MİKROBİYOLOJİ BÜLTENİ BULLETIN OF MICROBIOLOGY

3 ayda bir yayımlanır. Published quarterly

ISSN: 0374-9096

e-ISSN: 2667-2994

MİKROBİYOLOJİ BÜLTENİ

BULLETIN OF MICROBIOLOGY

VOLUME

55

2021

3

MİKROBİYOLOJİ BÜLTENİ

BULLETIN OF MICROBIOLOGY

Sahibi / Owner

Ankara Mikrobiyoloji Derneği Adına Dernek Başkanı / On Behalf of Ankara Microbiology Society Prof. Dr. A. Gülşen HASÇELİK

Sorumlu Yazı İşleri Müdürü & Editör / Publication Manager & Editor

Prof. Dr. Özgen ESER

Yayın Kurulu / Editorial Board

Yazı İnceleme Kurulu / Advisory Board

AKALIN Halis, Prof. Dr. AKTAŞ Firdevs, Prof. Dr. AKYÖN YILMAZ Yakut, Prof. Dr.

ALBAY Ali, Prof. Dr. ALP Alpaslan, Doç. Dr. ARAL AKARSU Gülay, Prof. Dr ARIKAN AKDAĞLI Sevtap, Prof. Dr.

BAYLAN Orhan, Prof. Dr. CAN Füsun, Prof. Dr. ÇERİKÇİOĞLU Nilgün, Prof. Dr.

ÇOLAK Dilek, Prof. Dr. ÇÖPLÜ Nilay, Prof. Dr. DOĞRUMAN AL Funda, Prof. Dr.

DOLAPÇI G. İştar, Prof. Dr. DOLUCA Mine, Prof. Dr.

DURMAZ Rıza, Prof. Dr. ENER Beyza, Prof. Dr. ENGİN Doruk, Dr. Öğretim Üyesi

ERGİN Alper, Prof. Dr. ERENSOY Selda, Prof. Dr. ERGÜNAY Koray, Prof. Dr.

ERGÜVEN Sibel, Prof. Dr. ERTURAN Zayre, Prof. Dr. ESER Özgen, Prof. Dr.

FİDAN Işıl, Prof. Dr. GÜLMEZ Dolunay, Prof. Dr. HASÇELİK A. Gülşen, Prof. Dr.

İLKİT Macit, Prof. Dr. KALKANCI Ayşe, Prof. Dr. KARAARSLAN Aydın, Prof. Dr. KARABULUT Erdem, Prof. Dr. KARAHAN Zeynep Ceren, Prof. Dr.

KAYACAN Çiğdem, Prof. Dr. KOCAGÖZ Tanıl, Prof. Dr. KORKMAZ Metin, Prof. Dr. METİN Dilek Yeşim, Prof. Dr.

OK Ülgen Zeki, Prof. Dr. OTLU Barış, Prof. Dr. ÖKTEM Mehmet Ali, Prof. Dr.

ÖZBEL Yusuf, Prof. Dr. ÖZKÜTÜK Aydan, Prof. Dr.

ÖZKUYUMCU Cumhur, Prof. Dr. ÖZSAN Murat, Prof. Dr. ÖZYURT Mustafa, Prof. Dr.

PINAR Ahmet, Prof. Dr. SAĞIROĞLU Meral, Prof. Dr.

SANCAK Banu, Prof. Dr. SARIBAŞ Zeynep, Prof. Dr.

SAYINER Arzu, Prof. Dr. SERTÖZ Rüçhan, Prof. Dr. SÜRÜCÜOĞLU Süheyla, Prof. Dr.

ŞENER Burçin, Prof. Dr. TEKELİ Alper, Prof. Dr. ULUTAN Fatma, Prof. Dr.

US Tercan, Prof. Dr. UZUN Ömrüm, Prof. Dr. WILLKE TOPÇU Ayşe, Prof. Dr.

YALINAY Meltem, Prof. Dr. ZARAKOLU Pınar, Prof. Dr. ZEYREK Fadile, Prof. Dr. ZEYTİNOĞLU Ayşın, Prof. Dr.

Prof. Dr. A. Gülşen HASÇELİK* Prof. Dr. Alper ERGİN** Prof. Dr. Sevtap ARIKAN AKDAĞLI*

Prof. Dr. Gülay AKARSU*** Prof. Dr. Ayşe KALKANCI****

Prof. Dr. Özgen ESER* Prof. Dr. Burçin ŞENER* Prof. Dr. Ayça Arzu SAYINER*****

Prof. Dr. Yakut AKYÖN YILMAZ* Prof. Dr. Nilay ÇÖPLÜ******

*Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, **Hacettepe Üniversitesi Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu, ***Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi,****Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi, *****Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi,

******Kastamonu Üniversitesi Tıp Fakültesi Etik Danışmanı / Ethics Advisor

Prof. Dr. Nüket ÖRNEK BÜKEN Hacettepe Üniversitesi

Tıp Fakültesi

Biyoistatistik Danışmanı / Biostatistics Advisor Prof. Dr. Erdem KARABULUT

Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi İngilizce Dil Danışmanı / English Language Advisor

MİKROBİYOLOJİ BÜLTENİ / BULLETIN OF MICROBIOLOGY

Ankara Mikrobiyoloji Derneğinin Yayın Organıdır. Her Hakkı Saklıdır.

Official Journal of Ankara Microbiology Society. All Rights Reserved.

ISSN: 0374-9096 e-ISSN: 2667-2994

Yayın İdare Merkezi / Administrative Office

Sağlık Mahallesi, Aksu Sokak, No: 5/7 Sıhhiye, 06100 Ankara

Yazışma Adresi / Correspondence Address

Editör / Editor : Prof. Dr. Özgen Eser

Adres / Address : Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi,

Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Sıhhiye 06100, Ankara

E-posta / E-mail: : ankara.mikrobiyoloji@gmail.com

Web sitesi / Web site : www.ankaramikrobiyoloji.org.tr

Yayının Türü / Sort of Publication : Yerel Süreli / Local Periodically Basım Tarihi, Yeri / Publication Date and Place : 17 / 07 / 2021, Ankara Yayınevi / Publishing House :

Adres / Address : Bilimsel Tıp Yayınevi

Bükreş Sokak No: 3/20 Kavaklıdere, Ankara

Telefon / Phone : 0312 426 4747 - 466 2311

Faks / Fax : 0312 426 9393

E-posta / E-mail : bilimsel@bilimseltipyayinevi.com

Mikrobiyoloji Bülteni, Ankara Mikrobiyoloji Derneğinin bilim-sel içerikli resmi yayın organıdır. Ocak, Nisan, Temmuz ve Ekim aylarında olmak üzere yılda 4 sayı olarak yayınlanmaktadır. Mikrobiyoloji Bülteni’nin hedefi, tıbbi ve klinik mikrobiyoloji alanında bilimsel açıdan yüksek nitelikli araştırma makalelerini yayınlamaktır. Ayrıca derleme, kısa bildiri ve raporlar, olgu su-numları, editör görüşü, editöre mektup ve eğitim amaçlı diğer bilimsel yazılar da kabul edilmektedir. Yayın dili Türkçe olan ve kapsamlı Ingilizce özet kısmı içeren Mikrobiyoloji Bülteni, bağımsız, önyargısız ve çift-kör hakemlik (peer-review) ilkele-rine dayanan bir dergidir. Mikrobiyoloji Bülteni’nin hedef kit-lesi, tıbbi/klinik mikrobiyoloji uzmanları, enfeksiyon hastalıkları uzmanları, halk sağlığı uzmanları ve ilgili konularda uzmanlık eğitimi alan araştırıcılardır.

Mikrobiyoloji Bülteni, SCIENCE CITATION INDEX EXPANDED, CLARIVATE ANALYTICS, MEDLINE/PUBMED, SCOPUS, EMBASE, RESEARCHGATE, GENAMICS, TÜRKİYE ATIF DİZİNİ ve TÜBİTAK ULAKBIM veri tabanlarında dizinlenmektedir.

Mikrobiyoloji Bülteni’nin yayınlanmış tüm sayılarına www.mikrobiyolbul.org sitesinden serbest olarak erişilebilir.

Abone İşlemleri

Mikrobiyoloji Bülteni, birçok sağlık kuruluşuna ve üniversite kü-tüphanelerine ücretsiz olarak gönderilmektedir. Dergiye abone olmak isteyenler, editöre başvurmalıdır.

Editör : Prof. Dr. Özgen Eser

Adres : Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi,

Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Sıhhiye 06100, Ankara

E-posta : ankara.mikrobiyoloji@gmail.com

Web sitesi : www.ankaramikrobiyoloji.org.tr

Aidatlar için banka bilgileri:

Banka adı : Yapı Kredi Bankası, Hacettepe Şb., Ankara

Hesap adı : Ankara Mikrobiyoloji Derneği

IBAN No : TR06 0006 701 00000007 1095946

Baskı İzinleri ve Reklam

Baskı izinleri için başvurular Editöre yapılmalıdır. Ancak Ankara Mikrobiyoloji Derneği, kanunen “Kamu Yararına Dernek” kap-samında olduğundan reklam alamamaktadır.

Yazarlara Bilgi

Yazarlara Bilgi kısmına dergi sayfalarından ve www.ankaramik-robiyoloji.org.tr adresinden ulaşılabilir.

Materyal Sorumluluk Reddi

Mikrobiyoloji Bülteni’nde yayımlanan tüm yazılardaki görüş ve raporlar yazar(lar)ın görüşü olup yayın sahibi, editör, yayın kurulu ya da yayımcının görüşü değildir. Ankara Mikrobiyoloji Derneği, yayın sahibi, editör, yayın kurulu ya da yayımcı bu ya-zılar için herhangi bir sorumluluk kabul etmemektedir.

Dergimizde asitsiz kağıt kullanılmaktadır.

Bulletin of Microbiology is the scientific official publication of Ankara Microbiology Society. It is published quarterly in January, April, July and October. The aim of Bulletin of Mic-robiology is to publish high quality scientific research articles on the subjects of medical and clinical microbiology. In addi-tion, review articles, short communications and reports, case reports, editorials, letters to editor and other training-oriented scientific materials are also accepted. Publishing language is Turkish with a comprehensive English abstract. The editori-al policy of the journeditori-al is based on independent, unbiased, and double-blinded peer-review. Specialists of medical and/ or clinical microbiology, infectious disease and public health, and clinicians and researchers who are training and interes-ting with those subjects, are the target groups of Bulletin of Microbiology.

Bulletin of Microbiology is indexed in SCIENCE CITATION IN-DEX EXPANDED, CLARIVATE ANALYTICS, MEDLINE/PUBMED, SCOPUS, EMBASE, RESEARCHGATE, GENAMICS, TURKIYE CITATION INDEX and TUBITAK ULAKBIM TR INDEX databases. Al of the published issues of Microbiology Bulletin are open accessed at www.mikrobiyolbul.org web site.

Subscription Information

Bulletin of Microbiology is sent free of charge to many health care centers and university libraries. Those who demand to subscribe to the journal should contact with the editor.

Editor : Prof. Dr. Özgen Eser

Address : Hacettepe University Faculty of Medicine,

Department of Medical Microbiology, Sihhiye 06100, Ankara, Turkey

E-mail : ankara.mikrobiyoloji@gmail.com

Web site : www.ankaramikrobiyoloji.org.tr

Permissions and Advertisements

Applications for print permissions should be submitted to the editor. However, advertisements could not be accepted since Ankara Microbiology Society is a public weal society according to the law.

Instructions for Authors

Instructions for authors are published in the journal pages and could be accessed at: www.ankaramikrobiyoloji.org.tr

Material Disclaimer

Statements or opinions expressed in the manuscripts pub-lished in Bulletin of Microbiology reflect the views of the author(s) and not the opinions of the publication owner, edi-tor, editorial board and the publisher. Ankara Microbiology Society, the publication owner, the editor, the editorial board and the publisher disclaim any responsibility or liability for such materials.

The journal is printed on acid-free paper.

MİKROBİYOLOJİ BÜLTENİ / BULLETIN OF MICROBIOLOGY

ISSN: 0374-9096

e-ISSN: 2667-2994

Özgün Çalışmalar

• Kaynak Onurdağ F, Kayış U, Ökten S: Acinetobacter baumannii İzolatlarında Fenilalanin-arjinin-beta-naftilamidin Siprofloksasinin Minimal İnhibitör Konsantrasyon Değerleri ve Dışa Atım Pompası Genlerinin Ekspresyonu Üzerine Etkisi . . . .285 • Erdem HA, Şanlıdağ G, Çınar E, Yaşar M, Pullukçu H, Taşbakan MS,

Çavuşoğlu C, Gökengin D, Işıkgöz Taşbakan M: Dost mu Düşman mı?

COVID-19 Enfeksiyonu Tanılı Hastalarda BCG Aşısı ve

Latent Tüberküloz Enfeksiyonu Etkisinin Değerlendirilmesi . . . .300 • Demir AB, Bulgurcu A, Appak Ö, Sayıner AA: Türkiye’den Bildirilen Sars-CoV-2

İzolatlarında RT-PCR Primer/Prob Bağlanma Bölgelerindeki Nükleotit Değişimlerinin Analizi . . . .311 • Karaşahin Ö, Karaşahin EF: Kırım Kongo Kanamalı Ateşi Hastalarında

Kanama Risk Skoru . . . .327 • Özdemir YE, Balkan İİ, Bayramlar OF, Alkan S, Murt A, Karaali R, Mete B,

Kuşkucu MA, Aygün G, Keskindemirci Y, Öngören Ş, Kutlubay Z, Çetinkale O, Saltoğlu N, Tabak F: Hafif-Orta Klinik Seyirli COVID-19 Hastalarının

Genel Özellikleri ve Pnömoni Gelişimi için Risk Faktörleri . . . .342 • Gümüş HH, Demiroğlu YZ, Alışkan HE, Ödemiş İ, Ceylan Ö, Poçan AG, Karagün Ö:

COVID-19 Pandemisinde Sağlık Çalışanlarının Antikor Taraması ve

Risk Değerlendirmesi . . . .357 • Koç Kuralay Z, Tuğ E, Fidan I: Kronik Hepatit B veya C Hastalarında IL28B

Polimorfizmleri ve Plazma IL28B Düzeyleri Arasındaki İlişkinin Araştırılması . . . .374 • Maral I, Yaylalı E, Güçlü H, İkiışık H, Güner AE: COVID-19 Salgınının Kontrolünde

İlaç Dışı Tedbirlerden Temas Sayısını Azaltmaya Yönelik Kısıtlamaların Etkinliğinin

Değerlendirilmesi: R₀ Hesaplaması ve Modelleme Çalışması ile İstanbul Örneği . . . .389

• Biriken D, Arıbal Ayral P, Yazıhan N: Vitamin D3’ün Monositlerin

İmmün Yanıtı Üzerindeki Rolü . . . .406 • Çetin Duran A, Barut K, Duran A, Eren Dağlar D: Anti-Dense Fine Speckled 70

(anti-DFS70) Otoantikorunun Klinik Öneminin Araştırılması ve

Eşlik Eden Patolojilerin Belirlenmesi . . . .415

Kısa Bildiriler

• Şahin E, Sarzhanova S, Çuhadar Uysal B, Yıldız Ş, Hızel K, Özkan S,

Fidan I, Bozdayı G: HIV Pozitifliği Gerçek Zamanlı RT-PCR ile

Takip Edilen Hastaların HTLV-I/II Seroprevalansının Araştırılması . . . .426 • Gülbudak H, Karvar Ş, Soydan G, Tezcan Ülger S, Kandemir Ö, Tamer L,

Altunkan AA, Özdemir AA, Aslan G: Semptomatik ve Asemptomatik COVID-19

Hastalarında Gerçek Zamanlı PCR Döngü Eşik Değerlerinin Karşılaştırılması . . . .435

Olgu Sunumları

• Büyüktuna SA, Hasbek M, Öksüz C, Baysal C, Öz M, Elaldı N, Bakır M: Kırım Kongo Kanamalı Ateşi Hastasında COVID-19 Ko-enfeksiyonu: Bir Olgu Sunumu . . . .445 • Kömeç S, Karabıçak N, Ceylan AN, Gülmez A, Özalp O:

Türkiye İstanbul’dan Bildirilen Üç Candida auris Olgusu . . . .452

Editöre Mektup

• Kipritci Z, Keskin AÜ, Ciragil P, Topkaya AE: SARS-CoV-2 Virüs Tespitinde

Görsel Okunan Hızlı Antijen Test Kitinin (SGA V-Chek) Değerlendirilmesi . . . .461

MİKROBİYOLOJİ BÜLTENİ

Original Articles

• Kaynak Onurdağ F, Kayış U, Ökten S: Effect of Phenylalanine-arginine-beta-naphthylamide to Ciprofloxacin Minimum Inhibitory Concentration Values and

Expression of Efflux Pump System Genes in Acinetobacter baumannii Isolates . . . .285 • Erdem HA, Şanlıdağ G, Çınar E, Yaşar M, Pullukçu H, Taşbakan MS,

Çavuşoğlu C, Gökengin D, Işıkgöz Taşbakan M: Friend or Foe? Evaluation of

BCG Vaccine and Latent Tuberculosis Infection Effect in Patients Diagnosed with

COVID-19 Infection . . . .300 • Demir AB, Bulgurcu A, Appak Ö, Sayıner AA: Analysis of Nucleotide Changes in

RT-PCR Primer/Probe Binding Regions in SARS-CoV-2 Isolates Reported from Turkey . . . .311 • Karaşahin Ö, Karaşahin EF: Bleeding Risk Score in Patients with Crimean-Congo

Hemorrhagic Fever . . . .327 • Özdemir YE, Balkan İİ, Bayramlar OF, Alkan S, Murt A, Karaali R, Mete B,

Kuşkucu MA, Aygün G, Keskindemirci Y, Öngören Ş, Kutlubay Z, Çetinkale O, Saltoğlu N, Tabak F: Clinical Characteristics of Mild-Moderate COVID-19

Patients and Risk Factors for the Development of Pneumonia . . . .342 • Gümüş HH, Demiroğlu YZ, Alışkan HE, Ödemiş İ, Ceylan Ö, Poçan AG, Karagün Ö:

Antibody Screening and Risk Assessment of Healthcare Professionals in the

COVID-19 Pandemic . . . .357 • Koç Kuralay Z, Tuğ E, Fidan I: Investigation of the Relationship Between IL28B

Polymorphisms and Plasma IL28B Levels in Patients with Chronic Hepatitis B or C . . . .374 • Maral I, Yaylalı E, Güçlü H, İkiışık H, Güner AE: Evaluation of Non-Pharmaceutical

Interventions for Reducing Contact Rate in COVID-19 Pandemic: R₀ Estimation and

Modeling for Istanbul . . . .389 • Biriken D, Arıbal Ayral P, Yazıhan N: The Role of Vitamin D3 on the

Immune Responses of Monocytes . . . .406 • Çetin Duran A, Barut K, Duran A, Eren Dağlar D: Investigation of the

Clinical Significance of Anti-Dense Fine Speckled 70 (anti-DFS70) Autoantibody and Determination of Accompanying Pathologies . . . .415

Short Communications

• Şahin E, Sarzhanova S, Çuhadar Uysal B, Yıldız Ş, Hızel K, Özkan S,

Fidan I, Bozdayı G: Investigation of HTLV-I/II Seroprevalance of Patients with

HIV Positivity being Monitored by Real-Time RT-PCR . . . .426 • Gülbudak H, Karvar Ş, Soydan G, Tezcan Ülger S, Kandemir Ö, Tamer L,

Altunkan AA, Özdemir AA, Aslan G: Comparison of Real Time PCR Cycle

Threshold Values in Symptomatic and Asymptomatic COVID-19 Patients . . . .435

Case Reports

• Büyüktuna SA, Hasbek M, Öksüz C, Baysal C, Öz M, Elaldı N, Bakır M: COVID-19 Co-infection in a patient with Crimean Congo Hemorrhagic Fever:

A Case Report . . . .445 • Kömeç S, Karabıçak N, Ceylan AN, Gülmez A, Özalp O:

Three Candida auris Case Reports from Istanbul, Turkey . . . .452

Letter to the Editor

• Kipritci Z, Keskin AÜ, Ciragil P, Topkaya AE: Evaluation of a Visually-Read Rapid Antigen Test Kit (SGA V-Chek) for Detection of SARS-CoV-2 Virus . . . .461

BULLETIN OF MICROBIOLOGY