS, Abaci N, Sevgiler Y, Akcakaya H. Silencing HMGB1 expression inhibits adriamycin's heart toxicity via TLR4 dependent manner through MAPK signal transduction. J BUON. 2020 Jan-Feb;25(1):554-565. PMID: 32277683.
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
14- Gönül Geyik Ö.Rrustemi T,Özkaya A,B.,Öztürk T,K.,Yüce Z,Kılınç A. (2020). Acrylamide- encapsulated glucose oxidase inhibits breast cancer cell viability. Turkish Journal of Biochemistry, 46(3), Doi: 10.1515/tjb-2020-0247 (Yayın No: 6384815)
15-Gönül Geyik Ö,Efe H,Baykal Köse S,Uysal Yoca Ö,Yüce Z .(2020). Generation of an in vitro Intratumoral Heterogeneity Model by Lentiviral Fluorescent Labeling of Colon Cancer Cell Line DLD- 1 Subclones. Journal of Basic and Clinical Health Sciences, 2020(4), 149-153., Doi:
10.30621/jbachs.2020.921 (Yayın No: 6234902)
16-Galofre C,Gönül Geyik Ö,Asensio E,Wangsa D,Hirsch D,Parra C,Saez J,Molla M,Yüce Z,Castells A,Ried T,Camps J. (2020). Tetraploidy-Associated Genetic Heterogeneity Confers Chemo- Radiotherapy Resistance to Colorectal Cancer Cells. Cancers, 12(5), 1118-1118., Doi:
10.3390/cancers12051118 (Yayın No: 6218759)
17- Baykal-Köse S, Acikgoz E, Yavuz AS, Gönül Geyik Ö, Ateş H, Sezerman OU, Özsan GH, Yüce Z. Adaptive phenotypic modulations lead to therapy resistance in chronic myeloid leukemia cells. PLoS One. 2020 Feb 27;15(2):e0229104. doi: 10.1371/journal.pone.0229104. PMID: 32106243; PMCID:
PMC7046262. 10.1371/journal.pone.0229104 (Yayın No: 6202053)
18-Gönül Geyik Ö,,Nalbant B,Hüsemoğlu Reşit B,Yüce Z,Ünek T,Havıtçıoğlu H (2020). Investigation of Surface Adhesion of MCF-7 Cells in 3D Printed PET and PLA Tissue Scaffold Models. Journal of Medical Innovation and Technology, 1(2), 45-50. (Yayın No: 6202056)
19-Erdem Kuruca S., Akgün Dar K, Kapucu A., Özerkan D. The Effects Of Zeolıte Supported Nutrıtıon On Cancer Development In The 1, 2 Dymethylhydrasın Induced-Colon Cancer Model. j Ist Faculty Med. (2020). 83(3), 234-241.
20-Özerkan, D., Özsoy, N., Cebesoy, S., & Özer, Ç. (2020). Distribution of spleen connective tissue fibers in diabetic and vitamin C treated diabetic rats. Biotechnic & Histochemistry, 1-7.
21- Kutlu E, Özgen İT, Bulut H, Koçyiğit A, Otçu H, Cesur Y. Serum Irisin Levels in Central Precocious Puberty and Its Variants. J Clin Endocrinol Metab. 2020 Oct 9:dgaa720. doi:
10.1210/clinem/dgaa720. Epub ahead of print. PMID: 33034623.
22- Bulut H, Valjakka J, Yuksel B, Yilmazer B, Turunen O, Binay B. Effect of Metal Ions on the Activity of Ten NAD-Dependent Formate Dehydrogenases. Protein J. 2020 Oct;39(5):519-530. doi:
10.1007/s10930-020-09924-x. Epub 2020 Oct 12. PMID: 33043425.
23- Bulut H, Yuksel B, Gul M, Eren M, Karatas E, Kara N, Yilmazer B, Kocyigit A, Labrou NE, Binay B. Conserved Amino Acid Residues that Affect Structural Stability of Candida boidinii Formate Dehydrogenase. Appl Biochem Biotechnol. 2020 Sep 25. doi: 10.1007/s12010-020-03429-0. Epub ahead of print. PMID: 32974869.
24- Yilmazer B, Isupov MN, De Rose SA, Bulut H, Benninghoff JC, Binay B, Littlechild JA. Structural insights into the NAD+-dependent formate dehydrogenase mechanism revealed from the NADH complex and the formate NAD+ ternary complex of the Chaetomium thermophilum enzyme. J Struct Biol. 2020 Dec 1;212(3):107657. doi: 10.1016/j.jsb.2020.107657. Epub 2020 Oct 24. PMID: 33148525.
25- Ustunova S, Takir S, Yilmazer N, Bulut H, Altindirek D, Ng OH, Tansel CD, Dogan BSU, Ozbek U, Armutak EI, Gurevin EG. Hydrogen Sulphide and Nitric Oxide Cooperate in Cardioprotection Against Ischemia/Reperfusion Injury in Isolated Rat Heart. In Vivo. 2020 Sep-Oct;34(5):2507-2516.
doi: 10.21873/invivo.12067. PMID: 32871779; PMCID: PMC7652485.
26- Bulut H, Schild-Suhren M, Malik E, Tüten A. Serum kallistatin level is decreased in women with preeclampsia. J Perinat Med. 2020 Aug 31:/j/jpme.ahead-of-print/jpm-2020-0142/jpm-2020-0142.xml.
doi: 10.1515/jpm-2020-0142. Epub ahead of print. PMID: 32866127.
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
27- Duman T, Akyüz E, Bulut H, Koçyiğit A, Tülek A, KarataŞ E, Kırpınar İ. Investigation of Diagnostic Proteins by 2D Electrophoresis in Major De-pression Model Induced by Forced Swim Test in Rats. Protein Pept Lett. 2020 Jul 29. doi: 10.2174/0929866527999200729183729. Epub ahead of print. PMID: 32729412.
28- Bozkurt S, Ünal Ş, Bayhan T, Gümrük F, Çetin M. Rare Cytogenetic Anomalies in Two Pediatric Patients with Acute Leukemia. Turk J Haematol. 2020 May 6;37(2):132-133. doi:
10.4274/tjh.galenos.2020.2019.0425. Epub 2020 Feb 14. PMID: 32054260; PMCID: PMC7236420.
29- Alagoz M, Kherad N, Bozkurt S, Yuksel A. New mutations in KCNT2 gene causing early infantile epileptic encephalopathy type 57: Case study and literature review. Acta Biochim Pol. 2020 Sep 15;67(3):431-434. doi: 10.18388/abp.2020_5364. PMID: 32931186.
Kitap ve Kitap Bölümü
Konferans/sempozyumların bildirileri
1- Exosomal communication between cancer cells and neurons promotes aggressive characteristics of pancreatic cancer. Karakas Zeybek D, Akar RO, Dincer H, Ulukaya E. “EACR-AACR Basic and Translational Research Conference in partnership with ASPIC: Tumor Microevironment”, 2-4 Mart, 2020.Lizbon, Portekiz.
2-Ali Burak Özkaya, Caner Geyik, Öykü Gönül Geyik, Oğuzhan Zengi, Funda İfakat Tengiz, Yasemin Seval Çelik, Ferhan Sağın, TBD Akademi’nin Çevrimiçi Eğitim Kursu-31. Ulusal Biyokimya Kongresi (25-27 Eylül 2020)
3- Ali Burak Özkaya, Caner Geyik.Yüksek etkili hücre kültürü çalışmalarında iddialar ve kanıtlar arasında uyumsuzluk-31. Ulusal Biyokimya Kongresi (25-27 Eylül 2020)
4- Nuray Emin, Dilşad Özerkan. Development of fibroin based composite structures for wound dressing. 3rd International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2020) 19-20 March 2020, Ankara, Turkey
5- Huri Bulut. MicroRNA expression altered in endometrial tissues of PCOS women. Eurasian Conference on Biotechnology and Biochemistry (BioTechBioChem 2020) December 16-18, 2020 (Chairman of the session)
6-Zozan Güleken and Huri Bulut. The antioxidant capacity of nanofiber dressings loaded with AV and HPO on STZ induced diabetic rat wound model. International Eurasian Conference on Biotechnology and Biochemistry (BioTechBioChem 2020) December 16-18, 2020
7-Esra Kutlu,İlker Tolga Özgen,Huri Bulut.İrisinin Puberte Prekoks Patofizyolosindeki Rolünün Dişi Sıçanlarda İncelenmesi-XXVI.Ulusal Pediatrik Endokrinoloji ve Diyabet Çevrim İçi Kongresi.30Ekim- 1 Kasım 2020.-kısa sözel bildiri birincilik ödülü.
Eğitmen-Kurs
Kurs – Eğitmen- Caner Geyik, Öykü Gönül Geyik- Ders Tasarımından Ölçme & Değerlendirmeye Uzaktan Eğitim (25-27 Eylül 2020)Düzenleyen: Türk Biyokimya Derneği – TBD Akademi grubu-31.
Ulusal Biyokimya Kongresi
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
Ödüller:
2020-2021 İstinye Üniversitesi Akademik Açılış ve Onurlandırma Töreni -, yayın ve proje ödülü alan hocalarımıza sertifika ve teşvik ödülü verildi.
Prof.Dr.Engin Ulukaya-15 yayın ile proje ödülü alan hocamıza sertifika ve teşvik ödülü verildi.
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
Dr.Öğr.Üyesi Didem Karakaş Zeybek-5 yayın ile proje ödülü alan hocamıza sertifika ve teşvik ödülü verildi.
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
Dr.Merve Erkısa Genel (PhD candidate)- 5 yayın ile proje ödülü alan hocamıza sertifika ve teşvik ödülü verildi.
Moleküler Kanser Araştırma ve Uygulama Merkezi (İSÜMKAM)
Istinye University Center for Molecular Cancer Research and Implementation ISÜMKAM
Araştırma Görevlimiz Msc.Nazlı Sıla Kara, Türkiye’de ve dünyada farklı üniversitelerde okuyan Türk araştırmacılar ile birlikte uluslararası bir başarıya imza attı. Covid-19 hastalığına neden olan SARS-CoV- 2 virüsü üzerine yapılan araştırmalar için proje başvurusunda bulunan Türk araştırmacılar, dünyada Covid- 19’un tedavisi için yapılan geliştirme çalışmalarında yeni bir evreye geçilmesine SARS-CoV-2 virüsü ile ilgili yaptıkları çalışmalarla katkıda bulundu.
